1952年，原南京大学地理系主任李旭旦教授在南京师范学院成立时奉调创办地理系，至今已有50年了。现南京师大地理科学学院的前身南师地理系的历史可追溯到1919年。

　　1919年南京高等师范学校改国文部为文史地部。1920年南京高等师范学校扩建为东南大学，1921年建地学系，竺可桢为创办人，任系主任。1928年东南大学经第四中山大学、江苏大学改为国立中央大学，1930年地学系分为地理系和地质系，胡焕庸任地理系主任。1943年李旭旦接任系主任。1949年4月，南京解放后，中央大学改名为南京大学，李旭旦仍担任地理系主任直至1952年院系调整中，李旭旦偕金祖孟等同志来南师创办地理系。在治学思想上秉承前中大地理系和金陵女大地理系勤奋、务实、开拓、创新的学风。

　　1952年招收一年制专修班和二年制专修科。1953年春江苏师范学院地理科并入。1956年建系，招收地理本科，同时招收两年制专科，共计8届两年制专科。1958年在校学生达381人，为当时全院学生人数最多的系科之一。1963年起停止招生，在校学生逐年减少，1966届学生毕业后，地理系已没有学生，但建制和师资设备均未变动。1969年江苏教院地理科并入。1973年恢复招生，共招4届工农兵学员，学制3年，曾一度副修历史。1977年恢复高考后，地理专业招收四年制本科。1989年增设旅游管理专业，招收三年制的专科生，1995年招收本科生。1993年地理系增设土地管理专业，招收两年制专科生，1999年招收本科生。1999年创办GIS本科专业并招生。

　　1980年区域地理专业招收硕士研究生，1981年地图与遥感专业招收硕士研究生，1986年自然地理专业和第四纪地质等专业先后招收硕士研究生，1987年地理教学论招收硕士研究生。1994年自然地理专业招收博士研究生，1998年招收地图与GIS专业博士研究生，2000年建立地理学博士后流动站并接受进站研究人员，2001年地理学所属三个二级专业全面招收博士研究生。2002年地图与GIS专业，被批准为国家级重点学科。2003年新增环境地理学、海洋地理学和第四纪地质学3个博士点，环境地理学、海洋地理学和旅游管理3个硕士点。目前，地理科学学院共有6个博士点，8个硕士点。

　　经省教委批准，1997年6月在调整改造地理系的基础上，成立全国第一家地理科学学院。目前学院下设4系7所5中心，即：地理系、旅游系、土地管理系、地理信息系统系、海岸与第四纪研究所、滩涂研究所、人文与区域规划研究所、地图与遥感研究所、地理信息工程所、环境科学研究所、地政地籍研究所地理信息系统工程技术中心、生态-气候-环境研究中心、区域经济研究中心、旅游管理与规划研究中心和海洋信息研究中心。