南京工业大学理学院成立于2002年3月，其前身系原南京化工大学理学院和原南京建筑工程学院基础课部的部分学科。原南京化工大学理学院则是2000年6月由原南京化工大学应用化学系和基础科学学院部分学科合并组建。
　　学院现设有应用化学、信息与计算科学、应用物理和应用数学等4个系，物理省级基础课实验教学示范中心和化学省级基础课实验教学示范中心（国家实验教学示范中心建设点），应用化学、水处理技术、信号处理与数据挖掘等3个研究所，以及院办公室、院学生工作办公室等机构。学院拥有应用化学博士点，应用化学、有机化学和分析化学等3个硕士点，以及信息与计算科学、应用数学、应用物理、应用化学、光电子材料与器件等5个本科专业。
　　学院现有教职工148人，其中教授17人，副教授47人，博士生导师5人，硕士生导师28人。江苏省“五一”劳动奖章获得者1人，江苏省“333工程”中青年科技领军人才1人，江苏省“青蓝工程”中青年学术学术人2人、优秀青年骨干教师1人，南京市有突出贡献的中青年专家1人。主要承担全校各层次学生数学、物理、化学三大类基础课和专业基础课教学任务，以及本院博士生、硕士生和本科生的教育培养工作。现有各类在校学生1269人，其中博士生21人，硕士生190人，本科生1058人。
　　理学院铭记“明德、厚学、沉毅、笃行”的工大校训，弘扬“忠诚精实”的工大精神，以培养独立思考，抱负远大，视野开阔，知识、能力、素质俱佳，能在工业、科技、教育等各个领域发挥重要作用，具有创新精神和竞争能力的高层次人才为己任，在教育教学、学生工作、科学研究、学科建设等方面取得了显著成绩。
　　在教学工作方面，学院坚持以教学工作为中心，加强师资队伍建设，不断提高教学工作水平。近几年，先后涌现出《大学物理》、《无机与分析化学》、《概率论与数理统计》和《水化学与水处理技术》等一批省级优秀课程和校级精品课程，以及王锦堂、俞斌等一批“师德十佳”教师和“教书育人”先进，更有一大批教师在教育教学改革、青年教师授课竞赛、多媒体课件评比中获奖。
　　在学生工作方面，学院坚持“爱与责任”的工作理念，不断开创学生工作新局面。全院学生学风优良。各类学生在全国大学生数模竞赛、全国大学生英语竞赛、江苏省高等数学竞赛等活动中均有佳绩，并多人多次获得国家励志奖学金、省政府奖学金以及各类校内外奖学金。全院学生学风优良。毕业班考研率、就业率一直名列学校前列，并有多人出国留学和考取中科院、南京大学等知名院所和知名大学研究生。
　　在科学研究方面，“十五”以来，先后完成国家“863”项目1项，国家“十五”重点科技攻关2项，国家自然科学基金项目2项，江苏省和石化总公司重点科技攻关项目各1项，横向科研项目近100项。获得国家科技进步二等奖1项、国家石油和化学工业协会科技发明二等奖和科技进步三等奖各1项、江苏省科技进步三等奖1项，获得国内外授权专利数十件。目前，承担国家自然科学基金项目5项，江苏省重大科技成果转化项目1项，江苏省重大科技攻关项目1项，以及各类纵向和横向科研项目30余项。在国内外学术刊物上发表论文500余篇，其中SCI和EI论文200余篇。
　　在研究生培养方面，硕士、博士研究生的培养质量不断提高，先后有1篇论文被评为江苏省优秀博士论文，6篇论文被评为江苏省优秀硕士论文，多个项目获得省和学校研究生创新资金的资助。
　　在学科建设方面，通过制订和实施学科建设与发展规划，各个学科水平不断提升，应用化学专业被评为江苏省特色专业（建设点），通过人才引进和竞争机制的建立，大批优秀中青年骨干教师脱颖而出。所有这一切，都为学院的进一步发展提供了坚实的保障。