华中农业大学信息学院导师教师师资介绍简介-焦文标

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本站小编 Free考研考试/2021-07-31

博士生导师
硕士生导师
教师姓名：焦文标
教师拼音名称：Jiao Wenbiao
电子邮箱：
所在单位：信息学院
办公地点：逸夫楼C508
联系方式：**
学位：博士
职称：研究员（自然科学）
毕业院校：德国马克斯普朗克植物育种研究所；德国科隆大学
所属院系：信息学院
学科：生物学其他专业

同专业博导同专业硕导

其他联系方式
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个人简介

焦文标，华中农业大学信息学院研究员，博士生导师。博士毕业于德国马普植物育种研究所和科隆大学(2014-2018)，2017-2021年在德国马普植物育种研究所和慕尼黑大学从事博士后研究。2021年4月作为研究员，入职华中农业大学信息学院和园艺植物生物学教育部重点实验室。博士和博士后期间，主要从事基因组组装、比较基因组、多拷贝基因的遗传不亲和等生物信息学相关领域的研究。主要研究成果以第一作者发表在Genome Research, Nature Communications, Molecular Biology and Evolution, Current Opinion in Plant Biology等期刊上。

本课题组依托华中农业大学信息学院和园艺植物生物学教育部重点实验室，主要以柑橘、马铃薯等园艺作物为研究对象，具体研究内容将主要围绕基因组突变、重组、遗传多态性、进化等基本生物学问题展开，结合现有的高通量组学技术（如三代测序技术、单细胞组学技术等）并在此基础上开发适用于特定研究的基因组学技术，并开发相应的生物信息学算法，以解决基因组组装、结构变异识别、基因组进化等计算基因组学领域的关键问题，为园艺作物的遗传改良和品质创新提供指导。

已发表文章ORCiD:http://orcid.org/0000-0001-8355-2959
Google学术:https://scholar.google.com/citations?user=8kyDCksAAAAJ&hl=zh-CN
?一作或共同一作文章
1.Jiao WB, Patel V, Klasen J, Liu F, Pecinkova P, Ferrand M: The Evolutionary Dynamics of GeneticIncompatibilities Introduced by Duplicated Genes inArabidopsis thaliana,Molecular Biology andEvolution, 2020, msaa306 https://doi.org/10.1093/molbev/msaa306
2. Jiao WB, Schneeberger K:?Chromosome-level assemblies of multiple Arabidopsis genomes revealhotspots of rearrangements with altered evolutionary dynamics.Nat Commun2020,11:989.
3.Jiao WB, Schneeberger K: The impact of third generation genomic technologies on plant genome assembly.Curr Opin Plant Biol2017,36:64-70.
4.Jiao WB,Garcia Accinelli G, Hartwig B, Kiefer C, Baker D, Severing E, Willing E-M, Piednoel M, Woetzel S, Madrid-Herrero E, et al.: Improving and correcting the contiguity of long-read genome assemblies of three plant species using optical mapping and chromosome conformation capture data.Genome Res2017,27:778–786.
5.Jiao WB, Huang D, Xing F, Hu Y, Deng XX, Xu Q, Chen LL: Genome-wide characterization and expression analysis of genetic variants in sweet orange.Plant J2013,75:954–964.
?合作参与文章

1.Campoy, J.A., Sun, H., Goel, M.Jiao WB, et al. Gamete binning: chromosome-level and haplotype-resolved genome assembly enabled by high-throughput single-cell sequencing of gamete genomes.Genome Biol21, 306 (2020).
2.Goel M, Sun H,Jiao WB, Schneeberger K: SyRI: finding genomic rearrangements and local sequence differences from whole-genome assemblies.Genome Biol2019,20:277.
3.Dittberner H, Becker C,Jiao WB, Schneeberger K, H?lzel N, Tellier A, Meaux J: Strengths and potential pitfalls of hay transfer for ecological restoration revealed by RAD‐seq analysis in floodplain Arabis species.Mol Ecol2019,28:3887–3901.
4.Kiefer C, Willing E-M,Jiao WB, Sun H, Piedno?l M, Hümann U, Hartwig B, Koch MA, Schneeberger K: Interspecies association mapping links reduced CG to TG substitution rates to the loss of gene-body methylation.Nat Plants2019,5:846–855.
5.Zapata L, Ding J, Willing E, Hartwig B, Bezdan D,Jiao WB, Patel V, et al.: Chromosome-level assembly of Arabidopsis thaliana Ler reveals the extent of translocation and inversion polymorphisms.Proc Natl Acad Sci2016,113:E4052–E4060.
6.Zhang J, Chen LL, Sun S, Kudrna D, Copetti D, Li W, Mu T,Jiao WB, Xing F, Lee S, et al.: Building two indica rice reference genomes with PacBio long-read and Illumina paired-end sequencing data.Sci Data2016,3:160076.
7.Zhang J, Chen LL, Xing F, Kudrna DA, Yao W, Copetti D, Mu T, Li W, Song JM, Xie W, Lee S, Talag J, Shao L, An Y, Zhang CL, Ouyang Y, Sun S,Jiao WB, et al.:Extensive sequence divergence between the reference genomes of two elite indica rice varieties Zhenshan 97 and Minghui 63.Proc Natl Acad Sci2016,113:E5163–E5171.
8.Gutjahr C, Gobbato E, Choi J, Riemann M, Johnston MG, Summers W, Carbonnel S, Mansfield C, Yang SY, Nadal M, Acosta I, Takano M,Jiao WB,et al.: Rice perception of symbiotic arbuscular mycorrhizal fungi requires the karrikin receptor complex.Science2015,350:1521–1524.
9.Xu Q, Chen LL, Ruan X, Chen D, Zhu A, Chen C, Bertrand D,Jiao WB, Hao BH, Lyon MP, et al.: The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis).Nat Genet2013,45:59–66.

