李孔宁简历
1.个人情况概括
教授，博士生导师。1989自中国科学院上海技术物理研究所硕士毕业后，进入哈尔滨医科大学从事教学的同时进行计算机软硬件在医疗与工业技术方面的应用研究。 1999年出国留学，先后在日本凸版技术设计中心、加拿大AMD公司和IGNIS创新技术公司任高级工程师及项目负责人，从事计算机与平板显示图形驱动控制软硬件系统的研究。2009年回国继续在哈尔滨医科大学任教并从事生物信息学研究。2019年通过人才引进加入海南医学院生物医学信息与工程学院负责生物医学信息团队建设、教学及科研。
2.研究方向
复杂疾病多组学数据及生物标志物研究
3.发表科研论文（*为通讯作者）：
（1）Dahua Xu, Liqiang Wang, Sainan Pang, Meng Cao, Wenxiang Wang, Xiaorong Yu, Zhizhou Xu, Jiankai Xu, Hong Wang*, Jianping Lu* and Kongning Li*（李孔宁）: The functional characterization of epigenetically regulated lncRNAs involved in dysregulated ceRNA-ceRNA networks across 8 cancer types, Frontier in Cell and Development Biology, 2021.6 (SCI IF: 5.201)
（2）Chunhua Li, Xiaorong Yu, Jianping Lu, Liyu Zheng, Dahua Xu, Zelong Xu, Liqiang Wang, Ying Cui, Yeshuang Li, Hong Wang*, Jiankai Xu*, and Kongning Li*（李孔宁）：Contributions of Gene Modules Regulated by Essential Noncoding RNA in Colon Adenocarcinoma Progression，BioMed Research International, 2020.3 （SCI IF：2.197）
（3）Chunrui Zhang, Jing Jiang, Liqiang Wang, Liyu Zheng, Jiankai Xu, Xiaolin Qi, Huiying Huang, Jianping Lu*, Kongning Li*（李孔宁） and Hong Wang*：Identification of Autophagy-Associated Biomarkers and Corresponding Regulatory Factors in the Progression of Colorectal Cancer, Frontiers in Genetics, 2020.3, 11(245)（SCI IF：3.517）
（4）王红，黄惠英，郑立宇,李孔宁*：PD-L1介导的胰腺癌ceRNA网络机制解析及标志物识别，国际免疫学杂志，2019.11, 第42卷第６期(562-5)
（5）Kun Qian, Huiying Huang, Jing Jiang, Dahua Xu, Shengnan Guo, Ying Cui, Hao Wang, Liqiang Wang* and Kongning Li*（李孔宁)：Identifying autophagy gene-associated module biomarkers through construction and analysis of autophagy-mediated ceRNA-ceRNA interaction network in colorectal cancer，International Journal of Oncology，2018.4(SCI IF: 3.571)
（6）Hong Wang, Dahua Xu, Huiying Huang, Ying Cui, Chunhua Li, Chunrui Zhang, Shengnan Guo, Lining Zhang, Xiaomu Xu, Jiankai Xu, Jianping Lu, Liqiang Wang* and Kongning Li*（李孔宁): Detection of dysregulated competing endogenous RNA modules associated with clear cell kidney carcinoma, Molecular Medicine Reports, 2018.4（SCI IF: 1.851）
（7）Ting Zhang, Puwen Tan, Liqiang Wang, Nana Jin, Yana Li, Lin Zhang,Huan Yang, Zhenyu Hu, Lining Zhang, Chunyu Hu, Chunhua Li, Kun Qian, Changjian Zhang, Yan Huang, Kongning Li*（李孔宁), Hao Lin* and Dong Wang*：RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations，Nucleic Acids Research, 2017, D135–D138（SCI IF: 11.147）
（8）王红，张纯瑞，王利强，胡振宇，黄俞玮，李孔宁*：ncRNA层面病毒入侵宿主机制的研究，哈尔滨医科大学学报，2016.12, Vol.50, No.6(501-3)
（9）Yanhui Li, Changliang Wang1, Zhengqiang Miao, Xiaoman Bi, Deng Wu, Nana Jin1, Liqiang Wang, HaoWu, Kun Qian, Chunhua Li, Ting Zhang, Chunrui Zhang, Ying Yi, Hongyan Lai, Yongfei Hu, Lixin Cheng, Kwong-Sak Leung, Xiaobo Li, Fengmin Zhang, Kongning Li*(李孔宁), Xia Li*, and Dong Wang*: ViRBase: a resource for virus–host ncRNA-associated Interactions, Nucleic Acids Research, 2015, D578-82 (SCI IF: 11.147)
（10）Nana Jin，Hao Wu, Zhengqiang Miao, Yan Huang, Yongfei Hu, Xiaoman Bi, Deng Wu,Kun Qian, Liqiang Wang, Changliang Wang, Hongwei Wang, Kongning Li*（李孔宁), Xia Li* & Dong Wang*：Network-based survival-associated module biomarker and its crosstalk with cell death genes in ovarian cancer，Scientific Reports，2015，5:11566(SCI IF: 4.011)
