姓名：骈聪
职称：副教授，硕士生导师
电话：(86)-18260080882 (86)-17357142915
邮箱：piancong@njau.edu.cn, piancong@zju.edu.cn.个人主页：www.pianlab.cn.

工作经历：
2019.09-至今 南京农业大学 生物信息学 副教授
2017.10-2019.10 香港中文大学统计系 生物统计 香江学者 导师：樊晓丹
2016.08-2017.10 浙江大学农业与生物技术学院 生物信息学 博士后 导师：李飞
教育背景：
2011.09-2016.06 南京农业大学农学院 生物信息学 理学博士 导师：张良云
2006.09-2010.07 西北民族大学数学与计算机科学学院 信息与计算科学 理学学士

个人简介
骈聪，副教授，硕士生导师，南京农业大学高层次人才引进，香江学者，浙江大学农业与生物技术学院博士后。主要从事差异甲基化区域的算法开发，机器学习算法在生物信息中的应用，以及非编码 RNA
与表观遗传相关性的研究。目前获得南京农业大学高层次人才引进经费资助（100 万）香江学者计划资助（60 万）和浙江省博士后资助（3 万）和各 1 项，近年来以第一作者或通讯作者身份在
Bioinformatics (IF5=9.853), Briefings in bioinformatics (IF5 = 7.468), Molecular Therapy-Nucleic
Acids (IF5 = 6.814), PloS Computational Biology (IF5 = 5.260), BMC bioinformatics (IF5= 3.213),
等学术期刊发表 SCI 论文 12 篇。

主要科研成绩研究领域
1. 基于机器学习与深度学习理论对非编码 RNA，mRNA, DNA 水平和RNA 水平的甲基化位点进行预测。
2. 基于矩阵分解和扰动理论构建肿瘤 miRNA-mRNA 和 miRNA-lncRNA 调控网络，预测潜在的 Network biomarker, 进而对肿瘤进行有效的分型和预后分析。
3. 结合贝叶斯理论框架和生成模型准确定位差异甲基化区域。
4. 基于图卷积网络(GCN)的框架结合 KEGG 和PPI 网络提高单细胞数据的质量。 5．开发 miRNA，LncRNA，circRNA 等非编码RNA 的功能注释工具。
发表文章情况(#和*代表一作与通讯)
(1) Jiali Yang, Kun Lang, Guangle Zhang, Xiaodan Fan, Yuanyuan Chen, Cong
Pian*. SOMM4mC: a second-order Markov model for DNA N4-methylcytosine site prediction in six
species. Bioinformatics, 2020, 10.1093/bioinformatics/btaa507. (IF5=9.853, Top 期刊，JCR
1 区) Web tool：http://www.insect-genome.com/SOMM4mC/.
(2) Zutan Li, Hangjin Jiang, Lingpeng Kong, Yuanyuan Chen, Xiaodan Fan, Liangyun Zhang*, Cong
Pian*. Deep6mA: a deep learning framework for exploring similar patterns in DNA N6- methyladenine
sites across different species. PLoS Computational Biology, 2020, (Minor

