导师简介黄鹰,博士，生物化学家，南京师范大学特聘教授，博士生导师。1965年出生，1986年毕业于华东理工大学生物化学工程系生物化学工程专业，获工程学学士学位。1986年至1992年在中科院上海生物工程实验基地从事基因工程研究。1997年毕业于美国德州大学卫生研究中心圣安东尼奥分校生物化学系生物化学专业，获博士学位。1997年至2006年在美国国立卫生研究院(NIH)尤尼斯·肯尼迪·史瑞沃国家儿童健康与人类发展研究所（NICHD）从事研究工作9年，历任Visitingfellow与Researchfellow。2006年至今受聘为南京师范大学生命科学学院特聘教授。现任中国生物化学与分子生物学会核糖核酸专业委员会委员。在南京师范大学任职5年间先后获得4项国家自然科学基金面上项目。现主持国家自然科学基金2项，江苏省优势学科建设工程子项目1项。研究方向为微生物生物化学与分子生物学，以第一作者或通讯作者发表SCI影响因子>3论文近20篇。招生方向专业：微生物学专业或生物技术专业都可以学位：微生物分子生物学（博士），功能基因与蛋白质组学（硕士），基因工程（硕士）我们实验室的优势：本人从事科学研究25年，在国外从事科学研究14年。本人研究酵母有近20年历史，有两项国家科研基金的资助，能全职指导学生做研究。已发表SCI影响因子>3论文近20篇。我们团队的每个人都有着相同的使命，虽然我们团队小，但个个出色。加入我们的团队，你能开拓生命科学的视野，进入生命科学领域的前沿。加入我们的团队，你能学到你想学的东西。相信在老师的细心指导下，你一定能成功。欢迎成为我们团队中的一员。联系方式电话：办公室：（025）85891263,手机：13951994845，Email:y_shang_hai@126.com，yhuang@njnu.edu.cn前列腺癌相关基因（包括ELAC2）的进化机制及不同物种间的功能保守性目前发现有许多基因突变与前列腺癌发生有关(见美国国家癌症研究所网站：http://www.cancer.gov/cancertopics/pdq/genetics/prostate/HealthProfessional/page2#Section_43)，我们已经研究了前列腺癌相关基因ELAC2的进化机制。ELAC2是第一个被发现的前列腺癌相关基因，也叫tRNaseZ，属于b内酰胺酶超家族。tRNaseZ按序列长短可分为短型(tRNaseZ^S)和长型(tRNaseZ^L)两种。前者含有280-360氨基酸残基，后者含有750-930氨基酸残基。我们发现绝大多数子囊真菌只有一个长型tRNaseZ^L，同时定位于细胞核与线粒体，而裂殖酵母有两个长型tRNaseZ^L基因(trz1⁺和trz2⁺)，分别定位于细胞核与线粒体；植物中有3-4个tRNaseZ，定位在不同的细胞器中；除了线形动物和节肢动物只有一个tRNaseZ^L基因，动物有一长一短两个tRNaseZ，分别定位于细胞核与细胞质。我们发现按氨基酸序列的模体（motif）分，tRNaseZ可分为三类。这些模体可能决定不同种类tRNaseZ的底物特异性。并且，我们的研究成果支持长型tRNaseZ^L是从短的tRNaseZ^S进化来的。相关研究成果已在生物进化杂志BMCevolutionarybiology上发表两篇论文。除了ELAC2外，我们对其它前列腺癌相关基因的进化机制感兴趣。裂殖酵母作为模式生物的优越性“微生物作为最简单的生命体而成为生命科学研究不可替代的基本材料，由此也奠定了微生物学在生命科学中的基础地位”（《国家自然科学基金1999年度项目指南》）。裂殖酵母是一种在国际上被广泛用于功能基因研究的模式微生物。其基因组全序列已在2002年被测定。运用于裂殖酵母的遗传学、分子生物学、细胞生物学和蛋白组学等研究技术非常成熟，便于开展基因表达调控，功能以及重要细胞途径的研究。此外，酵母安全无毒，非条件致病菌。裂殖酵母中前列腺癌相关基因的同源基因的表达调控与功能为什么不同物种有不同数目的前列腺癌相关基因？它们的功能是什么？裂殖酵母中的两个前列腺癌相关基因的同源基因(trz1⁺和trz2⁺)对酵母生命而言都是必需基因。我们确定了它们编码的蛋白分别定位于细胞核与线粒体中，并且其重组蛋白在体内具有tRNA前体3'-末端加工酶活性。tRNaseZ除了参与tRNA3'末端加工外，还可能有其它功能。例如人tRNaseZ^L(ELAC2)参与产生类似tRNA（tRNA-like）和其它非编码RNA(microRNA)的合成。但酵母中tRNaseZ^L是否有类似人ELAC2的其它功能还不清楚。有趣的是，高表达线粒体trz2⁺使裂殖酵母细胞致死并改变细胞正常形态，而高表达细胞trz1⁺对细胞生长没有影响。裂殖酵母中的trz1⁺可以被芽殖酵母前列腺癌相关基因TRZ1或人ELAC2替代。相关研究成果已经在BiochemicalJournal上发表两篇论文。目前我们正在确定trz1⁺和trz2⁺的表达调控顺式与反式因子，并研究为什么高表达trz1⁺和trz2⁺会对细胞有不同的影响。利用裂殖酵母筛选治疗前列腺癌的药物裂殖酵母因其基因组的易操作性及其培养条件的简单，是一种理想的药物筛选工程细胞。我们计划利用裂殖酵母高通量筛选治疗前列腺癌的药物。有关原理参见《基于酵母水平的高通量药物筛选》，《生命科学》2004年第5期。