邓磊2014年09月15日 09:59点击：[]
导师信息 姓名： 邓磊
性别： 男
年龄： 1982年9月
职称： 副教授
职位：
专业方向： 数据挖掘、生物计算
所属学院： 软件学院
学科名称： 软件工程
邮箱： leideng@csu.edu.cn
个
人
简介：
邓磊，男，1982年生，工学博士，中南大学软件学院副教授。2005年6月获中南大学计算机科学与技术专业学士学位；2008年6月获中南大学计算机应用技术专业硕士学位；2012年6月获同济大学计算机应用技术专业博士学位；2010年9月至2011年9月在美国哥伦比亚大学联合培养一年；2012年9月开始在中南大学任教；2013年10月至2014年10月在美国哥伦比亚大学计算生物与生物信息学中心从事博士后研究。主要研究数据挖掘和生物信息学，主持国家自然科学基金青年基金1项、教育部博士点基金新教师基金1项，参与过多项国家863项目、国家自然科学基金项目和省部级项目，取得了一定的研究成果，在《Nature》、《Nucleic Acids Research》、《BMC Systems Biology》、《BMC Bioinformatics》、《Journal of ComputationalBiology》和《IEEE/ACM Transactions on ComputationalBiology and Bioinformatics》等著名国际期刊以及生物信息学领域顶级学术会议RECOMB上发表过学术论文。知名国际会议APBC 2014、APBC 2015程序委员会委员。2013年同济大学优秀博士学位论文
主要论著
- Deng L and Chen Z. An Integrated Framework for Functional Annotation of Protein Structural Domains. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2015, 出版中，doi:10.1109/TCBB.2015.** （SCI检索）
- Deng L, Zhang QC, Chen Z, Meng Y, Guan J and Zhou S. PredHS: a web server for predicting protein–protein interaction hot spots by using structural neighborhood properties. Nucleic Acids Research, 2014, 42:W290-5 （SCI检索）
- Deng L, Guan J, Wei X, Yi Y and Zhou S. Boosting Prediction Performance of Protein-Protein Interaction Hot Spots by Using Structural Neighborhood Properties. Journal of Computational Biology, 2013, 20(11):878-91 （SCI检索）
- Zhang QC, Petrey D, Deng L, Qiang L, Shi Y, Chan A, Bisikirska B, Lefebvre C, Accili D, Hunter T, Maniatis T, Califano A and Honig B. Structure-based prediction of protein-protein interactions on a genome-wide scale. Nature, 2012, 490:556-560（SCI检索）
- Zhang QC*, Deng L*(*共同第一作者), Fisher M, Guan JH, Honig B and Petrey D. PredUs: a web server for predicting protein interfaces using structural neighbors. Nucleic Acids Res, 2011, W283-7 （SCI检索）
- Deng L, Guan JH, Dong QW and Zhou SG. SemiHS: An Iterative Semi-supervised Approach for Predicting Protein-protein Interaction Hot Spots. Protein and Peptide Letters. 2011, 18(9):896-905. (SCI检索)
- Zhang QC, Petrey D, Garzon J, Deng L and Honig B. PrePPI: a structure-informed database of protein-protein interactions. Nucleic Acids Res. 2013, 41(D1):D828-33. （SCI检索）
- Xu B, Wei X, Deng L, Guan JH and Zhou S. A Semi-supervised Boosting SVM for Predicting Hot Spots at Protein-protein Interfaces. BMC Systems Biology. 2012, 6(Suppl 2):S6. （SCI检索）
- Dong Q, Zhou S, Deng L and Guan J. Gene ontology-based protein function prediction by using sequence composition information. Protein and Peptide Letters. 2010, 17(6):789-95. （SCI检索）
- Deng L, Guan JH, Dong QW and Zhou SG. Prediction of protein-protein interaction sites using an ensemble method. BMC Bioinformatics. 2009, 10:426 （SCI检索）
- Deng L, Zhang QC, Chen Z, Meng Y, Guan J and Zhou S. PredHS: a web server for predicting protein–protein interaction hot spots by using structural neighborhood properties. Nucleic Acids Research, 2014, 42:W290-5 （SCI检索）
