经济管理学院源于1958年开办的农业经济管理干部班，1980年成立农业经济系，1995年与黑龙江省农业管理干部学院农业经济系合并，成立经济贸易学院，2004年更名为经济管理学院。
　　学院设有农林经济管理、工商管理、会计学、信息管理与信息系统、金融学、保险学、国际经济与贸易、农村区域发展、市场营销九个本科专业，覆盖管理学和经济学两大学科门类。现有在校本科生4344人。
　　经济管理学院的农业经济管理、金融学学科是黑龙江省重点学科，农业经济管理学科还是东北农业大学"211工程"重点建设的四大学科群之一即经济与管理学科群的带头学科，1998年获得博士学位授予权，2003年获准设立博士后科研流动站，同年设立黑龙江省哲学社会科学研究基地。2005年获农林经济管理一级学科博士点，金融学、会计学、产业经济学三个二级学科硕士点。本学科点设有农业经济、农村合作经济、农业企业管理、农业政策与法规、农业技术经济、农业数量经济、农业系统工程、农村人力资源管理、农产品价格与市场营销等硕士生研究方向，拥有硕士生导师37人，现有在校硕士研究生184人，在职攻读硕士研究生学员279人；设有农业经济、农业企业管理、农村人力资源管理、农村财政与金融、农业系统工程、农业资源经济、农村区域发展等博士生研究方向，拥有博士生导师11人，现有在校博士研究生76人。
　　学院拥有良好的教学与科研设施。有经济管理手工模拟室、理财实训中心、ERP企业资源计划中心、金融交易中心、企业管理中心、经济管理计算机模拟室、国际贸易中心、管理信息中心组成的经济管理类综合实验中心，设备齐全、功能先进，为学院的教学、科研工作和学生实习提供了有力保障。
　　近三年，全院教师先后主持、参加国家社会科学基金项目、国家科技计划攻关项目、国家软科学计划项目、国家教学研究项目和省部级与厅局级以及横向课题87项，其中在研课题34项；出版科学著作及教材46部；在《中国软科学》、《农业经济问题》、《中国农村经济》、《世界农业》、《光明日报》等报刊及国际和国内学术会议上发表论文337余篇，其中32篇被EI、ISTP及中国人民大学复印报刊资料等收录、转载；科研成果获奖74项，其中获省部级以上成果奖18项。
　　学院注重国内外学术交流，先后有百余人次参加国际学术研讨会，并成功地举办过"东北亚农业与农村经济发展国际学术研讨会"、"中国青年农业经济学者年会"、"中国宏观经济管理教育学会年会"和多次地方性学术会议；现有黑龙江省县域经济学会挂靠在本学院。在国际方面，学院与日本北海道大学农学部、新潟大学农学部、加拿大奥茨学院、俄罗斯海参崴水产技术学院、哈巴罗夫斯克国立工业大学等院校保持有较为密切的联系，经常互有专家来往讲学、交流和进行合作研究。