由于大豆基因组大和基因组复杂，大豆重要农艺性状基因的定位克隆一直是大豆分子遗传学研究中的难点。我所大豆功能基因组学学科组的研究人员通过与山东师范大学、中科院上海生命科学研究院和中山大学等科研单位的合作，建立了利用全基因组测序信息开发INDEL分子标记快速定位大豆基因的新方法。
　　研究组成员通过对大豆“菏豆12”品种的全基因组重测序，获得了与“Willams82”品种存在差异的49,276个INDEL分子标记和242,059个SNP分子标记。通过对其中243个INDEL分子标记的实验验证，建立了165个INDEL分子标记大豆分子标记物理图谱。利用该图谱和进一步开发的INDEL分子标记成功地将大豆叶皱突变体定位到了360Kbp的关联区间。本研究为大豆重要农艺性状基因克隆和分子辅助育种等研究提供了重要的研究手段。

大豆INDEL分子标记物理图谱
　　
　　本研究成果10月19日在G3:Genes|Genomes|Genetics杂志上在线发表。我所大豆分子设计育种重点实验室的合作培养博士生宋晓峰和我所魏海超博士为论文共同第一作者、冯献忠研究员和张慧教授为论文责任作者。本研究得到国家自然科学基金的资助。
　　论文信息：Xiaofeng Song, Haichao Wei, Wen Cheng, Suxin Yang, Yanxiu Zhao, Xuan Li, Da Luo, Hui Zhang, Xianzhong Feng . Development of INDEL Markers for Genetic Mapping Based on Whole-Genome Re-sequencing in Soybean。
　　论文连接：
http://www.g3journal.org/content/early/2015/10/13/g3.115.022780.full.pdf+html