个人简介
杨清，男，留法博士，2000年江苏省政府海外引进人才, 南京农业大学教授、博士生导师，中国作物学会马铃薯专业委员会委员、第七届专业委员会理事，国家马铃薯产业科技创新联盟理事，国家科学技术奖励评委。
此外，还兼任教育部科技奖励评审专家，教育部博士后与回国留学人员及博士点基金、国家自然科学基金评审专家、安徽省科技厅和自然科学基金评审专家，江苏省教育厅科技专家、江苏省科技厅科技专家、北京市科技项目评审专家、江西省科技厅科技评审专家、福建省科技厅科技项目评审专家、重庆市科委项目评审专家、中国农业科学院学位论文评审专家，中国留法人员农业学会副理事长(中国区负责人,2015-2018),Plant Biotechnology J, New Phytologist, PLOS ONE 和PMBR审稿人，作物学报、园艺学报、西北植物学报审稿人，中国科技论文在线评审专家，国家梨产业技术体系分子育种组成员。
长期从事马铃薯研究，主持和参与国家基金委、教育部、科技部、外专局和省科技厅课题18项,财政部实验室修缮项目1项，省教育厅研究生优秀课程1项，省研究生创新工程项目2项，大学生国家创新实践项目3项，校SRT项目8项。 在The Plant Journal、PCE、Molecular Plant、Genetics、Plos ONE、PMB、Plant Mol Bio Rep、PCTOC、TAG、JIPB、Plant Science、BMC Genetics, Frontier Plant Sci等国内外学术刊物上发表论文160余篇, 获得授权国家发明专利3项。培养研究生97名。
媒体报道/MEDIA NEWS
中国新闻社: http://www.chinanews.com/cj/2016/03-22/**.shtml
扬子晚报: http://www.yangtse.com/jiaoyu/2016-03-21/829839.html
江苏科技报：http://www.jskjb.com/html/dv_.aspx
金陵晚报: http://jlwb.njnews.cn/jlwb/html/2016-03/07/content_30589.htm
中国侨网: http://www.chinaqw.com/jjkj/2016/03-23/83170.shtml
土豆实验室：https://baike.baidu.com/item/土豆实验室/**?fr=aladdin
主要学历/EDUCATION
1986.1-1989.1: 法国雷恩国立农业大学(ENSAR)植物科学系,植物生物工程专业博士;
1984.2-1985.12: 法国雷恩国立农业大学农学系,植物遗传改良专业硕士;
1978.2-1982.3: 南京农学院园艺系,蔬菜专业学士。
工作经历/PROFESSIONAL EXPERIENCE
2002年至今在生命科学学院工作;
2000-02年，在南京农业大学生物科技学院工作，任****、博士生导师、研究生分子生物学实验室主任，副院长;
1998-2000年, 在加拿大蒙特利尔大学(University of Montreal)植物生物学研究所(IRBV)工作、研究科学家;
1992-97年, 在加拿大魁北克大学蒙特利尔分校(UQAM), 博士后、研究科学家;
1989-91年, 在法国国家农业研究院(INRA)雷恩研究中心做博士后研究;
1982-83年, 南京农学院园艺系工作，助教。

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教学情况
著作/BOOK
主编“分子生物学与基因工程实验技术”，全国高等农林院校生物科学类专业十二五规划系列教材，中国农业大学出版社, 2014。
教学/TEACHING
校级研究生分子生物学实验室筹建：2000年，受学校的委托，负责筹建研究生分子生物学教学实验室。2001年，实验室建成并投入使用，成为全校生命学科研究生分子生物学技能培训基地。
学科建设：作为分子生物学学科创建者之一，主持研究生分子生物学专业教学工作，编写分子生物学核心课程教学大纲，教授现代分子生物学（硕士研究生）、分子生物学研究进展（博士研究生）和分子生物学研究方法（硕士和博士研究生实验课程）；创建研究生细胞生物学专业，编写分子细胞生物学课程教学大纲，教授分子细胞生物学课程，并率先在该专业招收研究生（硕士和博士）。
主讲课程:
1. 现代分子生物学(硕士/博士, 面向全校生物学科，2001-2012, 获校级(2011)优秀研究生课程)；
2. 分子生物学研究方法/分子生物学实验技术(硕士/博士, 面向全校生物学科，2001年至今, 2005年校级研究生重点建设课程)；
3. 细胞生物学研究技术(硕士, 参与教学, 2012年至今）；
4. 分子生物学研究进展(博士生, 面向全校生物学科，2007-2012)；
5. 分子细胞生物学(硕士/博士, 面向全校生物学科，2001-2012，省级(2012)优秀研究生课程)；
6. 细胞工程(本科, 2004年至今)。
研究生培养/POSTGRADUATE SUPERVISION
研究生招生与培养：招生专业包括：1）分子生物学专业，2）细胞生物学专业。率先在细胞生物学专业招收研究生（第一个硕士和博士研究生）。至今为止，培养博士24名、硕士73名(16名毕业生有高级职称，包括副高9人和正高8人，其中在大学任教授的有：郝岗平，泰山医学院教授；张松贺，河海大学教授；卢其能，宜春学院教授；邹华文，长江大学教授；史仁玖，泰山医学院教授；梁峰，商丘师范学院教授；乔枫，青海师范大学教授；谢彦杰，南京农业大学教授)。
本科生科研培训：自2011年起，累计接收和培训SRT学生36名。

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科研情况
研究领域/AREAS OF RESEARCH
植物分子生物学研究：
-功能基因组学
-基因工程
马铃薯研究：
-马铃薯块茎分化与发育调控的分子基础
-马铃薯花色苷代谢、遗传与基因工程
-马铃薯抗病虫基因工程
-马铃薯生物技术
-马铃薯遗传资源收集、开发与利用
主要学术贡献/MAJOR ACADEMIC CONTRIBUTIONS
生物技术研发与数据库构建方面：
1. 首次研发成功花椰菜花药培养单倍体再生技术及高效体系；
