个人简历

王丽美，副教授，在读博士
海南医学院 生物医学信息与工程学院

个人简介：
王丽美，39岁，具有计算机、统计学、信息学等学术背景，自2004年参加工作以来长期从事计算机及生物信息学教学与科研工作。目前主要研究方向为癌症系统生物学(Cancer Systems Biology)，尤其是癌症风险通路挖掘(Cancer risk pathway mining)、基因-基因互作(Gene-Gene Interaction)等。
曾主持黑龙江省教育厅课题1项、省卫生厅课题1项，参与国家自然科学基金3项、黑龙江省自然科学基金1项，参与美国NIH项目三项。发表SCI收录学术论文12篇，被引用次数100余次，其中第一作者9篇。曾在美国印第安纳大学和俄亥俄州立大学生物医学信息系做访问学者四年。访问学习期间曾参加国际生物信息学会议（ICIBM 2019），会议收录了本人第一作者学术论文。在教学一线工作12年，承担医学计算机应用、大学计算机基础、生物医学信息学、R语言程序设计等课程的教学工作。曾获得青年教师教学基本功竞赛三等奖，院级演讲大赛一等奖等荣誉。

工作经历
2020.11至今 海南医学院 生物医学信息与工程学院 副教授
2018.4-2020.10 美国俄亥俄州立大学 生物医学信息系 访问学者
2016.12-2018.3 美国印第安纳大学 生物信息学中心 访问学者
2015.9-2020.10 哈尔滨医科大学 基础医学院 副教授
2009.9-2015.8 哈尔滨医科大学 基础医学院 讲师
2004.7-2009.8 哈尔滨医科大学 基础医学院 助教


学习经历
2015.9-2022.1 哈尔滨工程大学 智能科学与工程学院
控制科学与工程（生物信息学方向）
在读博士 导师：冯伟兴（教授）
2007.9-2010.6 哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院
生物医学工程 硕士 导师：李霞（教授）
2000.9-2004.7 哈尔滨师范大学 计算机科学与技术 学士

科研课题
1.2021.4-2023.12 《整合多组学数据的细胞系特异药物协同作用预测研究》 海南省自然科学基金面上项目（5万） 参与 在研
2.2017.1-2019.12 《基于生物通路的类风湿性关节炎相关风险因子识别及其调控机制研究》 国家自然科学基金青年项目（81601422，17.5万） 参与 已结题
3.2014.1-2016.12 《人类microRNA识别及其与疾病关联预测方法研究》 国家自然科学基金青年项目（61302139，25万） 参与 已结题
4.2014.1-2016.12 《面向人类复杂疾病的eQTL模块挖掘及其meta分析方法研究》 国家自然科学基金青年项目（61300116，23万） 参与 已结题
5.2014.1-2016.12 《全基因组meta-eQTL模型挖掘人类复杂疾病风险模块》 黑龙江省自然科学基金青年项目（QC2013C063，5万） 参与 已结题
6.2013.1-2015.12 《基于最优特征子集的宿主miRNA在HIV基因组的靶基因预测研究》 黑龙江省教育厅面上项目（12531299，2万） 主持 已结题
7.2012.1-2013.12 《基于最优特征子集的microRNA预测平台的研究与开发》黑龙江省卫生厅项目 主持 已结题





