华北理工大学生命科学学院副教授王金朋 (Jinpeng Wang)
学习经历
2011 河北联合大学(现华北理工大学)理学院,数学与应用数学,生物信息统计研究方向,硕士 (M.S. North China University of Science and Technology, 2011)
2007 唐山师范学院,数学与应用数学,学士 (B.S. Tangshan Normal University, 2007)
工作经历
2017/8-至 今 华北理工大学,生命科学学院,副教授(破格)
2013/09 - 至今,华北理工大学,生命科学学院,讲师
2011/07 - 2013/09,华北理工大学,生命科学学院,助教
教学及指导研究生情况
1. 承担本科生《线性代数与概率论》,《运筹学》,《离散数学》,《生物信息数学方法》,《生物信息学导论》,《统计遗传学初步》;2. 研究生《生物信息学分析实践》,《生物数据分析》等课程教学;3. 指导研究生17人,其中毕业9人,其中3人大学从事科研教学,6人在国际知名企业做研发相关工作,多次教学质量考核中评为省备案优秀教师;4. 指导本科毕业生30余人,其中有的已博士毕业,作为紧缺型人才被引进扬州大学,目前为副教授职称;多名现在中科院、中国农业大学、华中农业大学、中国农科院、首都师范大学等知名高校和研究所进行硕博深造;多名在国际知名企业和研究机构进行基因组、信息学相关研发工作。
发表论文及著作
在基因组学、生物信息学研究中取得了一定的成果。发表学术论文30余篇,第一作者在《分子生物学与进化:Molecular Biology and Evolution》、《植物生理:Plant Physiology》、《植物科学前沿:Frontiers in Plant Science》和细胞出版旗下的《iScience》上发表论文多篇,累积影响因子55.8,平均6.20,最高影响因子14.479;同时在《自然:Nature》、《自然遗传:Nature Genetics》、 《自然通讯:Nature Communications》、《分子植物:Molecular Plant》、《新植物学家:New Phytologist》等杂志上参与发表了文章多篇;主持或参与国家重大研发项目、国际交流合作项目、国家、省自然科学基金项目等20余项;参与英文专著2部(各负责一章)。最近,发表在牛津大学出版社《Molecular Biology and Evolution》分子生物与进化上的关于葫芦科祖先的一次被忽略的多倍化事件,引起了国际上的广泛关注,同时纽约时报,牛津大学出版社,中国新闻网,国家自然科学基金委委刊等多家媒体对这一研究成果进行了采访报道。
Publications:
1. Jinpeng Wang, Jiaqing Yuan, Jigao Yu, Fanbo Meng, Pengchuan Sun, Yuxian Li, Nanshan Yang, Zhenyi Wang, Yuxin Pan, Weina Ge, Li Wang, Jing Li, Chao Liu, Zhiyan Xi, Yuhao Zhao, Sainan Luo, Dongcen Ge, Xiaobo Cui, Guangdong Feng, Ziwei Wang, Lei Ji, Jun Qin, Xiuqing Li, Xiyin Wang*, Recursive paleohexaploidization shapes the durian genome, Plant Physiology, 2018. (will be published)
2. Jinpeng Wang, Jigao Yu, Pengchuan Sun, Chao Li, Xiaoming Song, Tianyu Lei, Yuxian Li, Jiaqing Yuan, Sangrong Sun, Hongling Ding, Xueqian Duan, Shaoqi Shen, Yanshuang Shen, Jing Li, Fanbo Meng, Yangqin Xie, Jianyu Wang, Yue Hou, Jin Zhang, Xianchun Zhang, Xiuqing Li, Andrew H. Paterson and Xiyin Wang*, Paleo-polyploidizations in lycophytes, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2018. (will be published)
3. Jin-Peng Wang#, Ji-Gao Yu#, Jing Li#, Peng-Chuan Sun#, Li Wang#, Jia-Qing Yuan, Fan-Bo Meng, Sang-Rong Sun, Yu-Xian Li, Tian-Yu Lei, Yu-Xin Pan, Wei-Na Ge, Zhen-Yi Wang, Lan Zhang, Xiao-Ming Song, Chao Liu, Xue-Qian Duan, Shao-Qi Shen, Yang-qin Xie, Yue Hou, Jin Zhang, Jian-Yu Wang, Xiyin Wang*, Two likely auto-tetraploidization events shaped kiwifruit genome and contributed to establishment of the Actinidiaceae family, iScience, 2018, https: //doi.org/10.1016 /j.isci.2018.08.003.