revised) (IF5=5.260, Top 期 刊 ， JCR 1 区 ) Web tool
：
http://www.pianlab.cn/deep6ma/about.html.
(3) Cong Pian, Guangle Zhang, Fei Li*, Xiaodan Fan*. MM-6mAPred: Identifying DNA
N6-methyladenine sites based on Markov Model. Bioinformatics, 2020, 36(2):388-392.
(IF5=9.853, Top 期刊， JCR 1 区). Web tool ： http://www.insect-genome.com/MM- 6mAPred/.
(4) Cong Pian, Guangle Zhang, Libin Gao, Xiaodan Fan*, Fei Li*. miR+Pathway: The
integration and visualization of miRNA and KEGG pathways. Briefings in bioinformatics, 2018,
bby128. (IF5 = 7.468, Top 期刊， JCR 1 区). Web tool ： http://www.insect-
genome.com/miR-pathway.
(5) Cong Pian, Shanjun Mao, Guangle Zhang, Jin Du, Fei Li, Suet Yi Leung, Xiaodan
Fan*. Discovering Cancer-related miRNAs from miRNA-target Interactions by Support Vector
Machines. Molecular Therapy-Nucleic Acids, 2020, 19:1423-1433. (IF5 = 6.814，JCR 1 区)
(6) Cong Pian, Guangle Zhang, Sanling Wu, Fei Li*. Discovering the ‘Dark matters’ in
expression data of miRNA based on the miRNA-mRNA and miRNA-lncRNA networks.
BMC Bioinformatics, 2018, 19:379. (IF5 = 3.213，JCR 1 区).
(7) Ke Zhu#, Cong Pian#, Qiong Xiang, Xin Liu, Yuanyuan Chen* Personalized analysis of breast
cancer using individual-level networks. PeerJ. 2020, accepted,
(IF5=2.810, JCR 2 区)
(8) Cong Pian, Guangle Zhang, Fei Li*. LncCeRBase a database of experimentally validated human
competing endogenous long non-coding RNAs. Database, 2018. bay061. (IF5 = 3.660，JCR 1 区). Web
tool: http://www.insect-genome.com/LncCeRBase/front/.
(9) Cong Pian, Guangle Zhang, Zhi Chen, Yuanyuan Chen, Jin Zhang, Tao Yang, Liangyun
Zhang*. LncRNApred: classification of long non-coding RNAs and protein coding
transcripts by the ensemble algorithm with a new hybrid feature. PLoS One, 2016, 11(5): e0154567.
(IF5 = 3.226，JCR 2 区).
(10) Cong Pian, Jin Zhang, Yuanyuan Chen, Zhi Chen, Qin Li, Qiang Li, Liangyun Zhang*.
OP-Triplet-ELM: identification of real and pseudo microRNA precursors using extreme learning
machine with optimal features. Journal of Bioinformatics and Computational
Biology, 2016, 14: 1650006. (IF5 = 0.997，JCR 4 区).
(11) Cong Pian, Yuanyuan Chen, Jin Zhang, Zhi Chen, Guangle Zhang, Qiang Li, Liangyun Zhang*.
V-ELMpiRNAPred: identification of human piRNAs by voting based extreme learning machine. Journal of
Bioinformatics and Computational Biology, 2017,
15:1650046. (IF5 = 0.997，JCR 4 区).
(12) Guangle Zhang#, Cong Pian#, Zhi Chen, Yuanyuan Chen, Jin Zhang, Tao Yang, Liangyun Zhang*.
Identification of cancer-related miRNA-lncRNA biomarkers using a basic
miRNA-lncRNA network. PLoS One, 2018, 13(5): e0196681 (共同一作). (IF5 = 3.226，JCR
2 区).
(13) Xiaoyu Zhao, Jin Zhang, YY Chen, Qiang Li, Tao Yang, Cong Pian, Liangyun Zhang.
Promoter recognition based on the maximum entropy hidden Markov model. Computers in Biology and
Medicine. 2014, 51:73-81. (IF5 = 2.905，JCR 2 区).
(14) 张文#, 骈聪#, 陈园园, 张瑾, 李琴, 张良云. 基于粒子群优化的支持向量机算法识别真
核生物基因的 RNA 聚合酶Ⅱ启动子序列. 生物物理学报. 2015, 31(2): 143-153. (共同一作)

主持或参加科研项目（课题）
1. 南京农业大学高层次人才科研启动经费 100 万元。
2. 浙江省自然科学基金委，重点项目，Z18C60003，miR+信号通路的整合与数据挖掘，2018- 01 至 2021-01，40 万元，在研，参加（第一主要参与人）。
3. 浙江省博士后，浙江省博士后科研项目择优资助，517000-X81701，基于 RNA-Seq 数据的 lncRNA 与癌症关系的研究，2018-01 至 2019-01，3
万元，结题，主持。
4. 中国博士后，香江学者计划，188020-170257701/024，胃癌基因组学与发展: 以病人活组织培养三维类器官细胞团作整合性基因组分析、药物敏感测定、细胞生物学及动物模型研究，
2017-10 至 2019-10，60 万元，结题，主持。
5. 国家自然科学基金委员会，面上项目，11571173，弱乘子（Hom-）Hopf 代数上 Galois理论与同调理论研究，2016-01 至 2019-12，65 万，结题，参与。
6. 江苏省自然科学基金委，面上项目，BK20141358，弱 Hopf 代数上的结构和表示及同调维数研究，2014-07 至 2017-06，10 万，结题，参与。
获得奖项
2007: 国家奖学金
2008: 国家励志奖学金
2009: 全国大学生数学建模竞赛一等奖
2012: 华为杯研究生数学建模三等奖
2017: 香江学者
主要学术兼职
2018 和 2019 年被 Briefings in bioinformatics，Cancer Medicine, Cell Proliferation，Journal of
Biomedical and Health Informatics 杂志邀请作为审稿人。