（11）Liqiang Wang,?Kun Qian,?Yan Huang,?Nana Jin,?Hongyan Lai,?Ting Zhang,?Chunhua Li,?Chunrui Zhang, Xiaoman Bi,?Deng Wu,?Changliang Wang,?Hao Wu,?Puwen Tan,?Jianping Lu,?Liqun Chen,?Kongning Li*(李孔宁),?Xia Li*,?and?Dong Wang*：SynBioLGDB: a resource for experimentally validated logic gates in synthetic biology，Scientific Reports，2015, 5:8090 (SCI IF: 4.011)
（12）Deng Wu, Yan Huang, Juanjuan Kang, Kongning Li(李孔宁，并列1), Xiaoman Bi, Ting Zhang, Nana Jin, Yongfei Hu, Puwen Tan, Lu Zhang, Ying Yi, Wenjun Shen, Jian Huang, Xiaobo Li, Xia Li*, Jianzhen Xu*, and Dong Wang*: ncRDeathDB: A comprehensive bioinformatics resource for deciphering network organization of the ncRNA-mediated cell death system, Autophagy, 2015, 11(10):1917-26 (SCI IF: 11.059)
（13）Nannan Liu, Chunhua Li, Yan Huang, Ying Yi, Wanlan Bo, Chunmiao Li, Yue Li, Yongfei Hu, Kongning Li(李孔宁), Hong Wang, Liwei Zhuang, Huihui Fan* & Dong Wang*: A functional module-based exploration between inflammation and cancer in esophagus, Scientific Reports, 2015, 5:15340 (SCI IF: 4.011)
（14）Yun Wu, Nana Jin, Haiyang Zhu, Chunmiao Li, Nannan Liu, Yan Huang, Zhengqiang Miao, Xiaoman Bi, Deng Wu, Xi Chen, Yun Xiao, Dapeng Hao, Chuanxing Li, Binsheng Gong, Shaojun Zhang, Liwei Zhuang*, Kongning Li*(李孔宁) and Dong Wang*: Global gene expression distribution in non-cancerous complex diseases, Molecular BioSystems 2014, 10(4):728-31 (SCI IF: 2.855)
（15）Xu Jia, Zhengqiang Miao, Wan Li, Liangcai Zhang, Chenchen Feng, Yuehan He, Xiaoman Bi, Liqiang Wang, Youwen Du, Min Hou, Dapeng Hao, Yun Xiao, Lina Chen*, Kongning Li*(李孔宁)：Cancer-risk Module Identification and Module-based Disease Risk Evaluation: A Case Study on Lung Cancer，PLOS ONE, 2014, 9(3):e92395 (SCI IF: 2.776)
（16）Nana Jin, Deng Wu, Yonghui Gong, Xiaoman Bi, Hong Jiang, Kongning Li*(李孔宁) and Qianghu Wang*：Integration Strategy Is a Key Step in Network-Based Analysis and Dramatically Affects Network Topological Properties and Inferring Outcomes，BioMed Research International，2014, 2014:296349 (SCI IF: 2.197)
（17）Kongning Li(李孔宁), Deng Wu, Xi Chen, Ting Zhang, Lu Zhang, Ying Yi, Zhengqiang Miao, Nana Jin, Xiaoman Bi, Hongwei Wang*, Jianzhen Xu*, and DongWang*: Current and Emerging Biomarkers of Cell Death in Human Disease, BioMed Research International, 2014, 2014:690103 (SCI IF: 2.197)
（18）Xiaomeng Zhang, Deng Wu, Liqun Chen, Xiang Li, Jinxurong Yang, Dandan Fan, Tingting Dong, Mingyue Liu, Puwen Tan, Jintian Xu, Ying Yi, Yuting Wang, Hua Zou, Yongfei Hu, Kaili Fan, Juanjuan Kang, Yan Huang, Zhengqiang Miao, Miaoman Bi, Nana Jin, Kongning Li(李孔宁), Xia Li*, Jianzhen Xu* and Dong Wang*：RAID: a comprehensive resource for human RNA-associated (RNA–RNA/RNA–protein) interaction，RNA，2014, 20(7):989-93 (SCI IF: 3.949)
（19）Deng Wu, Juanjuan Kang, Yan Huang, Xiang Li, Xiansong Wang, Dan Huang, Yuting Wang, Bin Li, Dapeng Hao, Qi Gu, Nelson Tang, Kongning Li(李孔宁), Zheng Guo, Xia Li*, Jianzhen Xu* and Dong Wang*：Deciphering global signal features of high-throughput array data from cancers, Molecular BioSystems，2014, 10(6): 1549-1556 (SCI IF: 2.855)
（20）Chunquan Li, Junwei Han, Desi Shang, Jing Li, Yan Wang, YingYing Wang, Yunpeng Zhang, Qianlan Yao, Chunlong Zhang, Kongning Li*(李孔宁), Xia Li*：Identifying disease related sub-pathways for analysis of genome-wide association studies, Gene, 2012, 503(1):101-9 (SCI FI: 2.638)
4.学术成果奖励
李孔宁 陈宏，无创双水平呼吸机远程信号调控模块和云平台的研发与搭建, 教育部, 第二届中国“互联网+”大学生创新创业大赛铜奖, 2016.
