南京大学教育研究院是在教育科学与管理系的基础上于2009年11月18日建立的，为学校组成院系之一。现设有高等教育研究所、网络化学习与管理研究所、心理健康研究所、高等教育联合研究所等，并主办《高教研究与探索》季刊。拥有高等教育学和教育博士专业学位（Ed.D.）2个博士点，系我国首批教育博士培养单位；拥有教育学一级学科硕士学位授权点，和高等教育学、课程与教学论、教育技术学、教育经济与管理4个硕士点，前3个硕士点授教育学硕士学位，后者授管理学硕士学位。开办有教育技术学（数字媒体与知识工程方向）本科专业。我院师资阵容整齐，现有教授9名，博士生导师7名，国家级教学名师1名，八成以上的教师拥有博士学位。