动物科学技术学院历经江西农学院畜牧兽医学院、江西共产主义劳动大学总校牧医系、江西农业大学牧医系，其前身是国立中正大学农学院畜牧兽医系。1992年成立江西农业大学畜牧兽医学院，1996年更名为动物科学技术学院。

　　学院党委下设动科支部、动医支部、水产支部、饲料所及机关产业支部、重点实验室支部、研究生支部和学生支部七个党支部。现任党委书记熊红华。

　　学院行政下设行政办、教学办、学工办和动物科学系、动物医学系、水产系，并设有江西省饲料科学研究所等7个研究所（室），有9个实验室，仪器设备总值3000余万元，其中动物生物技术实验室是江西省第一个重点开放实验室、农业部重点开放实验室、江西省唯一的省部共建国家重点实验室培育基地。学院建有江西农大种猪场、江西农大兽医院等校内实训基地，另有十多个校外实训基地。现任院长瞿明仁，副院长熊红华（兼）、陆伟、胡国良。

　　学院现有在职教工98人，其中管理岗位5人，专业技术岗位84人，工勤技能岗位9人。在专业技术岗位人员中，有正高12人，副高45人，中级及以下27人。学院教师中已获博士学位31人，正在攻读博士学位12人。学院有博士生导师4人，硕士生导师25人，有国家百千万人才工程人选2人，江西省百千万人才工程人选6人，有井冈学者特聘教授1人，国家农业化体系岗位科学家3人，国家有突出贡献的中青年专家1人，国家杰出专业技术人才1人，江西省跨世纪学术带头人3人，江西省高校中青年学科带头人7人，江西省高校中青年骨干教师4人，校首席教授1人，未来之星10人。

　　学院已形成本科、硕士、博士并举的教育培养体系，现设有1个博士后流动站，1个博士点，6个学士学位硕士点，2个专业学位硕士授予点，有动物科学、动物医学、水产养殖学、动物药学4个本科专业，在校学生1012人，其中博士生13人，硕士生78人，本科生921人。另有专业学位硕士生55人。

　　学院高度重视教学工作，大力推进本科“质量工程”建设，强化实践特色，坚持每年安排应届毕业生轮流到校内基地实习，在教师中开展“优秀授课教师”评选活动，鼓励教师积极申报各类教学研究课题和从事教学研究。2007年，“动物科技学院实践教学体系的建设与实践”教研课题获江西省教学成果一等奖，动物科学专业被批准为国家二类特色专业，江西省仅获2个。2008年，“动物营养与饲料科学教学团队”被批准为江西省教学团队，“动物生产与疫病防控实验教学示范中心”被批准为江西高校实验教学示范中心，动物医学专业被批准为江西省特色专业。

　　学院切实加强学科建设，不断增强学院发展后劲。通过加强人才培养，组建学科团队及加强基础平台建设，学科建设取得好成绩。2006年，“动物遗传育种与繁殖学”、“特种经济动物饲养学”获得了“十一五”重点学科。“动物营养与饲料科学”获得了江西省第二批示范性硕士点。2008年，“动物遗传育种与繁殖学”、“特种经济动物饲养学”2个省级重点学科顺利通过了中期检查与考核，并获得好评，将继续得到重点支持。2008、2010年分别有一篇硕士毕业论文被评为第二届、第三届全国兽医专业学位优秀硕士学位论文。2009年，“动物遗传育种与繁殖”学科成为“江西省重中之重学科”，“动物营养与饲料科学实验室”成为江西省高等学校重点实验室,学院畜牧学获得江西省研究生教育创新基地（第一批）。

　　学院科研实力雄厚，成果丰硕。自2000年以来，共获批各级各类项目150余项，经费6000余万元，在国家级学术期刊上发表论文1400余篇，其中SCI收录120余篇，主编或参编国家级教材40余部，获得专利10余项。科研项目涵盖国家自然科学基金杰出青年基金（总理基金）、国家转基因重大专项、863、973计划、国家现代农业产业技术体系岗位科学家资助计划、国家公益性行业科研重大专项、国家农业科技成果转化资金项目、国家自然科学基金及江西省各级各类课题等。科研成果获国家科技进步二等奖一项，江西省自然科学一等奖1项，江西省科技进步一等奖1项、二等奖5项、三等奖3项，农业部全国农牧渔业丰收奖二等奖2项、三等奖6项，江西省自然科学三等奖2项等等。

　　学院学生工作坚持“以生为本”的工作理念，2006、2007、2008、2009连续四年被评为校学生工作先进单位和校宣传工作先进单位。学院积极发展专业兴趣小组，先后成立了养禽、养蜂、水产、宠物等兴趣小组，对每个小组给予一定的经费支持，努力探索第一和第二课堂相融合的培养模式。学院大力引导学生考研，每年研究生录取率稳定在30%左右，就业率达95%以上。

　　自2006年以来，学院有1人获“全国杰出专业技术人才”荣誉称号，1人获“全国优秀教师”光荣称号，1人获第十一届“中国青年五四奖章”荣誉称号，1人被评为“江西省优秀共产党员”，1人获“江西省教育系统优秀共产党员”光荣称号，1人获全省“十佳青年教师”荣誉称号，1人获“江西省师德标兵”荣誉称号，1人获江西省农业科教人员突出贡献奖，1人获“江西省优秀科技工作者”称号，1人获“全国兽医专业学位硕士论文优秀指导教师”称号，1人获江西省优秀研究生指导教师荣誉称号，1人获“民革先进个人”称号，1人获“民进先进个人”称号，1位学生获“江西省优秀共青团员”称号。