4. Zhenyi Wang#, Kanglu Zhao#, Yuxin Pan#, Jinpeng Wang#, Xiaoming Song#, Weina Ge#, Min Yuan, Tianyu Lei, Li Wang, Lan Zhang, Yuxian Li, Tao Liu, Wei Chen, Wenjing Meng, Changkai Sun, Xiaobo Cui, Yun Bai and Xiyin Wang*, Genomic, expressional, protein-protein interactional analysis of Trihelix transcription factor genes in Setaria italia and inference of their evolutionary trajectory, BMC Genomics, 2018, https://doi.org/10.1186/s12864-018-5051-9.
5. Jinpeng Wang, Pengchuan Sun, Yuxian Li, Yinzhe Liu, Nanshan Yang, Jigao Yu, Xuelian Ma, Sangrong Sun, Ruiyan Xia, Xiaojian Liu, Dongcen Ge, Sainan Luo, Yinmeng Liu, Youting Kong, Xiaobo Cui, Tianyu Lei, Li Wang, Zhenyi Wang, Weina Ge, Lan Zhang, Xiaoming Song, Min Yuan, Di Guo, Dianchuan Jin, Wei Chen, Yuxin Pan, Tao Liu, Guixian Yang, Yue Xiao, Jinshuai Sun, Cong Zhang, Zhibo Li, Haiqing Xu, Xueqian Duan, Shaoqi Shen, Zhonghua Zhang, Sanwen Huang, and Xiyin Wang*, An overlooked paleo-tetraploidization in Cucurbitaceae, Molecular Biology and Evolution, 2018, 35(1): 16-26.
6. Jinpeng Wang, Pengchuan Sun, Yuxian Li, Yinzhe Liu, Jigao Yu, Xuelian Ma, Sangrong Sun, Nanshan Yang, Ruiyan Xia, Tianyu Lei, Xiaojian Liu, Beibei Jiao, Yue Xing, Weina Ge, Li Wang, Zhenyi Wang, Xiaoming Song, Min Yuan, Di Guo, Lan Zhang, Jiaqi Zhang, Dianchuan Jin, Wei Chen, Yuxin Pan, Tao Liu, Ling Jin, Jinshuai Sun, Jiaxiang Yu, Rui Cheng, Xueqian Duan, Shaoqi Shen, Jun Qin, Meng-chen Zhang, Andrew H. Paterson, and Xiyin Wang*, Hierarchically aligning 10 legume genomes establishes a family-level genomics platform, Plant Physiology, 2017, 174: 284.
7. Jinpeng Wang#, Jiaxiang Yu#, Pengchuan Sun, Yuxian Li, Ruiyan Xia, Yinzhe Liu, Xuelian Ma, Jigao Yu, Nanshan Yang, Tianyu Lei, Zhenyi Wang, Li Wang, Weina Ge, Xiaoming Song, Xiaojian Liu, Sangrong Sun, Tao Liu, Dianchuan Jin, Yuxin Pan*, Xiyin Wang*, Comparative genomics analysis of rice and pineapple contributes to understand the chromosome number reduction and genomic changes in grasses, Frontiers in Genetics, 2016, 10.3389 /fgene. 2016. 00174.
