报告1：

报告题目：Extensive application of high throughput datain plant research

报 告 人：刘仁义，研究员

　　工作单位：中科院上海植物逆境生物学研究中心

　　时 间：2017.5.17（周三）下午2：00

　　地 点：中心五楼会议室
　　刘仁义，博士生导师， 研究员。分别于2001年和2005年于美国乔治亚大学获得计算机科学硕士学位和遗传学博士学位。2006-2007年，在亚利桑那大学做博士后研究。2007-2014年担任加州大学河滨分校助理教授。现任中科院上海植物逆境生物学研究中心研究员，生物信息学平台负责人。2015年入选中科院百人计划。

　　主要从事生物信息学研究。具有十多年的高通量数据分析经验。通过对基因组测序和重测序，转录组，全基因组DNA甲基化测序，染色质免疫共沉淀测序，小RNA测序等高通量数据的分析，与国内外实验生物学家广泛合作，解决植物发育，抗逆，营养，表观遗传学等领域的关键问题。 在国际学术期刊 Science, Nature Plants, Molecular Cell, EMBO Journal, Genome Biology, PNAS, Plant Cell, Journal of Experimental Botany等杂志上发表论文50多篇。

　　

　　近期代表性论文：

　　1. Pan X, Hasan MM, Li Y, Liao C, Zheng H, Liu R*, Li X*. (2015) Asymmetric transcriptomic signatures between the cob and florets in the maize ear under optimal- and low-nitrogen conditions at silking and functional characterization of amino acid transporters ZmAAP4 and ZmVAAT3. J Exp Bot. PMID: 26136266.

　　2. Jiang L, Yan S, Yang W, Li Y。

　　3. Liu R*, Zhu J-K. (2014) Non-coding RNAs as potent tools for crop improvement. National Science Review. 1: 186-189.

　　4. Qian W, Miki D, Lei M, Zhu X, Zhang H, Liu Y, Li Y, Lang Z, Wang J, Tang K, Liu R, Zhu JK. (2014). Regulation of Active DNA Demethylation by an α-Crystallin Domain Protein in Arabidopsis. Mol Cell. PMID: 25002145

　　

，Xia M, Chen Z, Wang Q, Yan L, Song X, Liu R, Zhang X. (2015) Comparative transcriptomic analysis reveals the roles of microtubule-related genes and transcription factors in fruit length regulation in cucumber (Cucumis sativus L.). Sci Rep. PMID: 25619948.

　　报告2：

报告题目：黄瓜果实重要外观品质的分子调控

　　报 告 人：张小兰，研究员

工作单位：中国农业大学园艺学院

　　时 间：2017.5.17（周三）下午2：00

　　地 点：中心五楼会议室

　　

　　张小兰, 中国农业大学教授，博士生导师，园艺学院科研副院长。1999年和2002年于中国农业大学蔬菜系分别获学士和硕士学位；2007年于美国佐治亚大学植物生物系获博士学位。 2007-2011年在美国加州理工大学从事博士后研究，师从著名的Elliot Meyerowitz 院士。担任Horticultural Plant Journal栏目主编，Scientific Reports, Journal of Integrative Agriculture和《中国农业科学》杂志编委。长期从事植物生殖发育学研究，包括黄瓜果实重要品质性状的分子调控，黄瓜性别决定的分子机制以及植物抽薹开花的分子机理等。主持国家自然科学基金面上项目2 项，国家“973”计划项目子课题1项、教育部新世纪优秀人才支持计划1项以及其它科研项目4 项。发表SCI论文26篇，其中第一/通讯作者17篇。代表性论文有2篇Plant Cell，2篇PLoS Genetics，3篇Plant Physiology和2篇Journal of Experimental Botany。获省部级一等奖2项，审定黄瓜新品种2个。

　　

　　代表论文

　　1. Sun C*., Li Y*., Zhao W*., Song X., Lua M., Lia X., Li X., Liu R#., Yan L# and Zhang X#. (2016). Integration of hormonal and nutritional cues orchestrates progressive corolla opening in the female flower in cucumber. Plant Physiology.

　　2. Ding L*., Yan S*., Jiang L*., Zhao W., Ning K., Zhao J., Liu X., Zhang J., Wang Q., and Zhang X#. (2015). HANABA TARANU (HAN) Bridges Meristem and Organ Primordia Boundaries through PINHEAD, JAGGED, BLADE-ON-PETIOLE2 and CYTOKININ OXIDASE 3 during Flower Development in Arabidopsis. PLoS genetics 11, e1005479.

　　3. Ding L., Yan S., Jiang L., Liu M., Zhang J., Zhao J., Zhao W., Han Y., Wang Q., and Zhang X#. (2015). HANABA TARANU regulates the shoot apical meristem and leaf development in cucumber (Cucumis sativus L.). Journal of Experimental Botany, erv409..

　　4. Zhao J*., Li Y*., Ding L*., Yan S., Liu M., Jiang L., Zhao W., Wang Q., Yan L., Liu R., and Zhang X#. (2016). Phloem transcriptome signatures underpin the physiological differentiation of the pedicel, stalk and fruit of cucumber (Cucumis sativus L.). Plant and Cell Physiology 57(1): 19–34.

　　5. Zhang X*#. , Zhou Y*., Ding L., Wu Z., Liu R., and Meyerowitz E.M. (2013). Transcription repressor HANABA TARANU (HAN) controls flower development via integrating multiple hormone actions, floral organ specification and GATA3 family auto-regulation. Plant Cell 25：83-101.