生物工程系现有教职工66人，专任教师45人，其中教授13人、副教授16人，具有博士学位者34人，是一支以高学历、高职称人员为主体，专业结构较为合理的师资队伍。目前专任教师中，有国家有突出贡献专家、新世纪创新人才支持计划、省管优秀专家、省跨世纪学术与技术带头人培养对象、省高等学校创新人才培养对象和省医药创新人才工程培养对象，以及河南省中青年骨干教师。为加快学科发展，生物工程系还聘请了中国科学院院士李季伦先生等10余人为兼职教授。近几年来，依托我校生命科学长期发展的深厚基础和学校的大力支持，生物工程系在教学、科研和学科建设上不断进取、开拓创新，实现了快速发展。
　　
　　生物工程系下设植物学、动物学、微生物学、细胞生物学、遗传学、生物化学和分子生物学7个教学研究室，共承担本科生专业课和素质教育课70多门，在教育技能和教学方法上积极探索，教学水平不断提高，先后有多人次获得“郑州大学十佳师德标兵”、“郑州大学青年教师讲课大赛奖”、“郑州大学多媒体讲课大赛奖”、“郑州大学三育人优秀个人”、“郑州大学学生最满意教师” 等先进荣誉。参照《国家级生物学基础课实验教学示范中心建设标准》建设的基础教学实验中心，投资870余万元，实验室面积近3000㎡，承担十五门专业实验课近100项实验，是我校生命科学实验教学的重要平台。昆虫标本室藏有河南昆虫27个目400多科的近13万号标本，全省馆藏量最大，特别是近期发现的700多个昆虫新物种模式标本，是极其宝贵的科学财富。正在建设和完善的生物信息室、资料室和动植物标本室以及列入学校规划的动植物实验园区是我系重要的教学辅助场所。
　　
　　生物工程系生物技术和生物工程本科专业目前在校学生647人。在本科生培养体系建设上，高水平完成了教学平台课程体系建设和教学实验中心建设。在教学理念上，注重学生现代生命科学和生物技术基础理论知识的掌握和现代生物技术基本技能、创新思维能力的培养。在培养模式上，借鉴国内外教学改革的先进经验，对学生实行“导师制”，使学生在学习方法、科学思维、研究能力、专业素质等方面得到迅速提高。
　　
　　生物工程系学科建设发展迅速，拥有河南省生物学一级重点学科和河南省高校实验教学示范中心。现有生物学一级硕士点和农学二级学科硕士学位授权点2个并有在职人员生物工程硕士学位授权点，目前已招生的二级学位点有：细胞生物学、植物学、生态学、动物学、微生物学、遗传学、生物化学及分子生物学、植物遗传育种、特种经济动物和生物工程硕士点。在校全日制研究生157人，工程硕士20余人。在圆满完成各项教学任务的同时，全系教职工根据国家和河南省科学技术发展规划，积极开展科学研究工作，逐渐形成了肿瘤标志物与基因工程、多肽生物化学、微生物发酵与代谢工程、遗传育种、动物生态和保护生物学、烟草生物技术、动物疫病快速检测技术等具有特色的研究方向，并有“郑州大学生物科学与技术研究中心”和“郑州大学生物多样性科学研究所(筹)”两个研究机构。近几年来，共承担国家和省部级科研项目24项，横向项目9项，获国家和省部级奖6项，发明专利12项，发表论文176篇。近3年拥有科研经费720万元。
　　
　　在加强创新人才培养工作、不断提高办学水平的同时，生物工程系立足河南、面向全国，与多家企业和科研机构开展了合作交流，积极探索服务于区域济建设和社会发展需要的办学模式。目前，按照学校发展战略规划和“高水平、高层次、高质量”办学的建系方针，生物工程系在人才、经费和学位点建设上，依托校内资源，加大校外的引进和合作的力度，积极凝炼明晰的学科发展方向、汇集较强的学科队伍、构筑一流的科研基地，逐步把生物工程系建设成教学研究型院系，成为河南省现代生命科学的人才、技术和研究中心。