8. Yinzhe Liu#, Jinpeng Wang#, Weina Ge, Zhenyi Wang, Yuxian Li, Nanshan Yang, Sangrong Sun, Liwei Zhang, and Xiyin Wang, Two Highly Similar Poplar Paleo-subgenomes Suggest an Autotetraploid Ancestor of Salicaceae Plants, Front Plant Sci, 2017, 8: 571.
9. Sangrong Sun#, Jinpeng Wang#, Jigao Yu, Fanbo Meng, Ruiyan Xia, Li Wang, Zhenyi Wang, Weina Ge, Xiaojian Liu, Yuxian Li, Yinzhe Liu, Nanshan Yang and Xiyin Wang*, Alignment of Common Wheat and Other Grass Genomes Establishes a Comparative Genomics Research Platform, Front Plant Sci, 2017, 8: 1480.
10. Xiaoming Song, Jinpeng Wang, Xiao Ma, Yuxian Li, Tianyu Lei, Li Wang, Weina Ge, Di Guo, Zhenyi Wang, Chunjin Li, Jianjun Zhao* and Xiyin Wang*, Origination, Expansion, Evolutionary Trajectory, and Expression Bias of AP2/ERF Superfamily in Brassica napus, Front Plant Sci, 2016, 7: 1186.
11. Xiyin Wang, Hui Guo, Jinpeng Wang, Tianyu Lei, Tao Liu, Zhenyi Wang, Yuxian Li, Tae-Ho Lee, Jingping Li, Haibao Tang, Dianchuan Jin, Andrew H Paterson*, Comparative genomic de-convolution of the cotton genome revealed a decaploid ancestor and widespread chromosomal fractionation, New Phytologist, 2016, 209(3): 1252-1263.
12. Xiyin Wang, Jinpeng Wang, Dianchuan Jin, Hui Guo, Tae-Ho Lee, Tao Liu, Andrew H. Paterson*, Genome alignment spanning major Poaceae lineages reveals heterogeneous evolutionary rates and alters inferred dates for key events, Molecular Plant, 2015, 8(6), 885-898.
13. Shengyi Liu#*, Yumei Liu#, Xinhua Yang#, Chaobo Tong#, David Edwards#, Isobel A P Parkin#, Meixia Zhao, Jianxin Ma, Jingyin Yu, Shunmou Huang, Xiyin Wang, Junyi Wang, Kun Lu, Zhiyuan Fang, Ian Bancroft, Tae-Jin Yang, Qiong Hu, Xinfa Wang, Zhen Yue, Haojie Li, Linfeng Yang, Jian Wu, Qing Zhou, Wanxin Wang, Graham J King, J Chris Pires, Changxin Lu, Zhangyan Wu, Perumal Sampath, Zhuo Wang, Hui Guo, Shengkai Pan, Limei Yang, Jiumeng Min, Dong Zhang, Dianchuan Jin, Wanshun Li, Harry Belcram, Jinxing Tu, Mei Guan, Cunkou Qi, Dezhi Du, Jiana Li, Liangcai Jiang, Jacqueline Batley, Andrew G Sharpe, Beom-Seok Park, Pradeep Ruperao, Feng Cheng, Nomar Espinosa Waminal, Yin Huang, Caihua Dong, Li Wang, Jingping Li, Zhiyong Hu, Mu Zhuang, Yi Huang, Junyan Huang, Jiaqin Shi, Desheng Mei, Jing Liu, Tae-Ho Lee, Jinpeng Wang, Huizhe Jin, Zaiyun Li, Xun Li, Jiefu Zhang, Lu Xiao, Yongming Zhou, Zhongsong Liu, Xuequn Liu, Rui Qin, Xu Tang, Wenbin Liu, Yupeng Wang, Yangyong Zhang, Jonghoon Lee, Hyun Hee Kim, France Denoeud, Xun Xu, Xinming Liang, Wei Hua, Xiaowu Wang, Jun Wang, Boulos Chalhoub, Andrew H Paterson, The Brassica oleracea genome reveals the asymmetrical evolution of polyploid genomes, Nature Communications, 2014, 5: 3930.
