姓名： 童春发 性 别: 男 院 系： 林学院
行政职务： 专业技术职称： 教授 任职年月： 2011.05
最后学历： 博士毕业 最后学位： 博士 是否国务院学科评议组成员： 否
任硕导年月： 2002.06 任博导年月： 2012.06 是否院士： 否
毕业院校： 南京林业大学 毕业专业： 090701 林木遗传育种 毕业时间：
办公电话： **-815 E-mail： tongchf@njfu.edu.cn
◇ ：学科信息
导师类别招生学院招生专业
博士生导师 林学院 0907Z1林木基因组与生物信息学
博士生导师 林学院 090701林木遗传育种


◇ 本人从事的主要研究方向的特点、意义及其水平：
研究方向：
1. 林木生物信息学，侧重二代测序数据分析，包括基因组变异位点(SNP)识别、序列拼接以及转录组数据分析。

2. 林木遗传连锁图谱构建、数量性状基因(QTL)定位和全基因组关联分析(GWAS)研究，包括具体数据分析、统计模型建立及计算软件开发。

3. 常规林木遗传育种模型统计分析研究，包括配合力、育种值、遗传力和遗传相关系数等遗传参数计算以及相应的软件开发。

详见童春发个人主页http://www.bioseqdata.com/


◇ ：近三年在国内外核心期刊上发表学术论文情况
论文题目 刊物名称 刊物国家 收录情况 卷期 排名
Construction of High-Density Linkage Maps of Populus deltoides x P.simonii Using Restriction-Site Associated DNA Sequencing PLOS ONE 国外 SCI 2016, DI 10.1371/journal.pone.** 1
Allotetraploid and autotetraploid models of linkage analysis Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 2015,16:32-38 共同一作
A statistical model for QTL mapping in polysomic autotetraploids Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 2014,15:1044-1056 共同一作
An allometric model for mapping seed development in plants Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 2014,15:562-570 2
Structural mapping: how to study the genetic architecture of a phenotypic trait through its formation mechanism Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 2014,15:43-53 1
A multivalent three-point linkage analysis model of autotetraploids Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 2013,14:460-468 3
WinNC2: 因子交配设计遗传分析软件 林业科学 国内 2014,50(1):55-62 1
不平衡巢式设计遗传模型分析 林业科学 国内 2013,49(1):1-8 1
Functional mapping of ontogeny in flowering plants. Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 2012,13(3):317-328 共同一作
Model selection for quantitative trait loci mapping in a full-sib family Genetics and Molecular Biology 国外 SCI 2012, 35(3) 1
GSCA: new software and algorithms to analyse diallel mating designs based on restricted linear model Silvae Genetica 国外 SCI 2012, 61(3) 1
De novo SNP discovery and genetic linkage mapping in poplar using restriction site associated DNA and whole-genome sequencing technologies BMC Genomics 国外 SCI 2
Multiallelic epistatic model for an outbred cross and mapping algorithm of interactive quantitative trait loci BMC Plant Biology 国外 SCI 2011,11:148 1
3FunMap: Full-sib family functional mapping of dynamic traits Bioinformatics 国外 SCI 2011,27(14):2006-2008 1
A conceptual framework for pharmacodynamic genome-wide association studies in pharmacogenomics Drug Discovery Today 国外 SCI 2011,16:884-890 2
A hidden Markov model approach to multilocus linkage analysis in a full-sib family Tree Genetics and Genomes 国外 SCI 2010,6:651-662 1
林木半同胞子代测定遗传模型分析 林业科学 国内 2010,46(1):29-35 1
MVQTLCIM: composite interval mapping of multivariate traits in a hybrid F1 population of outbred species BMC Bioinformatics 国外 SCI 2
Identification of recombination events in outbred species with next-generation sequencing data BMC Genomics 国外 SCI 6
gmRAD: an integrated SNP calling pipeline for genetic mapping with RADseq across a hybrid population Briefings in Bioinformatics 国外 SCI 1


◇ ：出版专著教材情况(注：在书名后注明教材或专著)
名称 类别 出版单位 日期 排名
林木遗传图谱构建和QTL定位统计分析 专著 科学出版社 2006-01-01 2
林木遗传模型统计分析及R语言实现 专著 科学出版社 2014-10-01 1


◇ ： 成果获奖情况
成果名称 颁奖部门 等级 完成日期 证书号 排名



◇ ：主持重大工程设计情况
项目名称 任务来源 完成形式 完成日期 鉴定验收单位 主要结论 排名
林木高质量遗传图谱构建和QTL 精确定位统计方法及应用 论文 国家自然基金委 通过结题 主持
林木数量性状基因座功能作图统计方法及应用 论文 江苏省科技厅 通过验收 主持


◇ ：目前承担的主要项目
项目名称及下达编号 项目类别 项目来源 起讫时间 科研经费(万元) 本人承担任务
林木数量性状基因座功能作图统计模型及其在杨树中的应用(**) 自然基金 2013.1-2016.12 主持
林木不平衡试验数据遗传模型分析及应用(**) 自然基金 2011.1-2013.12 主持
利用杂交F2代群体和二代简化基因组测序技术构建杨树整合的遗传连锁图谱(**) 自然基金 国家自然科学基金项目 2019.1-2020.12 25