海南大学林学院研究生导师个人简介



基本情况
谢尚潜，1985年生，男，博士，教授。
E-mail:sqianxie@foxmail.com

拟招生专业
硕士点：林学学硕、林业专硕

教育背景（从本科开始填写）
2003年09月至2007年07月，湖北大学，计算机专业，本科
2007年09月至2010年07月，湖北大学，遗传学专业，硕士研究生
2010年09月至2013年07月，南京农业大学，作物遗传育种专业，博士研究生
2019年05月至2019年08月，英国University College London，生物信息学，访问****

工作简历
2014年07月至2016年12月，中山大学眼科学国家重点实验室，博士后
2017年01月至今，海南大学

社会兼职及荣誉称号
国家自然科学基金委评议专家
海南省高层次人才

教学情况
主要承担《生物信息学》《生物统计学》等课程教学任务

科研概况
长期从事生物信息学与数据分析研究工作。本科毕业于计算机专业，硕士和博士分别进行数量遗传学和统计基因组学领域研究，并于眼科学国家重点实验室开展生物信息学方向的博士后研究，研究成果入选为“2015年度中国眼科学十大成就之一”。目前已在Nature Methods (IF=27)，Nucleic Acids Research (IF=11)等高水平杂志发表SCI论文十余篇，累计影响因子近100；主持国家级科研项目2项，科研经费100多万元，申请和授权国家发明专利2项，软件著作权2项。近年来主要开展基于基因组学和生物信息学研究，研究方向为：(1)高通量测序数据分析方法开发和应用；(2)热带植物重要功能性状的基因组学研究。详情可见实验室主页：www.xieslab.org

科研项目
1）国家自然科学基金，融入三代测序全长转录组信息的新蛋白鉴定方法(**), 2021.01-2024.12，主持，在研
2）国家自然科学基金，基于三代测序全长转录组的特异性Isoform识别方法研究及特征分析(**), 2018.01-2021.12，主持，在研
3）国家自然科学基金，基于多组学先验信息的串联质谱数据库搜索方法研究及应用(**), 2017.01-2019.12，主持，结题
4）海南省自然科学基金高层次人才基金，一种大规模鉴定翻译蛋白的新方法研究(320RC500), 2021.01-2023.12，主持，在研
5）海南大学科研启动基金，三代测序数据高效校正方法及应用(KYQD(ZR)1721), 2017.01-2022.01，主持，在研
6）海南大学青年基金，三代测序全长转录组的基因表达丰度评估方法研究(hdkyxj201702), 2017.1-2018.12，主持，结题
7) 中国博士后科学基金，融入核糖体谱丰度信息的质谱数据库搜索方法研究(2015M582460), 2015.10-2016.10，主持，结题
8) 海南省重大科技计划项目，热带花卉（三角梅、文心兰）优质高效生产技术研究与示范(zdkj201815)，2018.5-2020.5，参与，在研

第一或通讯作者学术论文（近5年）
1)Zhao-Yu Liu#, Jian-Feng Xing#, Wei Chen#, Mei-Wei Luan, Rui Xie, Jing Huang, Shang-Qian Xie*, Chuan-Le Xiao*. MDR: an integrative DNA N6-methyladenine and N4-methylcytosine modification database for Rosaceae. 2019, Horticulture Research, 6:78 (通讯作者)
2)Wen-Tai Ma#, Zhao-Yu Liu#, Xiao-Zhou Chen#, Zhen-Liang Lin, Zhong-Bing Zheng, Wei-Guo Miao*, Shang-Qian Xie*. A protein identification algorithm for tandem mass spectrometry by incorporating the abundance of mRNA into a binomial probability scoring model. 2019, Journal of Proteomics, 197:53-59 (通讯作者)
3)Chuan-Le Xiao, Ying Chen, Shang-Qian Xie, Kai-Ning Chen, Yan Wang, Yue Han, Feng Luo, Zhi Xie. MECAT: fast mapping, error correction, and de novo assembly for single-molecule sequencing reads. 2017, Nature Methods, 14(11):1702-1704.
4)Shang-Qian Xie, Peng Nie, Yan Wang, Hongwei Wang, Hongyu Li, Zhilong Yang, Jian Ren, Zhi Xie. RPFdb: a database for genome wide information of translated mRNA generated from ribosome profiling. 2016, Nucleic Acids Research, 44: D254-258
5)Ying Chen#, Fan Nie#, Shang-Qian Xie#, Ying-Feng Zheng#, Qi Da#, Thomas Bray, Yao-Xin Wang, Jian-feng Xing, Zhi-Jian Huang, De-Peng Wang, Li-Juan He, Feng Luo*, Jian-Xin Wang*, Yi-Zhi Liu*, Chuan-Le Xiao*. Efficient assembly of Nanopore reads via highly accurate and intact error correction. 2021, Nature Communications, accepted (Co-first author)
所有论文列表请参见：www.xieslab.org/#/pub

申请/授权专利
1)谢尚潜，肖传乐，谢志. 基于多组学丰度信息的蛋白质二级质谱鉴定方法（专利号：0.7）.
2)谢尚潜，刘宇枭，林加论，邢剑锋. 一种单细胞测序的数据分类方法（专利号：1.7）