电子信息工程系成立于1999年6月，9月面向全国招生。包含信号与信息处理教研室，应用电子教研室。现已毕业9届学生1000余人，在校学生数为400余人。年招生人数100余人。
　　本专业具有良好的学科基础。学院拥有1个博士后流动站——“机械工程博士后流动站”，1个一级学科硕士点——“机械工程”，2个二级学科博士点——“机械设计及理论”和“林业工程自动化”，9个二级学科硕士点——“机械设计及理论”、“机械制造及自动化”、“机械电子工程”、“车辆工程”、“控制理论与控制工程”、“检测技术及自动化装置”、“农业电气化及自动化”、“农业机械化工程”、“林业工程自动化”，3个专业硕士学位点——“机械工程领域”工程硕士、“农业机械化领域”农业推广硕士和“机械设计及理论”高等学校教师硕士，涉及“机械工程”、“控制科学与工程”、“农业工程”、“林业工程”4个一级学科。
　　学科除了承担本专业全部专业课外，还承担着其它学科部分教学任务，在教学法研究和教书育人等方面都取得了丰硕成果，并多次获得国家、省、校级奖励。编写教材20余部；完成的国家、省、校教改项目20余项。在科研方面，完成纵、横项科研项目近30余项，并获得省部级科技进步三等奖以上5项，申报专利4项，其中发明专利1项。发表教学和科研论文100余篇，SCI、EI论文20余篇。
　　电子信息综合实验室现有：信号与系统实验室、高频电子线路实验室、现代通信原理实验室、传感技术实验室、电子设计自动化（EDA）实验室、数字信号处理（DSP）实验室、电子综合实验室及大学生信息技术创新实验室，共计8个实验室和1个信息处理研究室。并与美国德州仪器（TI）公司联合建立了DSPS实验室。电子信息综合实验室主要承担，面向电子信息工程专业的22门专业基础课、专业课和7个课程设计及实习项目的实践教学项目。目前，电子信息专业实验室设备总资产达：260万元。实验室总面积：800 m2。
　　先后与长春一汽、沈阳东软、哈尔滨电机厂有限责任公司、阿城继电器股份公司、哈尔滨兴正电子有限公司、广州唯康通信技术有限公司签订了实习基地的协议；并与黑龙江省自动化研究所建立了合作办学关系；为实现“零适应期” 的优秀本科生的培养，通过校企联合办学将实践教学基地建设在校内，与作为嵌入式行业的领导品牌企业广州周立功单片机发展有限公司联合建设嵌入式“3+1”实验班。同时又先后把学生送到大连、苏州、上海等地进行毕业实习。
　　在2003年由校团委、教务处与信息学院联合建设了大学生信息技术创新实验室。该实验室配备示波器、信号源、毫伏表等仪器、计算机60台。拥有设备总价值近40余万元，实验室用房面积达200余平方米。该实验室是一个注重培养学生动手能力和科学创新能力的大学生信息技术创新实验室。
　　2009年实施校企合作“3+1”创新教育模式，将大学本科4年的学习时间分成前后两部分：“3”代表大一到大三前三年的学科基础教育模块、专业知识教育学习，“1”代表大四最后一年的以面向工程为导向、以项目驱动为手段的校内实习实训基地的实训。最终实现“科学”到“工程”的回归、“工程”到“创新”的提升的教育。
　　从2001年至2011年全国大学生电子设计竞赛和黑龙江省大学生电子设计竞赛中，我院学生先后获黑龙江赛区一等奖7项、二等奖15项、三等奖20项、优秀奖8项；在第八届、第九届全国大学生“挑战杯”课外学术科技作品竞赛活动中分别获三等奖2项；获得校、院支持的大学生创新性实验项目50余项。电子信息工程专业历届毕业生的一次性就业率达>90%，考研率达>25%。