吉林大学畜牧兽医学院的历史最早可追溯到清政府创办的北洋马医学堂。始建于1904年。新中国成立后，于1953年由朱德总司令题写校名，组建成为中国人民解放军兽医大学，1992年由原中央军委主席江泽民同志题写校名，更名为中国人民解放军农牧大学，1999年更名为中国人民解放军军需大学。2004年原军需大学转隶并入吉林大学后，改建为吉林大学畜牧兽医学院。作为中国现代兽医教育的摇篮，她开创了我国兽医本科和研究生教育的先河，培养了一大批高层次的专业技术人才，为我国畜牧兽医事业的发展做出了历史性贡献。2004年8月，吉林大学畜牧兽医学院隆重举行中国现代兽医教育百年庆典，教育部常务副部长张宝庆同志参加了庆典，并亲自为“中国现代兽医教育百年”纪念石揭幕。
　　学院教学科研体系完善，师资力量雄厚。现设有基础兽医学系、临床兽医学系、预防兽医学系、动物生物技术系、动物遗传育种与繁殖系、动物营养与饲料科学系等6个教学单位；设有动物机能与形态学研究室、动物营养代谢病与中毒病研究室，动物重要病原与疫病研究室、动物生物技术研究室、动物遗传繁育工程研究室和人兽共患病研究所等6个科研单位；设有动物疾病诊断与防治中心、动物繁育与饲料研发中心、动物科技实验教学中心等3个实习、实验基地。拥有教师87人，其中教授32人，副教授25人，博士生导师41人（兼职9人），硕士生导师29人(兼职9人)，12人在国家级学会及专业委员会任副理事长以上学术职务，31人享受国务院特殊津贴，先后培养2名中国工程院院士。
　　 学院现开设动物医学、动物科学、生物技术3个本科专业；动物药学、宠物医学、实验动物学、兽医公共卫生学、动物生物技术、生物制药等6个专业方向。动物医学专业是学院的品牌专业，兽医学科处于国内领先水平和国际先进水平。2004年国家一级学科水平评估列第五名，学院从20世纪五十年代就开始培养研究生，是全国首批博士、硕士学位授权单位。学院现有1个国家重点学科(预防兽医学)；2个博士后科研工作流动站(兽医学、生物化学与分子生物学)；5个博士学位授权学科(生物化学与分子生物学、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、动物遗传育种与繁殖学)；9个硕士学位授权学科(动物学、微生物学、生物化学与分子生物学、动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、军事预防医学)。1978年以来，学院共获各类教学科研成果奖340余项。目前，承担国家自然科学基金重点课题 、国家攻关课题、“863”、“973”课题、欧盟框架、中法先进计划及省部级科研项目70余项。
　　 学院坚持开放办学，注重国际交流，先后同日本、美国、法国、丹麦、瑞典、德国、新西兰等20多个国家的院校、科研机构保持密切的学术联系。与日本北里大学签订协议，定期互派访问学者和留学生。
　　 吉林大学畜牧兽医学院将立足国家科技知识创新体系的需求，充分发挥学科专业、人才培养、科学研究、师资队伍的优势和特色，努力使学科整体达到国内先进水平，重点学科接近或达到国际领先水平，成为国家高质量创新人才培养、高水平科学技术研究和成果转化的重要基地，以实现“创建国内高水平研究型畜牧兽医学院”的宏伟目标。