- Deng L, Guan J, Wei X, Yi Y and Zhou S. Boosting Prediction Performance of Protein-Protein Interaction Hot Spots by Using Structural Neighborhood Properties. Journal of Computational Biology, 2013, 20(11):878-91 （SCI检索）
- Zhang QC, Petrey D, Deng L, Qiang L, Shi Y, Chan A, Bisikirska B, Lefebvre C, Accili D, Hunter T, Maniatis T, Califano A and Honig B. Structure-based prediction of protein-protein interactions on a genome-wide scale. Nature, 2012, 490:556-560（SCI检索）
- Zhang QC*, Deng L*(*共同第一作者), Fisher M, Guan JH, Honig B and Petrey D. PredUs: a web server for predicting protein interfaces using structural neighbors. Nucleic Acids Res, 2011, W283-7 （SCI检索）
- Deng L, Guan JH, Dong QW and Zhou SG. SemiHS: An Iterative Semi-supervised Approach for Predicting Protein-protein Interaction Hot Spots. Protein and Peptide Letters. 2011, 18(9):896-905. (SCI检索)
- Zhang QC, Petrey D, Garzon J, Deng L and Honig B. PrePPI: a structure-informed database of protein-protein interactions. Nucleic Acids Res. 2013, 41(D1):D828-33. （SCI检索）
- Xu B, Wei X, Deng L, Guan JH and Zhou S. A Semi-supervised Boosting SVM for Predicting Hot Spots at Protein-protein Interfaces. BMC Systems Biology. 2012, 6(Suppl 2):S6. （SCI检索）
- Dong Q, Zhou S, Deng L and Guan J. Gene ontology-based protein function prediction by using sequence composition information. Protein and Peptide Letters. 2010, 17(6):789-95. （SCI检索）
- Deng L, Guan JH, Dong QW and Zhou SG. Prediction of protein-protein interaction sites using an ensemble method. BMC Bioinformatics. 2009, 10:426 （SCI检索）
- Deng L, Guan JH, Dong QW and Zhou SG. Prediction of protein-protein interaction sites using an ensemble method. BMC Bioinformatics. 2009, 10:426 （SCI检索）
- Dong Q, Zhou S, Deng L and Guan J. Gene ontology-based protein function prediction by using sequence composition information. Protein and Peptide Letters. 2010, 17(6):789-95. （SCI检索）
- Xu B, Wei X, Deng L, Guan JH and Zhou S. A Semi-supervised Boosting SVM for Predicting Hot Spots at Protein-protein Interfaces. BMC Systems Biology. 2012, 6(Suppl 2):S6. （SCI检索）
- Zhang QC, Petrey D, Garzon J, Deng L and Honig B. PrePPI: a structure-informed database of protein-protein interactions. Nucleic Acids Res. 2013, 41(D1):D828-33. （SCI检索）
- Deng L, Guan JH, Dong QW and Zhou SG. SemiHS: An Iterative Semi-supervised Approach for Predicting Protein-protein Interaction Hot Spots. Protein and Peptide Letters. 2011, 18(9):896-905. (SCI检索)
- Zhang QC*, Deng L*(*共同第一作者), Fisher M, Guan JH, Honig B and Petrey D. PredUs: a web server for predicting protein interfaces using structural neighbors. Nucleic Acids Res, 2011, W283-7 （SCI检索）
- Zhang QC, Petrey D, Deng L, Qiang L, Shi Y, Chan A, Bisikirska B, Lefebvre C, Accili D, Hunter T, Maniatis T, Califano A and Honig B. Structure-based prediction of protein-protein interactions on a genome-wide scale. Nature, 2012, 490:556-560（SCI检索）
- Deng L, Guan J, Wei X, Yi Y and Zhou S. Boosting Prediction Performance of Protein-Protein Interaction Hot Spots by Using Structural Neighborhood Properties. Journal of Computational Biology, 2013, 20(11):878-91 （SCI检索）
