遵义医学院口腔医学系是1978年经国家科委和贵州省教委批准设立的。是贵州省唯一培养口腔医学研究生、本科生和专科生等高级专业人才，并集教学、科研为一体的教育和科研基地。1998年经国家学位评审委员会批准，获得口腔临床医学（含口腔内科学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔正畸学及口腔预防与儿童牙病）硕士学位授予权。
　　
　　口腔医学系设有口腔解剖生理学、口腔组织病理学2个基础医学教研室；口腔内科学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔正畸学、口腔预防医学、儿童牙病和口腔放射7个临床医学教研室，1个口腔医学研究室。有教职工100余人（含附属医院口腔医院职工），其中教授2人，副教授23人，讲师（主管护、技师）38人，博士3人，在读博士2人，硕士10人，在读硕士生8人，出国留学2人。口腔医学系创办20余年来，共招收硕士研究生21人，本科生600人，专科生200余人，进修生150人，为台湾省培养了26名高级口腔医师，毕业生分布在全国各地。现每年招收硕士生8~10名，本科生60名，专升本20名，专科生30名。生源主要来自于贵州、广东、广西、湖北、湖南、四川等10个省（区）。
　　
　　实习医院有遵义医学院附属口腔医院、贵阳市口腔医院、昆明市口腔医院、大连铁路医院、成都铁路医院等8家专科或综合医院。遵义医学院附属口腔医院设有8个临床科室，3个辅助科室，床位50张，牙科综合治疗椅81台，固定资产近1000万元。医疗设备以进口产品为主，主要有曲面断层X线机、烤瓷机、麻醉机、隐形义齿机、四环素脱色机、激光治疗仪和牙种植机等。
　　
　　口腔医学系的科研水平在省内处于领先地位，在口腔医学信息网络工程、龋病免疫学防治和头颈部肿瘤防治等方面处于全国先进水平。先后获得省厅级科研成果奖16项，主编（参编）专著6部，发表论文300余篇。还与四川大学华西口腔医学院（原华西医科大学口腔医学院）、北京大学口腔医学院（原北京医科大学口腔医学院）、第四军医大学口腔医学院、上海第二医科大学口腔医学院、武汉大学口腔医学院（原湖北医科大学口腔医学院）有着密切的教学合作。与美国哈佛大学牙学院、丹麦皇家牙学院、香港大学牙学院和瑞典乌默奥大学牙学院等国外名牌大学有着广泛的学术交流。全国牙病防治指导组信息网络协助组设在本系。
　　
　　口腔医学系坚持以教学为中心，以创一流服务、一流技术、一流设备、一流管理体制为目标，走教学为主，科教兴院，工副助医，健康发展的特色之路，积极为口腔医学教育事业作出新的贡献。