药物化学学科历史较长、人才较多、优势明显。1981年被国务院批准为硕士、博士学位授予点,1989年被批准为国家重点学科,1991年批准可招收博士后。学科带头人为中国工程院院士、博士生导师彭司勋教授。本学科点师资力量雄厚,现有教职工52人(包括中药学院的天然药物化学教研室人数),教授18人,博士生导师13人,副教授11人,具有博士学位的教师8人,年轻教师中90%以上具有硕士学位。教师中有9人享受国家特殊津贴。在国内较早开展了创新药物及基础研究,先后承担国家新药基金项目10多项,其中3项得到国家科技部“1035工程”的资助。获省部级以上科研教学成果奖30多项,其中国家级奖励3项。已招收研究生220多名,人才培养质量受到社会好评。1993年、1999年先后两次被评为江苏省优秀学科梯队。
药剂学学科是我国成立最早的药学学科之一,早在1936年中国药科大学前身“国立药专”建立之时,就已成为我校支柱学科之一。现今为博士点,并可招收博士后。1994年被批准为江苏省重点学科。有教职工34人,其中教授6人,博士生导师4名,副教授级10名,除学生实验室及研究生实验室外,还建有具有中试规模的固体制剂实验室等专用实验室,以及精密仪器室数间。实验室条件以及仪器设备在国内较为先进,仪器设备及试剂药品等现有固定资产值约为人民币300万元左右,有力地支撑了本学科多层次教学与科研工作的开展。