教育经历

[1]2014.1——2017.6
德国马克斯普朗克植物育种研究所>生物信息学
[2]2014.1——2018.1
德国科隆大学>生物信息学>自然科学博士学位>博士
[3]2010.9——2013.6
华中农业大学>生物化学与分子生物学>理学硕士学位>硕士研究生毕业
[4]2006.9——2010.6
华中农业大学>生物科学>理学学士学位>大学本科毕业

工作经历

[1]2021.4-至今
华中农业大学
教师
[2]2021.1-2021.3
德国慕尼黑大学
博士后
[3]2017.7-2020.12
德国马克思普朗克植物育种研究所
博士后
[4]2021.1-2021.3
德国慕尼黑大学>博士后
合作导师：Korbinian Schneeberger
[5]2017.7-2020.12
德国马克斯普朗克植物育种研究所>博士后
合作导师：Korbinian Schneeberger

研究方向

（1）计算基因组学

华中农业大学

博士生导师
硕士生导师
教师姓名：焦文标
教师拼音名称：Jiao Wenbiao
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办公地点：逸夫楼C508
联系方式：**
学位：博士
职称：研究员（自然科学）
毕业院校：德国马克斯普朗克植物育种研究所；德国科隆大学
所属院系：信息学院
学科：生物学其他专业

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科学研究
当前位置: 中文主页 > 科学研究
研究领域
计算基因组学；比较基因组学；进化基因组学

本课题组依托华中农业大学信息学院和园艺植物生物学教育部重点实验室，主要以柑橘、马铃薯等园艺作物为研究对象，具体研究内容将主要围绕基因组突变、重组、遗传多态性、进化等基本生物学问题展开，结合现有的高通量组学技术（如三代测序技术、单细胞组学技术等）并在此基础上开发适用于特定研究的基因组学技术，并开发相应的生物信息学算法，以解决基因组组装、结构变异识别、基因组进化等计算基因组学领域的关键问题，为园艺作物的遗传改良和品质创新提供指导。

论文成果
Wen-Biao Jiao,Gonzalo Garcia Accinelli, Benjamin Hartwig, Christiane Kiefer, David Baker, Edouard Severing, Eva-Maria Willing, Mathieu Piednoel, Stefan Woetzel, Eva Madrid-Herrero, Bruno Huettel, Ulrike Hümann, Richard Reinhard, Marcus A. Koch, Daniel Swan, Bernardo Clavijo, George Coupland,.Improving and correcting the contiguity of long-read genome assemblies of three plant species using optical mapping and chromosome conformation capture data.Genome Research,2017,27(5):778-786.
Wen-Biao Jiao,Chromosome-level assemblies of multiple Arabidopsis genomes reveal hotspots of rearrangements with altered evolutionary dynamics.Nature Communications,2020,11
The evolutionary dynamics of genetic incompatibilities introduced by duplicated genes in Arabidopsis thaliana.Molecular Biology and Evolution,2021,38(4):1225-1240.

专利
暂无内容

著作成果
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科研项目
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华中农业大学

博士生导师
硕士生导师
教师姓名：焦文标
教师拼音名称：Jiao Wenbiao
电子邮箱：
所在单位：信息学院
办公地点：逸夫楼C508
联系方式：**
学位：博士
职称：研究员（自然科学）
毕业院校：德国马克斯普朗克植物育种研究所；德国科隆大学
所属院系：信息学院
学科：生物学其他专业

同专业博导同专业硕导

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研究领域
当前位置: 中文主页 > 科学研究 > 研究领域
计算基因组学；比较基因组学；进化基因组学

本课题组依托华中农业大学信息学院和园艺植物生物学教育部重点实验室，主要以柑橘、马铃薯等园艺作物为研究对象，具体研究内容将主要围绕基因组突变、重组、遗传多态性、进化等基本生物学问题展开，结合现有的高通量组学技术（如三代测序技术、单细胞组学技术等）并在此基础上开发适用于特定研究的基因组学技术，并开发相应的生物信息学算法，以解决基因组组装、结构变异识别、基因组进化等计算基因组学领域的关键问题，为园艺作物的遗传改良和品质创新提供指导。

华中农业大学

博士生导师
硕士生导师
教师姓名：焦文标
教师拼音名称：Jiao Wenbiao
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办公地点：逸夫楼C508
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学位：博士
职称：研究员（自然科学）
毕业院校：德国马克斯普朗克植物育种研究所；德国科隆大学
所属院系：信息学院
学科：生物学其他专业

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论文成果
当前位置: 中文主页 > 科学研究 > 论文成果
Wen-Biao Jiao,Gonzalo Garcia Accinelli, Benjamin Hartwig, Christiane Kiefer, David Baker, Edouard Severing, Eva-Maria Willing, Mathieu Piednoel, Stefan Woetzel, Eva Madrid-Herrero, Bruno Huettel, Ulrike Hümann, Richard Reinhard, Marcus A. Koch, Daniel Swan, Bernardo Clavijo, George Coupland,.Improving and correcting the contiguity of long-read genome assemblies of three plant species using optical mapping and chromosome conformation capture data.Genome Research,2017,27(5):778-786.
Wen-Biao Jiao,Chromosome-level assemblies of multiple Arabidopsis genomes reveal hotspots of rearrangements with altered evolutionary dynamics.Nature Communications,2020,11
The evolutionary dynamics of genetic incompatibilities introduced by duplicated genes in Arabidopsis thaliana.Molecular Biology and Evolution,2021,38(4):1225-1240.
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