吉林大学学科门类齐全，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、军事学等全部12大学科门类；有博士学位授权一级学科39个，博士学位授权点240个，博士专业学位3个；有硕士学位授权一级学科52个，硕士学位授权点311个，硕士专业学位29个；有本科专业 124个；有博士后科研流动站37个；有一级学科国家重点学科4个（覆盖17个二级学科），二级学科国家重点学科15个，国家重点（培育）学科4个,省重点学科95个；有21个“211工程”重点学科建设项目；有5个新一轮“985工程”建设项目。

　　【一级学科国家重点学科】
　　◇ 数学
　　· 基础数学
　　· 计算数学
　　· 概率论与数理统计
　　· 应用数学
　　· 运筹学与控制论
　　◇ 化学
　　· 无机化学
　　· 分析化学
　　· 有机化学
　　· 物理化学-含：化学物理
　　· 高分子化学与物理
　　◇ 机械工程
　　· 机械制造及其自动化
　　· 机械电子工程
　　· 机械设计及理论
　　· 车辆工程
　　◇ 地质资源与地质工程
　　· 矿产普查与勘探
　　· 地球探测与信息技术
　　· 地质工程

　　【二级学科国家重点学科】
　　马克思主义哲学 　　　　数量经济学
　　法学理论 　　　　　　　刑法学
　　政治学理论 　　　　　　考古学及博物馆学
　　原子与分子物理 　　　　凝聚态物理
　　生物化学与分子生物学 　材料加工工程
　　微电子学与固体电子学 　计算机软件与理论
　　农业机械化工程 　　　　预防兽医学
　　神经病学

　　【国家重点（培育）学科】
　　材料学 　　　　　　　　　　　　交通信息工程及控制
　　基础兽医学 　　　　　　　　　　技术经济及管理
　　政治经济学 　　世界经济 　　　人口、资源与环境经济学
　　区域经济学 　　刑法学 　　　　民商法学
　　政治学理论 　　国际政治 　　　社会学
　　人口学 　　　　思想政治教育 　汉语言文字学
　　中国现当代文学 日语语言文学 　考古学及博物馆学
　　历史文献学 　　基础数学 　　　应用数学