会计学院是南京财经大学规模最大、办学历史最为悠久的院（系）之一。早在1962年就设立了财会专业。1981年成立会计系并开始招收财务会计专业本科生，系江苏省第一个会计本科专业点。2000年，在原南京经济学院、江苏高等财经专科学校和江苏省经济干部管理学院三校会计系的基础上合并重组为会计学院。四十多年来，学院“会八方才俊，计天下财富”，实现了跨越式的发展，已成为江苏省中高级财会专业人才的重要培养基地。
　　学院现有会计学硕士、会计硕士、资产评估硕士3个，会计学、财务管理、审计学、资产评估等本科专业4个。其中，会计学专业为江苏省首批品牌专业，2009年入选国家级高等学校特色专业建设点，会计学学科为江苏省重点建设学科，财务管理专业为校级特色专业、校级品牌建设专业。会计学和审计学专业自2005年起在江苏列入一本招生。全院现有在校学生5538人，其中研究生254人，本科生人5284人。学院设有会计学系、财务管理系、审计学系、资产评估系、会计实验中心、会计与财务研究所等教学科研机构，专任教师73人。其中教授13人，副教授40人，讲师15人，博士26人。已形成一支结构合理、经验丰富、科研能力强的师资队伍。
　　学院坚持以教学为中心，积极推进课程体系与教学内容改革。2000年以来，共建成1个省级优秀课程群、2门省级一类优秀课程、1门省级二类精品课程。本着科研促进教学、服务教学、服务地方经济建设的宗旨，学院通过强化科研管理，凝练研究方向，促进产学研的有机结合。2003以来，学院教师主持并完成部省级以上科研项目15项，服务地方经济的横向课题16项，出版专著7部，获得省级教学、科研奖2项，在《管理世界》、《会计研究》、《审计研究》等期刊公开发表学术论文559篇，其中在核心期刊上发表论文347篇。
　　学院按照“抓住基本的，提倡多样化”的学生工作思路，加强学生教育管理，积极开展丰富多彩的第二课堂活动，引导学生牢记责任、明确目标、端正学风、彰显个性、提升综合素质，取得了明显成效。2003年以来，学院在校学生在省级以上科技、文化、体育等各类竞赛中共有139人次获奖。
　　展望未来，学院将依托学校多学科交融的办学平台，以会计学为主体，以财务管理、审计学为两翼，资产评估为补充，以本科素质教育为重心，高起点的研究生培养为突破口，立足长江三角洲，面向全国，注重信息化、国际化，打品牌、抓特色、出成果，努力把南京财经大学会计学院建设成为同类学科中省内一流、国内有竞争优势的教学研究型学院。