职业经历
} 生物化学博士后 2015-2018
以色列魏茨曼科学研究所，Dan Tawfik 教授课题组。
教育背景
} 微生物学博士 2008-2014
中国 ，华中农业大学，农业微生物国家重点实验室，生物固氮实验室
} 微生物学硕士 2006-2008
中国 ，华中农业大学，农业微生物国家重点实验室，生物固氮实验室
} 生物工程学士 2002-2006湖北农学院（现长江大学）
博士后课题主题
} 二甲基巯基丙酸(DMSP)依赖的二甲基硫醚(DMS)释放的酶学机制以及对应蛋白家族的进化研究.
海洋中的生物通过裂解DMSP来释放DMS.目前已知有多个基因编码的蛋白拥有DMSP裂解活性，并且展示出不同水平的酶活。
目前已报道的细菌来源DMSP裂解酶当中，包括DddK，DddL，DddQ,DddW 以及DddY，隶属于同一个类cupin蛋白超家族。此研究当中，我们尝试对这个蛋白超家族成员进行定义并且分类。为此，我们通过同源重组以及体外表达/纯化，鉴定了属于该金属依赖的蛋白超家族成员的 DMSP 裂解酶的表征，尤其是 DddY 和 DddL--最富有活性的 DMSP 裂解酶。我们确定了两个保守的 motif，来作为这个超家族成员的特征。这些保守的氨基酸残基包括必需的金属螯合集团；而其他的氨基酸残基，包括活性位点中的酪氨酸（DddQ中的Y131），则在DMSP裂解中起相对较小的作用。同时我们还鉴定了一种金属螯合剂，TPEN，它可以选择性地抑制所有已知的具有 DMSP 裂解酶活性的Cupin-DLL超家族成员。系统发育分析表明，已知的DMSP裂解酶家族是零星分布的，这表明 DMSP 裂解酶在该超家族进化过程中反复出现多次。而且基于系统发育树的各个进化分支进行取样并且体外表达也展示出了和DddQ类似水平的DMSP裂解活性。基于这些结果，可以推导出，过低的DMSP裂解酶活性和所在基因簇之间的比较分析表明，DMSP裂解酶不是大多数cupinDLL家族的实际功能。本研究中，通过使用一系列DMSP类似物系统地进行分析底物选择性，表明一些成员，最明显的DddY和DddL是真正的DMSP裂解酶，而另一些成员，最为明显的是DddQ，可能仅表现出混杂的DMSP裂解酶活性。
博士期间科研主题
} 豆科植物-根瘤菌的相互作用.



在根瘤的发育过程中，含菌细胞中的根瘤菌数量显著增加。宿主植物需要大量的脂质来形成共生体膜，以包裹这些根瘤菌。然而这个过程中，植物合成的脂质是如何转运至共生体膜的，我们所知甚少。
在真核生物中，有囊泡运输和非囊泡运输两种转运机制参与了细胞间的脂质转运。之前认为，细胞器之间大量的脂质转运过程是通过囊泡运输的方式来进行的。后来的研究发现，转脂蛋白参与的非囊泡运输模式在细胞间脂质运输过程中起着重要的作用。植物转脂蛋白通常是带正电荷的多肽，分子量大小为 7-10 道尔顿。在体外条件下，可以可逆地结合并转运疏水分子。植物转脂蛋白被分为两个蛋白家族，LTP1 和 LTP2。这两个家族都含有一个保守的含有八个半胱氨酸的模体（motif），而且三维结构显示这两个家族成员内部都含有一个疏水空腔以形成脂质结合位点。根据报道，一个来源于小麦的转脂蛋白可以和前列腺素形成复合体，这意味着植物转脂蛋白可以和较大的疏水化合物结合。同时一个来自于拟南芥中的转脂蛋白 LTPg1，是蜡质转运至植物外表皮过程中的必须基因。然而，到目前为止，以共生体为目的地的脂质转运蛋白还没有被报道。
因此，我们认为植物转脂蛋白参与了共生固氮过程中，共生体膜所需脂质的转运以及共生体膜的装配。在之前的工作中，本实验室通过抑制差减杂交，从豆科植物紫云英当中，分离了两个转脂蛋白基因，AsE246和AsIB259。AsE246仅在根瘤中检测到了表达，而AsIB259则是在未接种根以及根瘤中都有表达。在此，我们的免疫荧光以及免疫电镜结果显示，根瘤中特异性表达转脂蛋白 AsE246 定位于共生体膜。在此基础上，超表达植株展现出更多的根瘤以及对应的根毛卷曲、侵入线、以及根瘤原基等根瘤菌侵入事件。而 RNAi 结果植株则展现出结瘤数较少，且相关的根毛卷曲、侵入线、以及根瘤原基都有大幅度减少。与此同时，液质联用的检测结果显示， RNAi 的根瘤中各种脂质含量降低且无固氮酶活性。综合以上结果，转脂蛋白 AsE246 基因参与了共生体膜上所需脂质的转运，并且在共生体膜生物发生以及有效的共生固氮过程中发挥重要的作用。
科研经历
} 豆科植物-根瘤菌的相互作用
} 豆科植物根瘤中脂质运输的分子基础
} 紫云英共生体系的转录组研究
管理经历
} 华中农业大学农业微生物国家重点实验室科研助理 2014年6月-2015年3月
研究技能
} 基于功能筛选的蛋白质体外进化
} 蛋白家族的进化研究
} 真核生物RNA测序的从头拼接，以及差异表达分析
} 原核生物基因组拼接，注释以及数据挖掘
} 蛋白表达及纯化，包括组氨酸标签，GST标签，DEAE离子交换
} 农杆菌介导的植物转化，植物原生质体转化
} 亚细胞定位：免疫荧光以及免疫电镜
} 蛋白质相互作用研究：免疫共沉淀以及pull-down
} 液质联用：紫云英根瘤中的脂质组分析
} 激光共聚焦以及荧光显微镜：免疫荧光以及GFP/DsRed融合蛋白
} 常规分子克隆技术：载体构建，细菌基因敲除，植物基因RNAi