教学研究生选修课程：微生物遗传学3学分本科生选修课程：普通免疫学2学分基金项目目前主持的科研基金项目国家自然科学基金：线粒体tRNA前体加工与细胞周期调控之间偶联机制的研究，项目批准号：31170065，2012.1-2015.12国家自然科学基金：与前体腺癌易感基因相关的、编码裂殖酵母tRNA3'末端加工酶tRNaseZ基因功能的研究；项目批准号：31070703，2011.1-2013.12已完成的科研基金项目国家自然科学基金：与前列腺癌相关基因HsaTRZ2/ELAC2同源、编码tRNA3'末端加工酶的粟酒酵母基因trz1⁺的研究；项目批准号：30670446，2007.1-2009.12国家自然科学基金：与前列腺癌相关基因HsaTRZ2/ELAC2同源的粟酒酵母线粒体蛋白trz2⁺的研究；项目批准号：30771178，2008.1-2010.12研究论文1.Fan,L.,Wang,Z,Liu,J.,Guo,W.,Yan,J.andHuang,Y,AsurveyofgreenplanttRNA3'-endprocessingenzymetRNaseZs,homologsofthecandidateprostatecancersusceptibilityproteinELAC2.BMCEvol.Biol.2011，11:219(影响因子IF:3.7)2.Gan,X.JingYang,JunLi,Yu.,H,DaiandHuang,Y.ThefissionyeastSchizosaccharomycespombehastwodistincttRNaseZLsencodedbytwodifferentgenesanddifferentiallytargetedtothenucleusandmitochondria，BiochemJ.2011，435,103-111(影响因子IF:5.0)3.WuG,SunY,QuW,Huang,Y,LuL,Li,LandShao,W.ApplicationofGFATasanovelselectionmarkertomediategeneexpression.PLoSONE2011,6(2):e17082.doi:10.1371/journal.pone.00170824.Zhao,W.,Yu,H.,Li,S.andHuang,Y.IdentificationandanalysisofcandidatefungaltRNA3'-endprocessingendonucleasestRNaseZs,homologsoftheputativeprostatecancersusceptibilityproteinELAC2.BMCEvol.Biol.2010,10:272(影响因子IF:3.7)5.Zhao,Z.,Su,W.,YuanS.andHuang,Y.FunctionalconservationoftRNaseZLamongSaccharomycescerevisiae,Schizosaccharomycespombeandhumans.Biochem.J.2009,422,483-492(影响因子IF:5.0)6.Yee,N.S.,Gong,W.,Huang,Y.,Lorent,K.,Dolan,A.C.,Maraia,R.J.andPack,M.Mutationofzebrafishrpc2revealsexquisitedependenceonRNApolymeraseIIIforthedevelopmentofthedigestivesystem.PLoSBiology2006,5(11),e312doi:10.1371/journal.pbio.00503127.Huang,Y.,Bayfield,M.(co-firstauthor),Intine,R.andMaraia,R.J.SeparateRNA-bindingsurfacesonthemultifunctionalLaproteinmediatedistinguishableactivitiesintRNAmaturation.Nat.Struct.Mol.Biol.2006,13,611-618.8.Huang,Y.,Intine,R.,Mozlin,A.,Hasson,S.andMaraia,R.J.MutationsintheRNApolymeraseIIIsubunitRpc11pthatdecreaseRNA3'cleavageactivityincrease3'oligo-UlengthandLa-dependenttRNAprocessinginfissionyeast.Mol.Cell.Biol.2005,25,621-636.9.Huang,Y.,Hamada,M.andMaraia,R.J.RNApolymeraseIIIfromthefissionyeast,S.pombe.InS.AdhyaandS.Garges,(eds),MethodsEnzymol.2003,370,AcademicPress,Inc.,SanDiego,CA,pp.165-173.10.Huang,Y.,McGillicuddy,E.,Weindel,M.Dong,SandMaraia,R.J.ThefissionyeastTFIIB-relatedfactor,Brf1,limitsRNApolymeraseIIItoaTATA-dependentpathwayofTBPrecruitment.NucleicAcidsRes.2003,31,2108-2116.11.Huang,Y.TranscriptionalsilencinginSaccharomycescerevisiaeandSchizosaccharomycespombe.NucleicAcidsRes.2002,30,1465-82.12.Hamada,M.,Huang,Y.,Lowe,T.M.andMaraia,R.J.