14. Ningjia He, Chi Zhang, Xiwu Qi, Shancen Zhao, Yong Tao,Guojun Yang, Tae-Ho Lee, Xiyin Wang, Qingle Cai, Dong Li, Mengzhu Lu, Sentai Liao, Guoqing Luo, Rongjun He, Xu Tan, Yunmin Xu, Tian Li, Aichun Zhao, Ling Jia, Qiang Fu, Qiwei Zeng, Chuan Gao, Bi Ma, Jiubo Liang, Xiling Wang, Jingzhe Shang, Penghua Song, Haiyang Wu, Li Fan, Qing Wang, Qin Shuai, Juanjuan Zhu, Congjin Wei, Keyan Zhu-Salzman, Dianchuan Jin, Jinpeng Wang, Tao Liu, Maode Yu, Cuiming Tang, Zhenjiang Wang, Fanwei Dai, Jiafei Chen, Yan Liu, Shutang Zhao, Tianbao Lin, Shougong Zhang, Junyi Wang, Jian Wang, Huanming Yang, Guangwei Yang, Jun Wang*, Andrew H. Paterson, Qingyou Xia, Dongfeng Ji*, Zhonghuai Xiang*, Draft genome sequence of the mulberry tree Morus notabilis, Nature Communications, 2013, 4: 2445.
15. Andrew H. Paterson*, Jonathan F. Wendel, Heidrun Gundlach, Hui Guo, Jerry Jenkins, Dianchuan Jin, Danny Llewellyn, Kurtis C. Showmaker, Shengqiang Shu, Joshua Udall, Mi-jeong Yoo, Robert Byers, Wei Chen, Adi Doron-Faigenboim, Mary V. Duke, Lei Gong, Jane Grimwood, Corrinne Grover, Kara Grupp, Guanjing Hu, Tae-ho Lee, Jingping Li, Lifeng Lin, Tao Liu, Barry S. Marler, Justin T. Page, Alison W. Roberts, Elisson Romanel, William S. Sanders, Emmanuel Szadkowski, Xu Tan, Haibao Tang, Chunming Xu, Jinpeng Wang, Zining Wang, Dong Zhang, Lan Zhang, Hamid Ashrafi, Frank Bedon, John E. Bowers, Curt L. Brubaker, Peng W. Chee, Sayan Das, Alan R. Gingle, Candace H. Haigler, David Harker, Lucia V. Hoffmann, Ran Hovav, Donald C. Jones, Cornelia Lemke, Shahid Mansoor, Mehboob ur Rahman, Lisa N. Rainville, Aditi Rambani, Umesh K. Reddy, Jun-kang Rong, Yehoshua Saranga, Brian E. Scheffler, Jodi A. Scheffler, David M. Stelly, Barbara A. Triplett, Allen Van Deynze, Maite F. S. Vaslin, Vijay N. Waghmare, Sally A. Walford, Robert J. Wright, Essam A. Zaki, Tianzhen Zhang, Elizabeth S. Dennis, Klaus F. X. Mayer, Daniel G. Peterson, Daniel S. Rokhsar, Xiyin Wang, Jeremy Schmutz*, Repeated polyploidization of Gossypium genomes and the evolution of spinnable cotton fibres, Nature, 2012, 492: 423-427.
