管理科学与工程是综合运用系统科学、管理科学、数学、经济和行为科学及工程方法，结合信息技术研究解决社会、经济、工程等方面的管理问题的一门学科。

　　南京大学管理科学与工程研究院现下设管理科学研究所、管理工程研究所（物流工程研究中心）、金融工程研究所、

　　系统与控制工程研究所（企业管理-控制综合自动化实验中心）以及演化与实验经济学研究中心。研究院现有教授8人，副教授6人。获得博士学位的教师占教师总数90%以上。

　　研究院在研科研项目共48项，其中，国家自然科学和社会科学基金共8项，省级重点课题8项，企业项目32余项，在研科研经费达一千多万。

　　研究院主要培养硕士研究生以上的高层次人才，现有硕士研究生30多名，博士研究生20多名和9名博士后研究人员。

　　研究院争取经过若干年的努力，发展成为国内管理科学与工程学界具有自身学术特色和学术影响力的一流研究基地、适应市场经济建设需要的管理科学与工程领域高层次人才培养基地、密切联系中国改革和发展的实际，为国家和地方经济建设做出直接和较突出贡献的服务基地。

　　研究院近期主攻方向有：管理系统的复杂性研究、社会经济的演化理论研究和实验分析、不对称信息的理论研究及战略思考、金融工程与资本市场行为研究、物流管理理论与系统开发研究、企业管理-控制综合一体化研究。

　　研究院在强调自身发展的同时，还加强了与外界的交流与合作，先后派遣部分教师到加拿大和香港进行进修、访问，与美国、新加坡和香港等大学建立了密切的学术联系与合作关系