(2001).WidespreaduseofTATAelementsinthecorepromotersforRNApolymeraseIII,IIandIinfissionyeast.Mol.Cell.Biol.2001,21,6870-6881.13.Huang,Y.,Hamada,M.,Patel,J.andMaraia,R.J.ConstructionofFLAGandhistidinetaggingvectorsforS.pombe.Yeast18,463-468.14.Huang,Y.andMaraia,R.J.ComparisonofRNApolymeraseIIItranscriptionmachineryinS.pombe,S.cerevisiaeandhumans.NucleicAcidsRes.2001,29,2675-2690.15.Huang,Y.,Hamada,M.andMaraia,R.J.IsolationandcloningoffoursubunitsofafissionYeastTFIIICComplexthatincludesanorthologofthehumanregulatoryproteinTFIIICb.J.Biol.Chem.2000,275,31480-31487.16.Intine,R.,Sakulich,A.,Koduru,S.,Huang,Y.,Pierstorff,E.,Goodier,J.,Phan,L.andMaraia,R.J.ControloftransferRNAmaturationbyphosphorylationofthehumanLaantigenonserine366.Mol.Cell2000,6,339-48.17.Huang,Y.,Eckstein,F.,Padilla,R.,andSousa,R.Themechanismofribose2’-groupdiscriminationbyanRNApolymerase.Biochemistry1997,36,8231-8242.18.Huang,Y.,Beaudry,A.,McSwiggen,J.andSousa,R.DeterminantsofribosespecificityinRNApolymerization:effectsofMn^2＋anddNMPincorporationintotranscripts.Biochemistry1997,36,13718-28.19.Huang,Y.,Garrison,P.N.andBarnes,L.D.(1995).CloningoftheS.pombegeneencodingdiadenosine5',5'''-P1,P4-tetraphosphateasymmetricalhydrolase:sequencesimilaritywiththehistidinetriad(HIT)proteinfamily.Biochem.J.1995,312,925-932邀请国内外专家1.2007年，南京师范大学105年校庆期间邀请中科院院士王恩多来我校做学术访问，并作了题为“人氨基酰-tRNA合成酶及相关tRNA的研究”的学术报告和一场主题为“事业与人生”的座谈会。2.2008年，南京师范大学105年校庆期间邀请美国纽约大学教授LouisLevinger博士作学术报告:“Pre-tRNA3'endprocessingandhumandisease”3.2008年，邀请加州大学柏克利分校分子与细胞生物学系教授,厦门大学生命科学学院闽江学者讲座教授、博士生导师周强教授作学术报告："TheYinandYangofP-TEFbregulation:ImplicationsforHIVgeneexpression,cellgrowthcontrolandcancer"4.2009年，邀请新加坡InstituteofMolecularandCellBiology,WangYue教授作学术报告:"Candidaalbicanshyphaldevelopment---fromsignalsensingtopolaritycontrol"5.2009年，邀请法国CiaránCondon博士，InstitutdeBiologiePhysico-Chimique，作学术报告:"B.subtilisasanalternativebacterialmodelofRNAmaturationanddecay"学术会议2011年，InternationalUnionofMicrobiologicalSocieties(IUMS)2011Congress,Sapporo2011年，亚太地区蛋白质学会第三届学术会议"暨"中英双边蛋白质科学研讨会，上海2011年，首届哈尔滨国际沙门菌及其他肠道菌基因组学和生物学研讨会2011年，2011年度RNA国际会议,Kyoto，Japan2010年，第六届全国核糖核酸（RNA）学术讨论会,广州2010年，第四届全国微生物遗传学学术研讨会,杭州2010年，中国生化与分子生物学会第十届全国学术会议,南京2010年，2010年度RNA国际会议,Seattle2009年，2009年度RNA国际会议,Wisconsin-Madison2009年，第11届中国细胞生物学学术大会暨西安细胞生物学国际会议2009年，东京第五届裂殖酵母会议,西安2009年，“TheInternationalSymposiumonAdvancesinModernBiology”,本校2009年，2009年国际生化大会,上海2008年，亚洲－太平洋地区裂殖酵母学术讨论会,新加坡2007年，第五届全国核糖核酸（RNA）学术讨论会，“与前列腺癌相关蛋白ELAC2/HsTRZ2同源、裂殖酵母tRNA3’末端加工酶Trz1p功能的研究"，上海Huang,Y.,Bayfield,M.andMaraia.R.J.