2. 发明花蕾培养单倍体诱导技术，该技术是继花药培养和小孢子培养技术后第三个雄性生殖单倍体诱导技术；
3. 研制一种野生马铃薯微型薯诱导技术，为野生马铃薯的繁殖和保存提供了新的途径；
5. 利用叶绿体基因工程，在烟草中成功合成长链聚羟基脂肪酸酯；
6. 采用RNAi技术，构建OsGA20ox2 gene 沉默矮杆水稻；
7. 分别应用DDRT-PCR、AFLP-cDNA、RNA-Seq技术建立了3个转录组数据库：1）基于StCO转基因材料的马铃薯块茎分化与发育相关基因表达数据库，2）与黄萎病抗性相关的茄子功能基因转录组数据库，3）与黄萎病抗性相关的茄子小RNA数据库；
马铃薯研究方面：
8. 研究了二倍体马铃薯Solanum Chacoense细胞质雄性，揭示其不育机制；
9. 深入研究了马铃薯块茎形成调控的分子基础，鉴定并克隆了多个与马铃薯块茎分化与发育调控相关基因如PHYA、PHYB、COL、FT、TFL等基因，并揭示了它们在块茎形成调控中的功能;
10. 系统地研究了马铃薯花色苷生物合成关键酶基因，克隆了全套结构基因及部分调节基因，并将部分基因成功地应用于马铃薯花色苷含量改良；
11. 克隆了马铃薯类胡萝卜素关键基因StLCYb，并成功地将之应用于马铃薯块茎类胡萝素合成改良；
12. 克隆了数十个马铃薯耐热、耐寒、耐盐、抗虫等基因，并阐明了这些基因的功能；
13. 通过体外抑癌实验，揭示了彩色马铃薯花色苷和绿原酸在抗肝癌和结肠癌中的作用；
14. 开展抗菌肽MSI-99m的应用研究，揭示其在抗马铃薯晚疫病、青枯病、油菜菌核病中的功能；
15. 采用转录组测序，研究了马铃薯栽培品种在热胁迫下的分子响应，揭示了马铃薯耐热的分子基础；
16. 采用生物信息学和分子生物学方法，鉴定了马铃薯HSF家族基因,该家族包27 成员；
17. 采用生物信息学和分子生物学方法，鉴定了马铃薯bZIP家族基因,该家族包63成员；
18. 采用生物信息学和分子生物学方法，鉴定了马铃薯WDR家族基因,该家族包168成员；
茄子研究方面：
19. 系统地研究了受黄萎病菌诱导的野生茄子差异基因表达谱，揭示了野生茄子Solanum torvum抗黄萎病的分子基础，在此基础上克隆和研究了10多个基因的抗病功能；
20. 系统地研究了受黄萎病菌诱导表达的茄子miRNA，揭示了miRNA参与茄子黄萎病防卫过程，研究并揭示了6个miRNA的功能；
21. 采用降解组测序，系统地鉴定了受黄萎病菌诱导表达的茄子miRNA靶基因，发现这些靶基因与小RNA之间在功能上存在的复杂网络关系；
大豆研究方面：
22. 通过转录组测序分析，揭示了大豆对斜纹夜蛾响应在基因和转录水平上的多样性；
23. 采用基于多拷贝分析，研究了大豆异黄酮途径的进化，发现代谢途径的结构和功能决定了基因复制和组成酶的进化约束。
近期部分论文/RECENT SELECTED PAPERS
- Li T, Tao NJ,Lin YM,Chen M,Jiao DL,Xue CM,Zhu WJ, Yang Q (2021) Identification of miRNA targets in eggplant in response to Verticillium dahliae by degradome sequencing. Eur J Plant Pathol, https://doi.org/10.1007/s10658-021-02217-8
- Zhu WJ, Jiao DL, Zhang J, Xue CM, Chen M, Yang Q (2020) Genomewide identification and analysis of BES1/BZR1 transcription
factor family in potato (Solanum tuberosum L). Plant Growth Regulation, https://doi.org/10.1007/s10725-020-00645-w
- Tang RM, Gupta SK, Niu SY, Li XQ, Yang Q, Chen GS, Zhu WJ, Haroon M (2020) Transcriptome analysis of heat stress response genes in potato leaves. Molecular Biology Reports, https://doi.org/10.1007/s11033-020-05485-5
- Tao NJ,Zhu WJ,Gan MJ,Chen M,Li T,endu A,Jiao DL,Wang M,Xue CM,Lin YM,Yang Q (2019) Genomewide identification and functional analysis of the WDR protein family in potato. 3 Biotech, 9:432, https://doi.org/10.1007/s13205-019-1965-4
-Wang T, Chen YM, Zhuang WB, Zhang FJ, Shu XC, Wang Z, Yang Q (2019) Transcriptome Sequencing Reveals Regulatory Mechanisms of Taxol Synthesis in Taxus wallichiana var. Mairei. International Journal of Genomics, https://doi.org/10.1155/2019/**
- Zhu WJ, Bai X, Li GT, Chen M, Wang Z, Yang Q (2019) SpCYS, a cystatin gene from wild potato (Solanum pinnatisectum), is involved in the resistance against Spodoptera litura. Theor. Exp. Plant Physiol., 31:317–328, https://doi.org/10.1007/s40626-019-00148-8
