开创恶性肿瘤升压化学药物疗法。化学药物治疗是中晚期恶性肿瘤治疗的主体，疗效取决于抗癌药物到达癌组织的浓度及停留时间，两者均与肿瘤血流密切相关。李玉林教授选择我国多发的胃癌和肺癌等中晚期恶性肿瘤进行疗效研究。结果显示，AngⅡ升压药物治疗的患者，肿瘤缩小明显，复发时间推迟，有效率、完全缓解率及5年生存率均优于单纯化疗病人，相反脱发和胃肠道反应等副作用明显减轻。由此开创了恶性肿瘤升压化学药物疗法，1995年获卫生部医药科技进步奖。
    二、创新干细胞组织工程技术，提高我国再生医学研究水平
    毛囊间充质干细胞的获取及其价值的理论建树。李玉林教授从人毛囊组织中成功地分离出能分化成软骨、脂肪及骨等多种间叶成分的间充质干细胞，这在国际上属首次发现。由于毛囊组织来源充分，取材无创，由此建立的分离纯化、储存运输及诱导分化的标准化技术以获取大量干细胞，为干细胞组织工程的基础研究及应用找到了新的种子细胞来源。另外，毛囊属上皮组织，在上皮组织内含有具有多向分化潜能的间充质干细胞，能够参与皮肤以外多种损伤组织，如肌肉、血管和骨组织的修复，这一发现是人类对自身认识的重要突破，极具科学意义和应用价值。
    毛囊间充质干细胞组织工程构建的技术突破。利用毛囊间充质干细胞，通过生物反应器技术快速生产具有色素效果、表皮特性和功能的组织工程表皮，已用于皮肤慢性溃疡和局灶性白癜风的治疗。利用组织特异性启动子从毛囊间充质干细胞中分离血管平滑肌祖细胞，成功构建了组织工程血管。该血管具有弹性、切应力和收缩力，并具有良好的组织相容性和抗血栓形成作用。诱导分化的软骨细胞在体外构建的组织工程软骨，能再现天然软骨组织的形态和代谢功能。体内实验证明能有效地修复缺损的关节面软骨。利用重编程技术在国际上首次将毛囊间充质干细胞诱导为iPS细胞,为干细胞的基础研究和应用开辟了更为广阔的空间。
    毛囊干细胞理论与技术对我国再生医学研究的促进。毛囊间充质干细胞理论与技术突破，既推动了再生医学及相关学科的进步，又带功了相关技术及产品的产业化。《用于体外大量扩增的毛囊干细胞培养方法》正在申请国际发明专利（申请号pct/cn20112/001186），在北美、欧盟等国已通过审查，现已进入中国国家阶段。在申请专利的同时，已与强势企业合作，组建了我国东北地区最大的干细胞工程技术研究中心，同时建立了世界首家达GMP标准的人毛囊间充质干细胞库。 2004年建成至今实现产值过亿元，纯利润0.24亿。构建的组织工程表皮等工程材料，已用于慢性皮肤溃疡、外伤所致的大面积皮肤缺失以及青少年白癜风的治疗。
教学情况:  主持国家《面向21世纪临床医学专业课程体系优化研究》，在国内首次提出按知识、能力和素质的目标要求，构建了临床医学专业人才培养的模块化课程体系，被教育部肯定并推广。该研究2001年获吉林省教学成果奖一等奖和国家教学成果奖二等奖。主讲的《病理学》课程，2006年被评为国家精品课程。所带领的群体被评为国家级优秀教学团队。李玉林教授2007年被评为国家教学名师。2000年前后，在系统进行国际综合大学医学教育管理体制研究后，提出了《我国综合大学医学教育管理体制和运行机制的政策建议》，教育部已采纳并写进2012年《教育部、卫生部关于实施临床医学教育综合改革的意见》的文件中。
科研成果: 主持国家863计划重大专项等重大、重点项目3项，发表系列论文239篇，其中SCI收录论文27篇，最高影响因子11.65。
期刊论文(近3年发表文章)

1. Liu X, Song L, Liu J, Wang S, Tan X, Bai X, Bai T, Wang Y, Li M, Song Y, Li Y. miR-18b inhibits TGF-β1-induced differentiation of hair follicle stem cells into smooth muscle cells by targeting SMAD2. Biochem Biophys Res Commun. 2013; 438(3):551-556.

2. Zhang M, Wang J, Li C, Hu N, Wang K, Ji H, He D, Quan C, Li X, Jin N, Li Y. Potent growth-inhibitory effect of a dual cancer-specific oncolytic adenovirus expressing apoptin on prostate carcinoma. Int J Oncol. 2013; 42(3):1052-1060.

3. Wang Y, Liu J, Tan X, Li G, Gao Y, Liu X, Zhang L, Li Y. Induced pluripotent stem cells from human hair follicle mesenchymal stem cells. Stem Cell Rev. 2013; 9(4):451-460.

4. He J, Li Y, Yang X, He X, Zhang H, He J, Zhang L. The feedback regulation of PI3K-miR-19a, and MAPK-miR-23b/27b in endothelial cells under shear stress. Molecules. 2012; 18(1):1-13.

5. Zhang X, Wang Y, Gao Y, Liu X, Bai T, Li M, Li L, Chi G, Xu H, Liu F, Liu JY, Li Y. Maintenance of high proliferation and multipotent potential of human hair follicle-derived mesenchymal stem cells by growth factors. Int J Mol Med. 2013; 31(4):913-921.

6. Deng Y, Foley EM, Gonzales JC, Gordts PL, Li Y, Esko JD. Shedding of syndecan-1 from human hepatocytes alters very low density lipoprotein clearance. Hepatology, 2012; 55(1):277-286.

7.Li Y, He X, Li Y, He J, Anderstam B, Andersson G, Lindgren U. Nicotinamide phosphoribosyltransferase (Nampt) affects the lineage fate determination of mesenchymal stem cells: a possible cause for reduced osteogenesis and increased adipogenesis in older individuals. J Bone Miner Res. 2011; 26(11):2656-2664.

8. Yang XF, He X, He J, Zhang LH, Su XJ, Dong ZY, Xu YJ, Yan Li, Li YL. High efficient isolation and systematic identification of human adipose-derived mesenchymal stem cells.J Biomed Sci. 2011; 18(1):59.

9.Zhao JW, Gao ZL, Mei H, Li YL, Wang Y. Differentiation of human mesenchymal stem cells:the potential mechanism for estrogen-induced preferential osteoblast versus adipocyte differentiation. Am J Med Sc. 2011; 341(6):460-468.