南京林业大学化学工程学院的前身可以追溯到1929年，我国杰出的林学家、教育家、社会活动家、著名的民主革命人士梁希先生在浙江大学筹建并在原中央大学（我校前身之一）创办的森林化学室。1952年全国高校院系调整南京大学（原中央大学）等4所高校森林系合并组建我校后，于1955年创建了林产化学加工工程学科，1956年正式设立国内第一制个林产化学工艺学专业并招收本科生；1957年开始招收研究生。1959年5月单独设立林产化工系，1964年增设木材浆专业方向，1982年增设制浆造纸专业，1981、1983年先后设立林产化学加工工程硕士点和博士点，1986年前后增设了木材保护与改性和香料两个专科专业，1989年林产化学加工工程学科被评为国家级重点学科，2002年再次被评为国家级重点学科。
　　
　　1993年增设精细化工本科专业，同年12月林产化工系更名为化学工程学院。
　　
　　1994年成立林业部林产化工、制浆造纸技术咨询培训中心；1995年建立林业部林产化学加工重点开放性实验室。1996年设立制浆造纸工程硕士点。1998年林业工程一级学科（含林产化工二级学科）成立博士后流动站，同年增设生物工程本科专业；2000年增设生物化工硕士点，2001年新增环境工程、印刷工程、生物资源化学与工程化工过程与控制等4个专业（或专业方向）。现设有林产化工、轻化工程（制浆造纸工艺方向、制浆造纸装备与控制方向）、化学工程与工艺（精细化工方向、生物资源化学与工程方向、化工过程与控制方向）、生物工程、环境工程和印刷工程等本科专业。
　　
　　全院现有教职员工近100人，其中博士生导师7人，硕士生导师30人，教授14人，副教授、高级工程师32人，师资队伍学术水平高、年龄结构合理，被评为“江苏省普通高校优秀学科梯队”。几十年来，学院为国家培养和输送了博士、硕士、本科和大专毕业生近万人，许多毕业生已成为教学、科研、行政管理和生产经营等各行业的骨干和中坚。学院现有在校博士、硕士、本科及专科学生1600余人。
　　
　　学院在科学研究上也取得了令人瞩目的成绩，特别是改革开放以来，学院完成了国家、省部级科研项目90余项，其中近30多项获国家、省部级奖励。80年代以来，学院教师发表论文1200多篇，出版教材、专著20余部，近年来本院连续承担国家“八五”、“九五”国家攻关课题：“短周期工业材制化学浆工艺技术的研究”和“低污染高得率化学木浆工艺技术研究”。完成了国家科委攻关课题：“重质松节油合成系列香料的研究”、“松香胺系列产品开发与应用研究”，国家计委“九五”攻关项目：“杨树叶等农业纤维废料生产蛋白饲料”，目前还承担国家自然科学基金项目9项、国家“948”项目2项、国家攀登计划项目1项、省自然科学基金2项、国际合作项目1项、国家计经委产业化项目1项、校归国和引进人才科研基金项目6项、校科技创新基金项目2项及多项企业委托项目，科研总经费近1000万元。学院在萜类化学开发利用，植物多酚类（单宁化学）、活性炭生产性工艺和草原木质素化学与利用、纸浆脱水机理、造纸助剂开发利用、特种开发利用、植物纤维原料生物利用（发酵、酶制剂、低聚料蒸煮机理、糖制备等）、木材防腐与阻燃、制浆造纸自动化控制、环境保护、吸附机理研究等方面的研究处于国内领先水平，有些达到了国际先进水平。
　　
　　学院与国外的学术交流活动十分活跃。
　　
　　近10年来，先后派出80余人到国外留学、进修、考察访问和参加各种国际学术会议，邀请了70多名外国专家学者来院讲学交流，有18位国内外著名学者聘请为本院兼职教授，促进了学术交流和国际交往，并与
　　
　　国外各著名高校联合培养研究生。