- Tang RM, Niu SY, Zhang GD, Chen GS, Haroon M, Yang Q, Rajora OP, Li XQ (2018) Physiological and growth responses of potato cultivars to heat stress. Botany, 96: 897-912, dx.doi.org/10.1139/cjb-2018-0125
- Zhu WJ, Shi K, Tang RM, Mu XY, Cai JH, Chen M, You X, Yang Q (2018) Isolation and functional characterization of the SpCBF1 gene from Solanum pinnatisectum. Physiol Mol Biol Plants, 24(4):605-616, doi.org/10.1007/s12298-018-0536-1
- Mu XY, Liu XR, Cai JH, Zhu WJ, Wang Z, Yang Q, You X (2018) MiR395 overexpression increases eggplant sensibility to Verticillium dahliae infection. Russ J of Plant Physiololy, 65(2): 203-210
- Liu L, Zhang RJ, Zhu WJ, Liu XR, Shi K, Chen M, Yang Q (2017) Inhibitory effect of StCYP707A1 gene on tuberization in transgenic potato. Plant Biotechnol Rep, 11: 219-228, DOI 10.1007/s11816-017-0442-y
- Tang RM, Zhu WJ, Song XY, Lin XZ, Cai JH, Wang M, Yang Q (2016) Genome-wide identification and function analyses of heat shock transcription factors in potato. Front. Plant Sci., 7:490. doi:10.3389/fpls.2016.00490
- Song XY, Zhu WJ, Tang RM, Cai JH, Chen M, Yang Q (2016) Over-expression of StLCYb increases b-carotene accumulation in potato tubers. Plant Biotechnol Rep, 10:95-104, DOI 10.1007/s11816-016-0390-y
- Chen M, Zhu WJ, You X, Liu YD, Kaleri GM, Yang Q (2015) Isolation and characterization of a chalcone isomerase gene promoter from potato cultivars. Genetics and Molecular Research, 14 (4): 18872-18885
- Wang SH, Yang XY, Xu MN, Lin XZ, Lin T, Qi JJ, Shao GJ, Tian NN, Yang Q, Zhang ZH, Huang SW (2015) A Rare SNP Identified a TCP Transcription Factor Essential for Tendril Development in Cucumber. Molecular Plant, 10/2015; DOI:10.1016/j.molp.2015.10.005
- Wang YL, Wang H, Ma YJ, Du HP, Yang Q, Yu DY (2015) Identification of transcriptional regulatory nodes in soybean defense networks using transient co-transactivation assays. Frontiers in Plant Science, 6: 1-16, http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2015.00915
- Wang YL, Wang H, Ma YJ, Yang WM, Yang Q, Yu DY (2015) Identification of soybean herbivoryregulated genes and a transgenic investigation of their potential in insect resistance. Plant Cell Tissue and Organ Culture, 08/2015; 123(2):321-340, DOI:10.1007/s11240-015-0837-9
- Yang L, Shi C, Mu XY, Liu C, Shi K, Zhu WJ, Yang Q (2015) Cloning and expression of a wild eggplant cytochrome P450 gene, StoCYP77A2, involved in plant resistance to Verticillium dahliae. Plant Biotechnol Rep, DOI 10.1007/s11816-015-0355-6, 9:167-177
- Yang L, Mu XY, Liu C, Cai JH, Shi K, Zhu WJ and Yang Q (2015) Overexpression of potato miR482e enhanced plant sensitivity to Verticillium dahliae infection. Journal of Integrative Plant Biology, 57(12):1078-1088