获奖荣誉
} 2007-2008三好研究生，华中农业大学。}2008-2009三好研究生，华中农业大学。}2009-2010三好研究生，华中农业大学。
文章发表
} (1)Lei Lei., Alcolombri, U., and Tawfik, D. S. (2018) Biochemical Profiling of DMSP lyases, Methods in Enzymology (Accept).（IF=2.0）
} (2)Lei Lei., Cherukuri, K. P., Meltzer, D., Alcolombri, U., and Tawfik, D. (2018)The
Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) Lyase and Lyase-Like Cupin Family Consists of Bona Fide DMSP lyases as Well as Other Enzymes with Unknown Function.Biochemistry. doi:
10.1021/acs.biochem.8b00097（IF=2.9）
} (3)Lei Lei, Ling Chen, Xiaofeng Shi, Yixing Li, Jianyun Wang, Dasong Chen, Fuli Xie. A nodule-specific lipid transfer protein AsE246 participates in transport of plant-synthesized lipids to symbiosome membrane and is essential for nodule organogenesis in Chinese milk vetch. Plant Physiol, 2014, 164: 1045-1058（IF=6.5）
} (4) Wei, F.,Lei Lei, Chen, F., Wu, M., Chen, D., and Li, Y. (2017) Identification and Symbiotic Phenotype Characterization of an OPDA Reductase Gene AsOPR1 in Chinese Milk Vetch,
Plant Molecular Biology Reporter 35, 469-479.（并列第一作者）（IF=1.9）
} (5) Alcolombri, U.,Lei Lei, Meltzer, D., Vardi, A., and Tawfik, D. S. (2016) Assigning the algal source of dimethylsulfide using a selective lyase inhibitor, ACS Chemical Biology.
} (6) Wang, S., Liu, K., Xiao, L., Yang, L., Li, H., Zhang, F.,Lei Lei, Li, S., Feng, X., Li, A., and He, J. (2016) Characterization of a novel DNA glycosylase fromS. sahachiroiinvolved in the reduction and repair of azinomycin B induced DNA damage, Nucleic acids research 44, 187197.
} (7) Wang, J., Si, Z., Li, F., Xiong, X.,Lei Lei, Xie, F., Chen, D., Li, Y., and Li, Y. (2015) A purple acid phosphatase plays a role in nodule formation and nitrogen fixation in Astragalus sinicus, Plant molecular biology 88, 515-529.
} (8) Fuli Xie, Guojun Cheng, Hui Xu, Zhi Wang,Lei Lei, Youguo Li. (2011) Identification of a Novel Gene for Biosynthesis of a Bacteroid-Specific Electron Carrier Menaquinone.Plos One
6, e28995, doi:10.1371/journal.pone.** (2011).
} (9) Yixing Li, Lei Zhou, Dasong Chen, Xuanjuan Tan,Lei Lei, Junchu Zhou. (2008) A nodulespecific plant cysteine proteinase, AsNODF32, is involved in nodule senescence and nitrogen fixation activity of the green manure legumeAstragalus sinicus.New Phytologist180, 185-192
(2008)10.1111/j.1469-8137.2008.02562.x).
} (10) Xiangsheng Zhang, Youguo Li, Wu Yuejin, Junchu Zhou, Dasong Chen,Lei Lei. (2008) Mutation Breeding of an Organic Phosphorus-Solubilizing Bacterium B3 by Low Energy Ion Beam Implantation.Plasma Science and Technology10, 645 (2008).




附件【个人简历_雷磊_2019-sep-19.pdf】