吉首大学医学院是吉首大学目前最大的二级学院，也是该校最具发展潜力的院系之一。学院组建于2000年，现有教职工112人，下设医学基础课部、临床医学一系、临床医学二系、护理系、中医系。学生总数1700余人，目前开设临床医学、护理学、针灸推拿学三个全日制专科专业，面向全国部分省、市、区招收高中毕业生和职高对口生。

　　学院学统深厚，曾培养出一大批医学名家和知名学者，如中南大学精神卫生系主任、国内知名精神医学专家、博士生导师张亚林教授；国内著名“送子观音”莫氏姐妹莫淑贞、莫淑玉医师；国内知名青年作家蔡测海以及赴海外留学的十多名博士、硕士。一大批医学名家也曾在本院执教。如国内著名肝胆外科学家吴金术教授；南丁格尔奖获得者周娴君主任护师。

　　学院拥有自成体系的教学楼、实验楼等，建筑总面积35000平方米，拥有医学图书馆、阅览室、语音室及现代化的微机中心，实验室面积5573平方米。医学院直接管理的教学仪器总值已达近600万元，分子生物学研究中心、电镜室等正在筹建中。拥有全省一流的形态学实验中心，与全校共享的公共课及部分基础课教学仪器设备500多万元。可使用的教学仪器设备总值近1200万元，拥有两所附属医院，具有价值近亿元的教学及医疗设备，为学生临床课教学和见习提供了有力保障。

　　历年来，学院教师在学术科研中取得了较多成果，初步形成了“中医小儿推拿疗法及脏腑相关理论、理论医学及心身医学、民族人类学和体质学、中医药理论现代机理”等多个富有特色的研究方向。近年来，发表学术论文数百篇，出版专著和教材、教参十多部。目前，主持着20多个科研项目和教研课题，医学学术科研发展势头良好，为学院上层次、上水平打下良好基础。

　　目前，医学院在学校大力支持下，按照江泽民总书记“三个代表”思想的要求，遵循“立足湘西、面向边区、辐射全国、办出特色”的工作思路，以改革创新为动力，以师资队伍建设为根本，以提升教学质量为核心，大力搞好学科与专业建设，努力构筑湘、鄂、渝、黔四省（市）边区高等医学教育的“新平台”，争取在今明两年“升本”成功，并向更高目标冲刺。