5.已获授权发明专利：
（1）李孔宁，陈宏，王利强，吴宇晗；一种无创双水平呼吸机远程信号调控系统；ZL201720087071.9（中国国家知识产权局）
（2）王凯，李孔宁；一种生物大分子荷质比的测量装置及方法；ZL 201520863324.8（中国国家知识产权局）
（3）李孔宁，郑晟，王利强，苗正强，王栋，张绍军，李霞；一种便携式体征信号监测装置； ZL 201420033857.9（中国国家知识产权局）
（4）李孔宁，王凯，夏国杰，宫滨生，杜磊，李霞；一种电泳成分分析方法和系统； ZL 201010263477.0（中国国家知识产权局）
（5）LI KONGNING（李孔宁），GUPTA VASUDHA，CHAJI GHOLAMREZA， NATHAN AROKIA；Driving system for active-matrix display（用于有源矩阵显示器的驱动系统）； US2011069096（美国专利商标局），JP2011070184（日本专利局），EP2299427（欧洲专利局）， CN102024418（中国国家知识产权局），CA2714827（加拿大知识产权局）
（6）LI KONGNING（李孔宁），LEUNG CHARLES，TEMKINE GRIGORI，ALEKSIC MILIVOJE， TURNER STEVEN，VANSICKLE GREG，O'NEIL KEVIN；Reduced Component Digital to Analog Decoder and Method（减少组件的数模解码器和方法）； US7385545（美国专利商标局），JP2010516067（日本专利局），EP2064813（欧洲专利局），WO2008026067（世界知识产权组织），CN101523730（中国国家知识产权局），KR20090074166（韩国知识产权局）
（7）LI KONGNING（李孔宁）；Reduced Component Display Driver and Method（部件减少的显示驱动器和方法）； US2008055227（美国专利商标局），JP2010503008（日本专利局），EP2064696（欧洲专利局），CN101542578（中国国家知识产权局）；类别：发明
（8）LI KONGNING（李孔宁），GUPTA VASUDHA，CHAJI G REZA；Implementation of Hybrid Driving Scheme with Multiple Gamma Curves； CA2678509（加拿大知识产权局）
（9）LI KONGNING（李孔宁）；GUPTA VASUDHA；CHAJI G REZA；Improving the Display Source Driver； CA2637343（加拿大知识产权局）
（10）REZA CHAJI G，KONGNING LI（李孔宁），VASUDHA GUPTA，AROKIA NATHAN；Method and System For Driving Light Emitting Display（用于驱动发光显示器的方法和系统）； US2010039453（美国专利商标局），WO2010012083（世界知识产权组织），CA2672590（加拿大知识产权局）
（11）李孔宁；浸入式光电液面传感器； ZL94224001.4（中国专利局）
6.科研项目
（1）海南医学院人才科研启动费，肿瘤FOX家族及其关键基因FOXM1的多组学分子特征研究，2021.5-2026.4，50万，在研，主持
（2）海南省科技厅，省自然科学基金高层次人才项目，820RC637，基于泛癌失调ceRNA互作网络解析表观调控lncRNA的功能，2020-12至2023-12，7万元，在研，主持
（3）海南省省重大科技计划项目，ZDKJ202003，海南省重大传染病关键防控技术研究与应用，2020-12至2023-12，800万，在研，参加
（4）国家重点研发计划，灵长类增龄相关健康状态减损的生物学基础，2018YFC2000100，科技部，2018.12-2022.12，50万元，在研，分任务主持
（5）国家自然科学基金委青年基金项目，31501075，动态差异DNA甲基化驱动的泛癌风险因子识别及其作用机制研究，2016-01至2018-12，20万，结题，参加（第一）
（6）黑龙江省自然科学基金重点项目，ZD201114，用于无标记生物电泳检测的薄膜晶体管电荷传感器的研究，2012-01至2014-12，20万，结题，主持
（7）黑龙江省教育厅海外学人项目，1155H012，复杂疾病基因识别系统融合分析方法，2011-01至2013-12，5万，结题，主持
7.学术荣誉
海南省拔尖人才
8.学术兼职
黑龙江省生物信息学会理事
海南省免疫学会肿瘤免疫专业委员会副主任委员
海南医学院学术委员会委员