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南京工业大学生物与制药工程学院研究生导师简介-严 明

南京工业大学 免费考研网/2013-12-26

严明,副教授,硕士生导师。1996年于南京大学获生物化学理学硕士学位,1997-2000年在南京军区南京总医院检验中心工作,2001年至今在南京工业大学从事生物信息学与微生物应用技术的科研和教学工作,作为生物信息学研究室负责人,在蛋白质工程和代谢工程等领域的应用研究积累了丰富的经验。近年来参加了国家973项目“新一代生物催化与生物转化的科学基础”和“人工合成细胞工厂”等多项国家与省部级研究项目。现为国家973项目“化学品生物合成代谢网络的计算模拟与途径设计”子课题负责人。在国内外检索期刊上发表论文30余篇,其中SCI论文10余篇,申请国家发明专利10余项,译有《比较基因组学手册:原理与方法》一书。所在的基因工程与生物信息学研究室现有教职工7人,研究生15人,已培养博士生6人,硕士生19人。课题组致力于建立微生物基础研究与终端产品之间的桥梁,加强由实验室研发成果向工业化生产的能力。研究方向1、代谢工程与合成生物学通过对微生物菌株各种重要生化调控和代谢网络途径的注释、重构和分析,在微生物细胞的各种网络层次上整合各种组学数据进行模型构建和模型优化,从而阐明微生物代谢途径与代谢网络间的相互关系以及重要生物基产品的代谢流流向与调控的关键分子机制,在此基础上提出代谢工程的优化策略。对重要化工产品,根据其结构特征,确定可能的生化反应类型,设计各种人工生物合成路线。利用合理设计、合成和定向进化的酶,代谢途径以及细胞来生产新型的或改善的各种高附加值生物基化学品。2、酶的结构生物学与生物信息学借助结构生物学和生物信息学技术深入研究重要工业酶的序列、结构和功能关系,在对酶蛋白三维空间结构进行解析的基础上,通过对酶蛋白进行构效解析、理性设计和定向进化,提出理性设计和定向进化策略来生产新型和改良工业酶。3、精细化学品的生物催化与转化开展工业生物催化剂及其催化过程的研究,采用酶或全细胞催化技术,生产化学法难以转化与合成的新型生物产品,或替代现行化学合成工艺中的复杂步骤。研究生物体及其酶进行定向物质转化的分子机制,开发新的生物合成技术。开发化工原料、医药原料、手性化合物、功能糖与糖基化学品等高值精细化学品的高效生物合成技术,以生物技术改造化学工业过程。近年来发表SCI文章1.YangX,LeiG,YingH,XuL,YanM:Enhancingtheproductionofuridine5'-monophosphatebyrecombinantSaccharomycescerevisiaeusingawholecellbiocatalyticprocess.WorldJournalofMicrobiologyandBiotechnology2011:1-7.2.LiuH,LiuK,YanM,XuL,OuyangP:gTMEforImprovedAdaptationofSaccharomycescerevisiaetoCornCobAcidHydrolysate.AppliedBiochemistryandBiotechnology2011:1-10.3.YeQ,LiX,YanM,CaoH,XuL,ZhangY,ChenY,XiongJ,OuyangP,YingH:High-levelproductionofheterologousproteinsusinguntreatedcanemolassesandcornsteepliquorinEscherichiacolimedium.Appliedmicrobiologyandbiotechnology2010,87(2):517-525.4.YeQ,CaoH,ZangG,MiL,YanM,WangY,ZhangY,LiX,LiJ,XuL:Biocatalyticsynthesisof(S)-4-chloro-3-hydroxybutanoateethylesterusingarecombinantwhole-cellcatalyst.Appliedmicrobiologyandbiotechnology2010:1-9.5.YeQ,CaoH,YanM,CaoF,ZhangY,LiX,XuL,ChenY,XiongJ,OuyangP:Constructionandco-expressionofapolycistronicplasmidencodingcarbonylreductaseandglucosedehydrogenaseforproductionofethyl(S)-4-chloro-3-hydroxybutanoate.Bioresourcetechnology2010,101(17):6761-6767.6.YeQ,CaoH,MiL,YanM,WangY,HeQ,LiJ,XuL,ChenY,XiongJ:Biosynthesisof(S)-4-chloro-3-hydroxybutanoateethylusingEscherichiacolico-expressinganovelNADH-dependentcarbonylreductaseandaglucosedehydrogenase.Bioresourcetechnology2010.7.YaoT,XuL,YingH,HuangH,YanM:Thecatalyticpropertyof3-hydroxyisobutyratedehydrogenasefromBacilluscereuson3-hydroxypropionate.AppliedBiochemistryandBiotechnology2010,160(3):694-703.8.YangX,XuL,YanM:Modelingmetabolicresponsetochangesofenzymeamountinyeastglycolysis.AfricanJournalofBiotechnology2010,9(41):6894-6901.9.LiuH,YanM,LaiC,XuL,OuyangP:gTMEforimprovedxylosefermentationofSaccharomycescerevisiae.AppliedBiochemistryandBiotechnology2010,160(2):574-582.10.HaoN,YanM,ZhouH,LiuH,CaiP,OuyangP:TheeffectofAmtRongrowthandaminoacidsproductioninCorynebacteriumglutamicum.AppliedBiochemistryandMicrobiology2010,46(6):561-566.11.HaoN,LiY,YanM,OuyangPK:PredictionandanalysisofthesecreteomicinCorynebacteriumglutamicumATCC13032.AfricanJournalofBiotechnology2010,9(11):1561-1567.12.CaoH,MiL,YeQ,ZangG,YanM,WangY,ZhangY,LiX,XuL,XiongJetal:PurificationandcharacterizationofanovelNADH-dependentcarbonylreductasefromPichiastipitisinvolvedinbiosynthesisofopticallypureethyl(S)-4-chloro-3-hydroxybutanoate.Bioresourcetechnology2010.13.YeQ,YanM,YaoZ,XuL,CaoH,LiZ,ChenY,LiS,BaiJ,XiongJ:Anewmemberoftheshort-chaindehydrogenases/reductasessuperfamily:Purification,characterizationandsubstratespecificityofarecombinantcarbonylreductasefromPichiastipitis.Bioresourcetechnology2009,100(23):6022-6027.14.YeQ,YanM,XuL,CaoH,LiZ,ChenY,LiS,YingH:AnovelcarbonylreductasefromPichiastipitisfortheproductionofethyl(S)-4-chloro-3-hydroxybutanoate.Biotechnologyletters2009,31(4):537-542.15.XuW,YanM,XuL,DingL,OuyangP:Engineeringtheactivityofthermophilicxyloseisomerasebysite-directedmutationatsubunitinterfaces.EnzymeandMicrobialTechnology2009,44(2):77-83.16.XuW,CaiP,YanM,XuL,OuyangP:MolecularDynamicsSimulationofTemperature-dependentFlexibilityofThermophilicXyloseIsomerase.ChineseJournalofChemicalPhysics2009,22:467.17.XUW,CAIP,YANM,XUL,OUYANGPK:MoleculardockingofxylitolandxyloseisomerasefromThermusthermophilusandmodelanalysis.ChemJChinUniv2007,28:971-973.18.LiY,YanM,WangK,XuL,XuW,OuyangP:StudyondsRNAMediatedGeneSilencinginSaccharomycescerevisiae:SuppressingtheExpressionofGRE3Gene.PROGRESSINBIOCHEMISTRYANDBIOPHYSICS2007,34(3):292-298.联系方式工作地点:生工学科楼A1-513办公电话:025-58139914E-mail:yanming@njut.edu.cn
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