- Jue DW, Yang L, Shi C, Chen M, Yang Q (2014) Cloning and characterization of a Solanum torvum NPR1 gene involved in regulating plant resistance to Verticillium dahliae. Acta Physiol Plant, DOI 10.1007/s11738-014-1671-0, 36:2999-3011
- Chu SS, Wang J, Cheng H, Yang Q, Yu DY (2014) Evolutionary study of the isoflavonoid pathway based on multiple copies analysis in soybean. BMC Genetics, DOI: 10.1186/1471-2156-15-76
- WANG YL, WANG H, FAN R, YANG Q, YU DY (2014) Transcriptome analysis of soybean lines reveals transcript diversity and genes involved in the response to common cutworm (Spodoptera litura Fabricius) feeding. Plant, Cell & Environment, DOI: 10.1111/pce.12296, 37: 2086-2101
- Li W, Wang B, Wang M, Chen M, Yin JM, Kaleri GM, Zhang RJ, Zuo TN, You X and Yang Q (2014) Cloning and characterization of a potato StAN11 gene involved in anthocyanin biosynthesis regulation. Journal of Integrative Plant Biology, DOI: 10.1111/jipb.12136, 56(4): 364-372
- Zhang YF, Yang Q, Ji Q, Wang DZ, Xu C (2014) Expression, prification, and synergistic effects in starch binding of starch-binding domains (SBD-SBD4) derived from Aspergillus niger 2316 glucoamylase. Journal of pure and applied microbiology, 8(3):2021-2030
- Sang XL, Jue DW, Yang L, Bai X, Chen M, Yang Q (2013) Genetic transformation of Brassica napus with MSI-99m gene increases resistance in transgenic plants to Sclerotinia sclerotiorum. Molecular Plant Breeding, 4(30): 247-253, doi: 10.5376/mpb.2013.04.0030
- Yang L, Xie C, Li W, Zhang RJ, Jue DW, Yang Q (2013) Expression of a wild eggplant ribosomal protein L13a in potato enhances resistance to Verticillium dahliae. Plant Cell Tiss Organ Cult, 115(3) : 329-340, DOI 10.1007/s11240-013-0365-4
- Yang L, Jue DW, Li W, Zhang RJ, Chen M, Yang Q (2013) Identification of miRNA from eggplant (Solanum melongena L.) by small RNA deep sequencing and their response to Verticillium dahliae infection. PLoS ONE, 8(8): e72840. doi:10.1371/journal.pone.**
- Liu SP, Hong YB, Wu Z, Ma YS, Jue DW, Xie C, Zhu YP, Chen M and Yang Q (2013) Protein extract of tobacco expressing StoVe1 gene inhibits Verticillium dahliae proliferation. Czech J. Genet. Plant Breed., 49: 58–64
- Hong YB, Liu SP, Zhu YP, Xie C, Jue DW, Chen M, Kaleri HA and Yang Q (2013) Expression of the MSI-99m gene in transgenic potato plants confers resistance to Phytophthora infestans and Ralstonia solanacearum. Plant Mol Biol Rep, 31：418-424 (5.319)
- Liu SP, Zhu YP, Xie C, Jue DW, Hong YB, Chen M, Hubdar AK, Yang Q（2012）Transgenic potato plants expressing StoVe1 exhibit enhanced resistance to Verticillium dahliae. Plant Mol Biol Rep, 30:1032-1039
- Wei Q, Feng ZH, Wang QY, Wang B, Zhang YF, Yang Q (2012) Increased accumulation of anthocyanins in transgenic potato tubers by over-expression of 3GT gene. Plant Biotechnol Rep，6: 69-75
