黑龙江中医药大学基础医学院前身为黑龙江中医学院基础医学部，始创于1972年4月，1997年7月更名为基础医学院。现有教研室19个；拥有国家级重点学科1个、国家中医药管理局重点学科1个、省级重点学科5个；国家中医药三级重点实验室1个、省级A类重点实验室1个；具有博士学位授予权的学科6个、具有硕士学位授予权的学科7个。

　　现有教职工92人，具有副高以上职称的48人；具有硕士以上学历的48人，占中青年教师85.7%，其中博士22人，博士后8人。特聘教授1人，博士生导师8人，硕士生导师28人。

　　基础医学院承担着学校各专业、各层次中西医基础课及共同课等30余门课程。

　　教学研究工作：获得国家级教学成果一等奖1项、省级优秀教学成果一等奖3项、二等奖3项、省级青年优秀教学成果奖1项、省高教学会教学成果奖8项、校级教学成果奖20项。国家霍英东教育基金（教学类）三等奖3项。我院任全国统编教材和新世纪规划教材主编5部、主审3部、副主编10部、编委20部；主编、主审全国统编教材和新世纪规划教材教学参考书4部。

　　科学研究工作：多数学科都已经形成了稳定而有特色的研究方向，1996年以来，中标科研课题累计138项，科研经费达336.85万元，科研成果及获奖36项。获省政府科技进步二等奖3项。现主持校级以上科研课题78项，其中，国家级5项。

　　近年来，荣获国家级教学名师1人，全国优秀教师4人、全国教书育人先进个人1名，中国百名杰出青年中医2人，黑龙江省名中医4人，黑龙江省中医名师4人，黑龙江省劳动模范5人。以及黑龙江十大杰出青年、黑龙江省卫生系统跨世纪拔尖人才、黑龙江省五四奖章、黑龙江省青年科技奖、哈尔滨十大杰出青年、哈尔滨市青年科技奖等校级以上表彰及奖励60余人次。