南京林业大学前身为创建于1902年的中央大学。1952年开设森林（采运）工程专业，1986年更名为森林工程专业，同年设立森林工程系，并增设土木工程专业，1997年更名为土木工程学院。目前设有森林工程、土木工程（交通土建工程、建筑工程两个方向）、工程管理、测绘工程、给水排水工程等6个本科专业和方向，分别对应6个系。其中，土木工程专业为江苏省首批特色专业、江苏省品牌专业建设点，森林工程专业为江苏省品牌专业、国家特色专业建设点，工程管理专业为江苏省特色专业建设点。学院获国家级教学成果二等奖1项，江苏省教学成果特等奖和一等奖各1项。二十多年来共毕业本专科学生4000多名，现在校各类学生近2000名。

　　学院现有1个博士点学科（森林工程）、2个一级学科硕士学位点（土木工程、交通运输工程）、2个硕士点学科（森林工程、管理科学与工程）、3个工程硕士领域学位授予点（建筑与土木工程、林业工程、交通运输工程），其中森林工程学科为国家重点学科和国家林业局重点学科。二十多年来学院共培养了200多名博士、硕士，现在读博士硕士生近200人。

　　目前学院在岗教职工75人，其中教授9名（博士生导师7名）、副教授级高级职称19人。江苏省“教学名师”1人，江苏省“333高层次人才培养工程”培养对象1人，江苏省“六大人才高峰”培养对象4人，江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人1人，“青蓝工程”中青年骨干教师3人。

　　学院设有土木工程实验中心、森林工程实验中心和测绘工程实验中心等三个实验中心。其中土木工程实验中心为江苏省省级实验教学示范中心。设有水运研究所、道路与桥梁工程研究所、岩土与地下工程研究所、绿色建筑与结构研究所、江苏正本南林大研究中心、测绘工程研究所等科研和对外服务机构，每年开展科学研究课题和科技服务项目50余项，年出版学术论文、教材论著100多篇（部），年科研及科技服务经费800多万元。多年来参与了二滩水电站、高速公路、南京长江第二大桥等跨江跨海大桥、南京地铁、苏州地铁、宁波地铁、竹木结构抗震示范建筑等国家重点工程建设项目的科技攻关和建设任务，曾获部省级科技进步奖5项，并多次得到江苏省和南京市政府的表彰。

　　学院与美国、俄罗斯、芬兰、澳大利亚、匈牙利、新加坡、日本、法国、意大利等国建立了长期友好合作关系。