微小核苷酸（miRNA）功能学研究，microRNA转基因动物模型建立研究，抗心律失常药物作用最佳靶点的研究，中国人类基因组计划研究,精准肝脏外科技术研究，同种异体劈裂脾移植研究，As2O3治疗M3型白血病和治疗实体瘤的研究，大骨节病病因学研究，心脏移植，双手移植，单前臂移植和大肠癌综合治疗等在国内外具有较大的影响，分别得到《自然》、《科学》、《细胞》等国际著名杂志的赞扬。
　　“十一五”以来，获国家自然科学二等奖3项，国家科技进步二等奖3项，部省级科研成果奖280项。获国家自然科学基金创新研究群体项目1项，国家自然科学基金重点项目及国家自然科学基金资助项目768项。主持国家“973”项目1项、“863”项目5项、国家“十一五”科技支撑计划4项、科技部重点重大国际合作项目4项。获教育部创新团队2个。获卫生行业科研重大专项1项。获葛兰素史克(GSK)中国研发中心生命科学杰出成就奖、保罗--杨森药学研究奖、霍英东青年教师基金和青年教师奖、全国留学归国先进个人奖等国家及黑龙江省最高科学技术奖120余人次。学校专家、学者在国际、国家级学术团体中兼任主任委员、副主任委员、副理事长、常务理事、常务委员、委员的专家达699个职位，其中有184人在多个国际、国家级学术团体中兼任副主任委员、副理事长以上职务。担任国际、国家级杂志编委以上职务的专家164人。主编普通教育本科国家规划教材73部、副主编72部、参编270部。
　　主办《中国地方病学杂志》、《国际遗传学杂志》、《国际免疫学杂志》《哈尔滨医科大学学报》等6种专业杂志。先后同美国、日本、加拿大、英国、澳大利亚、俄罗斯等10余个国家的50余所院校和研究机构建立了友好合作关系。
　　五所临床医学院（附属医院）均为三级甲等医院、全国“百佳医院”。目前实际平均开放床位14001张，年门诊量639.1万人次。
　　学校连续四次被评为全国高等院校思想政治工作先进集体，连续三次被命名为全国文明单位。学校注重校园文化与环境建设，科技文化型校园建设成为广大师生的共识。校园绿树成荫，红柱碧瓦间高楼耸立，仿古与现代风格交相辉映，彰显了博学与高雅的校园环境。
　　学校领导集体带领全校师生团结奋斗，坚持以高水平的医学本科教育为基础，以学科建设为根本，优先发展研究生教育和长学制医学教育的办学思想。突出办学特色、推动研究教学型的大学快速发展，为实现国内一流、国际有影响的医科大学而努力奋斗！（数据截至2013年12月)