- Wang QY, Chen Q, He ML, Mir PY, Su JY and Yang Q (2011): Inhibitory effect of antioxidant extracts from various potatoes on the proliferation of human colon and liver cancer cells, Nutr Cancer, 63(7):1044-1052
- Xie YJ, Cui WT, Yuan XX, Shen WB, Yang Q (2011) Haem oxygenase-1 is associated with wheat salinity acclimation by modulating reactive oxygen species homeostasis. Journal of Integrative Plant Biology, 53( 8): 653-670
- Xie YJ, Xu S, Han B, Wu MZ, Yuan XX, Han Y, Gu Q, Xu DK, Yang Q and Shen WB (2011) Evidence of Arabidopsis salt acclimation induced by up-regulation of HY1 and the regulatory role of RbohD-derived reactive oxygen. species synthesis. Plant Journal, 66（2）：280-292
- Li C, Huang B, Yan XH, Wang LJ, Yang Q, and Wei WH (2010) Cloning, identification and characterization of a repetitive sequence flanking telomere and homologous to canrep in Brassica napus. Botanical Studies，51: 421-430
- Guo JL, Yu CL, Fan CY, Lu QN, Yin JM, Zhang YF, Yang Q（2010）Cloning and characterization of a potato TFL1 gene involved in tuberization regulation. Plant Cell, Tissue and Organ Culturue, 103:103-109
- Zhang F, Wang Z, Huang QS, Huang LP, Yang Q (2010) Cloning and characterization of a PGIP-encoding gene from Solanum torvum. Agriculrural Sciences in China, 9（6）：921-927
- Fan CY, Yin JM, Wang B, Zhang YFand Yang Q（2010）Molecular cloning and expression analysis of a FT homologous gene from Solanum tuberosum. Agricultural Sciences in China, 9(8): 1133-1139
- Wang Z, GuoJL, ZhangF, Huang QS, HuangLP, and Yang Q(2010) Differential expression analysis by cDNA-AFLP of Solanum torvum upon Verticillium dahliae infection. Russ. J. of Plant Physiology, 57（5）：676-684
授权专利/PATENTS
1) 杨清，史策，陈敏，决登伟. 野生茄子细胞色素氧化酶基因StCYO77A2及其表达载体和应用. 专利号：2013.1.**.3, 国家发明专利，2014。
2）杨清，决登伟，陈敏，杨柳. 野生茄子StoNPR1基因及其应用. 专利号：2013,1,**.8, 国家发明专利，2015。
3）杨清，决登伟，陈敏. 野生茄子StoWRKY6基因及其表达载体和应用. 专利号：2013.1.**，0, 国家发明专利，2015。
奖励与荣誉/ AWARDS AND HONORS
2012年：“细胞分子生物学”课程获得江苏省教育厅优秀研究生课程奖励；
2012年：获得江苏省侨联颁发的江苏省归侨先进个人称号；
2018年：在中国马铃薯大会上获得优秀论文一等奖。
社会兼职/PROFESSIONAL AFFILIATIONS
2002年，淮阴工学院兼职教授；
2006年，江苏农林职业技术学院园艺专业指导委员会委员。
服务地方/SOCIAL WORK
1）参与江苏省马铃薯科技示范园建设，作为首席专家，参与了示范园项目的申报，园区设计和建设过程；
2）开展马铃薯品种资源的引进与试验评价研究，针对江苏地区的气候特点，从国内外引进一批早熟优良的马铃薯品种，并在江苏条件下进行品种特性和农艺性状的评价试验，筛选适合于本地种植的马铃薯品种；
3）开展马铃薯产业化宣传与推广工作，多次接收平面媒体和电视媒体的采访，介绍马铃薯的营养价值和经济价值，宣传马铃薯对江苏地区农业经济的重要性和马铃薯主粮化的发展前景，经网络大量传播后产生了积极的社会影响。
科研合作/SCIENTIFIC RESEARCH COOPERATION
-加拿大农业与农业食品部（AAFC)马铃薯研究中心，Dr Li Xiu-Qing；
-中国农业科学院蔬菜花卉研究所，黄三文研究员。
联系方式/CONTACT INFORMATION
江苏省南京市玄武区卫岗1号, 邮编:210095
Tel: (O), Fax:
E-mail: qyang19@njau.edu.cn

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