16. Xiaowu wang*, Hanzhong wang*, Jun wang*, Rifei Sun*, Jian Wu, Shengyi liu, Yinqi Bai, Jeong-Hwan mun, Ian Bancroft, Feng Cheng, Sanwen Huang, Xixiang Li, Wei Hua, Junyi wang, Xiyin wang, Michael Freeling, J Chris Pires, Andrew H Paterson, Boulos Chalhoub, Bo Alice Hayward, Andrew G Sharpe, Beom-Seok Park, Bernd weisshaar, Binghang liu, Bo Li, Bo liu, Chaobo Tong, Chi Song, Christopher duran, Chunfang Peng, Chunyu Geng, Chushin koh, Chuyu lin, david edwards, Desheng Mu, Di Shen, Eleni Soumpourou, Fei Fiona Fraser, Gavin Conant, Gilles lassalle, Graham J king, Guusje Bonnema, Haibao Tang, Haiping wang, Harry Belcram, Heling Zhou, Hideki Hirakawa, Hiroshi Abe, Hui Guo, Hui Huizhe Jin, Isobel A P Parkin, Jacqueline Batley, Jeong-Sun kim, Jérémy Just, Jianwen Li, Jiaohui Xu, Jie deng, Jin A Jingping Li, Jingyin Yu, Jinling meng, Jinpeng wang, Jiumeng min, Julie Poulain, Jun wang, Katsunori Hatakeyama, Kui Wu, Li Lu Fang, Martin Trick, matthew G links, Meixia Zhao, Mina Jin, Nirala Ramchiary, nizar drou, Paul J Berkman, Qingle Cai, Quanfei Huang, Ruiqiang Satoshi Tabata, Shifeng Cheng, Shu Zhang, Shujiang Zhang, Shunmou Huang, Shusei Sato, Silong Sun, Soo-Jin kwon, Su-Ryun Choi, Tae-Ho lee, Wei Fan, Xiang Zhao, Xu Tan, Xun Xu, Yan wang, Yang Qiu, Ye Yin, Yingrui Li, Yongchen Du, Yongcui liao, Yongpyo lim, Yoshihiro narusaka, Yupeng wang, Zhenyi wang, Zhenyu Zhi wen wang, Zhiyong Xiong Zhonghua Zhang, The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa, Nature Genetics, 2011, 43: 1035-1039.
Book chapters
1. Wang, X., Guo, H., Wang, J. Insights into the common ancestor of cereals. In book: Genomes of Herbaceous Land Plants, Edited by Paterson, AH., published by Elsevier Limited. (Invited book chapter)
2. Comparative Analysis of Gene Conversion Between Duplicated Regions in Brassica rapa and B. oleracea Genomes. In book: The Brassica rapa Genome, Endited by Wang Xiaowu and Chittaranjan Kole. published by Springer company (Invited book chapter)
研究方向
主要从事基因组学、生物信息学研究。
1. 基因组信息学研究平台构建:开发基因组分析方法和软件,形成比较基因学分析流程,为基因组学研究提供方法和工具支撑,并提供基因组及各类组学数据资源和分析结果;
2. 重要经济作物比较基因组学:对重要的经济作物(禾本科、豆科、葫芦科、棉花、十字花科等)进行基因组结构和功能进化分析,为拓展作物遗传学基础提供比较基因组学支撑,并对作物种质创新提供基因组学支持;
3. 陆地植物分化早期多倍化过程研究:植物6亿年的进化形成了现代庞大的类群,推断和认识植物分化早期的多倍化事件,并从小尺度(单个基因组)和大尺度(藻类、苔藓、蕨类、裸子、被子及基部类群基因组)深入比较分析基因组进化的关键事件,能够从全新视角探索重要性状相关基因及调控路径起源和进化规律;
4. 生物学问题为核心的研究中,我们对于基因组注释、基因组拼接、全基因组关联分析、转录组分析、表观遗传学分析也十分感兴趣,并做了一些工作。
项目成果
1、国家自然科学基金青年项目,**、大豆作物基因组的生物信息研究平台构建和比较基因组学分析、2016/01-2018/12,主持人。
2、河北省自然科学基金青年项目,C、大豆基因组结构与功能的比较基因组学研究、2015/01-2017/12,主持人。
荣誉、获奖
河北省“三三三”人才工程第三层次人才(2018);唐山市科技进步二等奖1项,排名第三(2014);唐山市凤凰英才(2018)
社会工作
国家自然科学基金委评审专家
其他信息
Email: wangjinpeng1010@vip.sina.com
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
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