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南京农业大学理学院导师教师师资介绍简介-万群
/2021-03-27
万群/教授
院 系 物理系 性 别 男
出 生 年 月 1973.5 学 位 理学博士
学 历 博士 毕 业 院 校 美国佛蒙特大学职 称 教授 研 究 方 向 蛋白质结构与功能职
务 办 公 地 点 教四楼 606
电 话 电 子 邮 箱 qunwan@njau.edu.cn
个人简介
万群,南京农业大学理学院教授、博士生导师(物理系生物物理方向和化学系天然药物化学方向)。2008
年博士毕业于美国佛蒙特大学分子生理与生物物理专业,曾在美国能源部橡树岭国家实验室、美国凯斯西储大学药理系从事博士后的研究工作,后在上海美迪西生物制药有限公司担任药物开发部主任,2015
年作为高层次人才引进到南京农业大学理学院工作,目前是生物物理学科点的点长,博士生导师。在 PNAS、ACS Catalysis、Structure、JBC、 JMB 等杂志发表多篇论文。为
J.Struct Biol,、Acta Cryst Sect D、Plons One、Sci Rep等 SCI 杂志审稿人。
研究方向:
? 酶催化反应机理和蛋白质工程的研究:应用结构生物学(X-光衍射和中子衍射)和热动力学等多种方法研究酶蛋白的催化机理,改造相关蛋白并应用于生物能源、食品和制药等领域。
? 针对靶向蛋白结构的分子设计:通过Sybyl进行虚拟筛选和直接得到晶体结构这两种方式相结合来研究靶向蛋白与配体小分子的相互作用,筛选和改造现有小分子,提高其特异性和亲和力。
欢迎报考博士和硕士研究生:
(1)生物物理方向(物理系),硕士研究生考试科目:英语、政治、化学综合(包括有机和无机化学)或数学、生物化学或物理
(2)天然产物化学方向(化学系),硕士研究生考试科目:英语、政治、无机和分析化学、有机化学
教学信息
实用蛋白质晶体机构与功能(研究生课程),生物物理(研究生课程),蛋白质结构与功能(本科生选修课)、大学物理,大学物理实验;
科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目,应用中子衍射研究二氢叶酸还原酶的催化机理及抑制剂茶多酚的理性改造,2021-2024,项目编号:32071264
2. 国家自然科学基金面上项目,木聚糖酶催化反应机理的研究及耐酸碱突变体的设计,负责人 万群,2017-2020,项目编号:31670790;
3. 江苏省自然科学基金面上项目,应用中子衍射技术研究糖苷水解酶的催化反应机理,负责人,万群,2016-2019,项目编号:BK20161443;
4. 天然药物活性组分与药效国家重点实验室开放基金,作为二氢叶酸还原酶抑制剂的茶多酚的改性研究,负责人 万群,2016-2017,项目编号:3144060008;
5. 中央高校科研基本业务费重大专项,基于生物源活性分子先导的新农药创制——合理设计、合成、生物活性与作用机制研究,参加,2016-2019,项目编号:KYTZ201604;
所获奖项
2016 年江苏省六大人才高峰项目资助;
2018 年江苏省青蓝工程中青年学术带头人;
2020 年钟山学者学术骨干
社会兼职
江苏省物理协会理事;
江苏省细胞及发育协会理事;
发表文章
1. Zhao, G., Yu, X., Lou, W., Wei, S., Wang, R., Wan, Q., Shen, W.*, Transgenic Arabidopsis
overexpressing MsSNAT enhances salt tolerance via the increase in autophagy, and the
reestablishment of redox and ion homeostasis, Environmental and Experimental Botany, 2019,
164:20-28. (SCI IF: 3.7)
2. Li, Z., Zhang X, Wang, Q., Li, C., Zhang, N., Zhang, X., Xu, B., Ma, B., Schrader, T.E.,
Coates, L., Kovalevsky, A., Huang, Y.,* Wan, Q.*, Understanding the pH-Dependent Reaction Mechanism
of a glycoside hydrolase using high-resolution X-ray and neutron crystallography. ACS Catalysis,
2018, 8(9), 8058-8068. (SCI IF: 11.4)
3. Wan Q., Parks J.M., Hanson B.L., Fisher S.Z., Ostermann A., Schrader T.E., Graham D., Coates
L., Langan P., Kovalevsky, A. Direct determination of protonation states and visualization of
hydrogen bonding in a glycoside hydrolase
with neutron crystallography. Proc Natl Acad Sci USA, 2015, 112(40): 12384-12389. (SCI IF: 9.6)
4. Wan Q., Bennett C.B.,Wilson A.W., Kovalevsky A., Langan P., Howell E., Dealwis C.G. Toward
resolving the catalytic mechanism of dihydrofolate reductase using neutron and ultrahigh resolution
X-ray crystallography. Proc Natl Acad Sci USA, 2014, 111(51):18225-18230. (SCI IF: 9.8)
5. Wan Q., Zhang Q., Hamilton-Brehm S., Weiss K., Mustyakimov M., Graham D., Coates L., Langan
P., Graham D. and Kovalevsky A. X-ray crystallographic studies of family 11 xylanase Michaelis and
product complexes: implications for the catalytic mechanism. Acta Cryst D, 2014, 70:11-23. (SCI IF:
7.2)
6. Wan Q, Kovalevsky A., Wilson A.W., Bennett C.B., Langan P., Dealwis C.G. Preliminary joint
X-ray and neutron protein crystallographic studies of ecDHFR complexed with folate and NADP+, Acta
Cryst F, 2014, 70:814-818 (SCI IF: 0.6)
7. Wan Q, Kovalevsky A. , Zhang Q., Hamilton-Brehm S., Upton R., Weiss K., Mustyakimov
M., Graham D., Coates L., Langan P. Heterologous expression, purification, crystallization
and preliminary X-ray analysis of Trichoderma reesei Xylanase II and four variants. Acta Cryst F,
2013, 69:320-323. (SCI IF: 0.6)
8. Wan Q., Ahmad M. F., Fairman J., Gorzelle B., Fuente M., Dealwis C. G., Maguire M. X-ray
Crystallography and Isothermal Titration Calorimetry Studies of Salmonella Znic Transporter ZntB.
