项目名称：生防菌B29高密度遗传图谱的构建及抗性基因定位

项目级别：省院所基本应用技术研究专项（省级）

起止时间：2014.07-2016.07

参加人员：赵晓宇

项目介绍：确定高效生防菌B29菌株对根腐病、菌核病、黑穗病、恶苗病等多种病原菌的抑制效果并进行防效评价。完成solexa全基因组测序，绘制精细图谱。经solexa测序PE库，获得生防菌B29全基因组序列，经序列拼装及基因预测，获得基因组基本信息。经生物信息学分析比对，以及数据库查询获得具备抗菌活性功能序列，包括Bac (A/B/C/D/E)、Srf(AA/AC/AD)、TasA等。利用生物信息学方法对TasA 基因序列及其编码的蛋白质结构进行分析和预测。合成B29菌株抗菌蛋白基因TasA 并进行原核表达和抑菌活性研究。通过生物信息学比对枯草芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌个模式物种的四条系统发育基因cheA基因可以更有效的区分二者，B29菌株的四条基因与解淀粉芽孢杆菌模式菌株同源性均大于95%。