我院研究生教育始于1978年，经过三十余年的发展已形成硕士、博士、博士后多种层次多种类型的中医药人才培养体系。1993年获博士学位授予权。1999年被国务院学位委员会、国家教育部评为“全国学位与研究生教育管理工作先进集体”。2000年经国家教育部批准，开始面向港、澳、台地区招收硕士和博士学位研究生。2006年获中医学一级学科博士学位授予权。2007年设立中医学博士后流动站。

　　我院具有中医学1个一级学科博士学位授予权（覆盖12个二级学科），具有中医学、中西医结合、药学及中药学4个一级学科硕士学位授予权。现有博士研究生指导教师41人，硕士研究生指导教师392人，形成基础与临床、中医与西医、医学与药学有机结合的研究生教育体系。截止2009年12月，在校研究生1074人，其中博士生126人、硕士生826人。30余年来，学校共为社会培养研究生 2962人，其中博士382人、硕士2580人。毕业生遍布全国各地及十几个国家和地区，许多人已成为所在单位学术、业务骨干或国家级、部省级重点学科带头人，还有多人获得全国优秀教师、全国百名杰出青年中医、国家有突出贡献中青年专家、全国中青年科技之星等光荣称号，为中医药事业发展做出了重要贡献。

　　“十一五”期间，我院将全面推进“特色立校、科技兴校、人才强校”三大战略，为确保发展目标的实现，采取有力措施努力实施以“教学改革与质量提高工程”为重点的 “八大工程”（教学改革与质量提高工程、名师名医工程、重点学科建设工程、科技创新工程、教育信息化建设工程、新校区建设工程、人文素质教育工程、毕业生高质量就业工程），积极开展研究生教育创新计划，促进学院学科、学位点建设与研究生教育全面、协调、可持续发展。