已发表SCI学术论文

1.Limei Wang, et al., DysPIA: A novel Dysregulated Pathway Identification Analysis method. Frontiers in Genetics, 2021.6, on press.
2.Weixin Xie#, Limei Wang#, et al., Integrated Random Negative Sampling and Uncertainty Sampling in Active Learning Improves Clinical Drug Safety Drug-Drug Interaction Information Retrieval. Frontiers in Pharmacology, 2021, 11: p.2225.
3.Xiaozong Lin, Li Li*, Xiaojuan Liu, Jun Tian, Weizhuo Zheng, Jin Li, Limei Wang*, Genome-wide analysis of aberrant methylation of enhancer DNA in human osteoarthritis. BMC Medical Genomics, 2020, 13(1).
4.Limei Wang#, Jin Li#, Enze Liu, Garrett Kinnebrew, Xiaoli Zhang, Daniel Stover, Yang Huo, Zhi Zeng, Wanli Jiang, Lijun Cheng, Weixing Feng*, Lang Li*, Identification of Alternatively-Activated Pathways between Primary Breast Cancer and Liver Metastatic Cancer Using Microarray Data. Genes, 2019.10(10): p. 753.
5.Jin Li#, Limei Wang#, Tao Jiang, Jizhe Wang, Xue Li, Xiaoyan Liu, Chunyu Wang, Zhixia Teng, Ruijie Zhang*, Hongchao Lv, Maozu Guo*, eSNPO: An eQTL-based SNP Ontology and SNP functional enrichment analysis platform. Scientific reports, 2016, 6: 30595.
6.Jin Li#, Dongli Huang#, Maozu Guo*, Xiaoyan Liu, Chunyu Wang, Zhixia Teng, Ruijie Zhang, Yongshuai Jiang, Hongchao Lv, Limei Wang*, A gene-based information gain method for detecting gene-gene interactions in case-control studies. European journal of human genetics, 2015, 23(11): 1566-1572.
7.Jin Li#, *, Limei Wang#, Maomu Guo*, Ruijie Zhang, Qiguo Dai, Xiaoyan Liu, Chunyu Wang, Zhixia Teng, Ping Xuan, Mingming Zhang, Mining disease genes using integrated protein–protein interaction and gene–gene co‐regulation information. FEBS Open Bio, 2015, 5(1): p. 251-256.
8.Jin Li#, Limei Wang#, Huimin Li#, Ruijie Zhang, Xia Li*, Maozu Guo*, Relationship of common expression quantitative trait loci genes to the immune system. Genetics and Molecular Research, 2013, 12(4): p. 6546-6553.
9.Jin Li#, Limei Wang#, Liangde Xu#, Ruijie Zhang*, Meilin Huang, Ke Wang, Jiankai Xu, Hongchao Lv, Zhenwei Shang, MingmingZhang, Yongshuai Jiang, Maozu Guo*, Xia Li*, DBGSA: a novel method of distance-based gene set analysis. Journal of human genetics, 2012, 57(10): p. 642-653.
10.Limei Wang, Jin Li, Rongsheng Zhu, Liangde Xu, Ying He, Ruijie Zhang*, Shaoqi Rao*, A novel stepwise support vector machine (SVM) method based on optimal feature combination for predicting miRNA precursors. African Journal of Biotechnology, 2011, 10(74): p. 16720-16731.
11.Hui Yu*, Limei Wang, Danqian Chen, Jin Li, Yan Guo*, Conditional transcriptional relationships may serve as cancer prognostic markers. BMC Medical Genomics, 2021, Accepted.
12.Lijun Cheng#, Pankita H. Pandya#, Enze Liu, Pooja Chandra, Limei Wang, Mary E. Murray, Jacquelyn Carter, Michael Ferguson, Mohammad Reza Saadatzadeh, Khadijeh Bijangi-Visheshsaraei, Mark Marshall, Lang Li*, Karen E. Pollok*, Jamie L. Renbarger*, Integration of genomic copy number variations and chemotherapy-response biomarkers in pediatric sarcoma. BMC Medical Genomics, 2019, 12: p. 23.
13.Varshini Vasudevaraja, Jamie Renbarger, Ridhhi Girish Shah, Garrett Kinnebrew, Murray Korc, Limei Wang, Yang Huo, Enze Liu, Lang Li*, Lijun Cheng*, PMTDS: a computational method based on genetic interaction networks for Precision Medicine Target-Drug Selection in caner, Quantitative Biology. 2017, 5(4): 380–394.