Structure. 2011, 19(5):700-710. (SCI IF: 6.3)
9. Miyagi M., Wan, Q.(并列第一作者), Ahmad M. F., Gokulrangan G., Tomechko S. E., Bennett B., Dealwis
C. G. Histidine Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry for Probing the Microenvironment of
Histidine Residues in Dihydrofolate Reductase. PLoS One. 2011, 6(2): e17055. (SCI IF: 4.3)
10. Bennett B. C., Wan Q.(并列第一作者), Ahmad M. F., Dealwis C. G. X-ray structure of the ternary
MTX·NADPH complex of the anthrax dihydrofolate reductase: A pharmacophore for dual-site inhibitor
design. J. Struct. Biol , 2009, 166(2): 162-171 (SCI IF: 3.7)
11. Ahmad M. F., Wan Q. (并列第一作者), Jha, S., Motea, E., Berdis, A., Dealwis
C.G. Evaluating the Therapeutic Potential of a Non-Natural Nucleotide that Inhibits Human
Ribonucleotide Reductase. Molecular Cancer Therapeutics. 2012, 11(10):2077-2086 (SCI IF: 5.1)
12. Wijerathna, S.R., Ahmad M. F., Xu, H., Fairman J, Zhang, J., Kaushal, P.S., Wan, Q., Kiser,
J.Y., and Dealwis, C.G. Targeting the Large Subunit of Human Ribonucleotide Reductase for Cancer
Chemotherapy. Pharmaceuticals. 2011, 4(10), 1328-1354. (SCI IF: 3.2)
13. Ahmad M.F., Kaushal P.S., Wan Q., Wijerathna S.R., An X., Huang M., Dealwis
C.G. Role of Arginine 293 and Glutamine 288 in Communication between
Catalytic and Allosteric Sites in Yeast Ribonucleotide Reductase. J. Mol. Biol
2012, 419(5): 315-29. (SCI IF: 4.1)
14. Nair U. B, Joel P. B, Wan Q., Lowey S., Rould M. A, Trybus K. M. Crystal Structures of
Monomeric Actin bound to Cytochalasin D. J. Mol. Biol., 2008, 384(4):848-864. (SCI IF: 4.1)
15. Rould M. A., Wan Q., Joel P. B, Lowey S., Trybus K. M. Crystal structures of expressed
non-polymerizable monomeric actin in the ADP and ATP states. J. Biol. Chem., 2006, 281(42):
31909-31919 (SCI IF: 5.8)
16. 万群、孟浩、卜平、曹淑芬,Ser203 在大鼠脑驱动蛋白水解ATP 中重要作用的晶体学分析,中国生物化学与分子生物学报,2015,31(1):96-102
17. 万群、孟浩、祝娉婷、高亚雄、卜平,中子与X- 光衍射相结合解析木聚糖酶突变体N44D 晶体结构,中国生物化学与分子生物学报,2014,30(12):1223-1230
18. 万群、祝娉婷、吕后宁、陈欣虹,鼠脑驱动蛋白ATP水解机制的晶体学分析,生物工程学报,2014,30(4):644?657
19. 万群、祝娉婷、吕后宁、陈欣虹,鼠脑驱动蛋白的表达、纯化和结晶,生物工程学报,2014,30(3):485-491
20. 万群、陈欣虹,晶胞接种法在肌动蛋白和木聚糖酶结晶中的应用,中国生物化学与分子生物学报,2014,30(1):101-107。
21. 万群,魏东芝,袁勤生;DNA芯片技术。生命的化学,1999,19(2):83-88
22. 万群,魏东芝,袁勤生;以乌桕脂生产类可可脂的产物分离提纯的研究。中国油脂,
1999,24:56-59.
23. 赵旭东,魏东芝,万群,俞俊棠;谷胱甘肽的简便测定法。药物分析杂志,2000,
20(1),34-37.