“ModularbasisofaLaproteinactivityinthematurationofstructurally-impairedpre-tRNAthatisdistinguishablefrom3'endprotection”TheSecondEastCoastRegionalFissionYeastMeeting,2005,Miami,FL,USAHuang,Y.,Bayfield,M.andMaraia.R.J.“Pre-tRNAsthatrequireeitheroneortwofunctionsofLaprotein:protectionfrom3'-mediateddecaybythenuclearexosome-Rrp6p,andfacilitationofprocessing”.RNA2005:theTenthAnnualMeetingoftheRNASociety,Banff,Canada.Huang,Y.andMaraia,R.J.“MutationsintheRNApolymeraseIIIsubunitRpc11pthatdecreaseRNA3'cleavageactivityincrease3'oligo-UlengthandLa-dependenttRNAprocessinginfissionyeast”.12thBiennialMeetingOnPost-InitiationActivitiesofRNAPolymerases2004,MountainLake,Virginia,USAHuang,Y.,Intine,R.,Hasson,S.andMaraia,R.J.“MechanismofRNA3'endformationbypolymeraseIIIRpc11pinLa-dependenttRNAprocessing”.NIHResearchFestival2004,Bethesda,MD,USAHuang,Y.,Intine,R.,Hasson,S.andMaraia,R.J.“MechanismofRNA3'endformationbypolymeraseIIIRpc11pinLa-dependenttRNAprocessing”.RNAPolymeraseI&IIITranscriptionConference,2004,PacificGrove,California,USAHuang,Y.andMaraia,R.J.“ThefissionyeastTFIIB-relatedfactorlimitsRNApolymeraseIIItoaTATA-dependentpathwayofTBPrecruitment”.TheFirstEastCoastRegionalFissionYeastMeeting,2003,Worcester,MA,USAHuang,Y.,McGillicuddy,E.,Weindel,M.andMaraia,R.J.“RNAPolymeraseIIIislimitedtoaTATA-dependentpathwayofTBPrecruitmentinfissionyeast”.TheEnzymologyofChromatinandTranscriptionKeystoneSymposium,2003,SantaFe,NewMexico,USAHuang,Y.,Weindel,M.,McGillicuddy,E.andMaraia,R.J.“InsufficiencyofBrf1asastableTAFlimitsPolymeraseIIIinitiationcomplexestoaTATA-dependentpathwayofTBPrecruitmentinS.pombe”.RNAPolymeraseI&IIITranscriptionConference,2002,PacificGrove,California,USAHuang,Y.,Hamada,M.andMaraia,R.J.“IsolationandcharacterizationofTFIIICfromS.pombe:IdentificationoftheyeasthomologofhumanTFIIICb,akeyregulatorofpolymeraseIIItranscription”.RNAPolymeraseI&IIITranscriptionConference,2000,PacificGrove,California,USAHamada,M.,Huang,Y.andMaraia,R.J.“TranscriptionterminationbyRNApolymeraseIIIinfissionyeast:Ageneticandbiochemically-tractablemodelsystem”.10thBiennialMeetingOnPost-InitiationActivitiesofRNAPolymerases2000,MountainLake,Virginia,USA