基础医学院是贵阳医学院最大的处级教学单位。现有4个行政科室（综合办公室、教学科研管理科、学生科、团委）16个教研室（包括4个公共基础课教研室﹤数学、物理、化学、计算机﹥、12个医学基础课教研室﹤人体解剖学、组织胚胎学、生物学、寄生虫学、微生物学、免疫学、法医学、生物化学及分子生物学生理学、药理学、病理生理学、医学生物技术学>）和5个实验中心（蛋白组学重点实验室、多媒体机能学实验中心、多媒体形态实验中心、计算机教学实验中心、理化实验中心）。现有8个教工党支部和1个学生党支部。

　　基础医学院现有在编教职工263人，其中教授26人，副教授47人，博士5人，硕士81人。现有硕士学位授予点8个，目前已获博士学位授予点1个，正在申报博士学位授予点1个。现有博士生导师4人，硕士生导师30余人，在读硕士研究生42名。每年承担学院近43 %的教学任务。2001年，基础医学院理化实验中心、计算机教学实验中心和多媒体机能实验室已顺利通过贵州省教育厅评估。人体解剖学与组织胚胎学、病原生物学、病理学、生物化学与分子生物学四个学科被评为省级重点学科，每年均获得省政府的重点资助。基础医学院分管临床医学及各专业的学生近2500人。

　　近5年来，基础医学院获国家自然科学基金科研项目8项，省部级项目50余项，厅局级项目100余项，国内外公开发表论文近500余篇，参加国际国内学术会议约300人次；每年均有部分课题通过主管部门成果鉴定，并分别获部、省、市级成果奖励多项。基础医学院注重与国内外的学术交流。改革开放以来，每年均有科技人员被派赴国外进行交流、访问、学习。现已有近30人出国学习、交流和攻读学位，其中半数已回到原工作岗位并成为各学科的中坚力量。同时，每年还邀请一些国内外专家教授来我部讲学与合作交流。基础医学院先后有一批同志和单位获全国和省市级先进教师、全国“五·一”劳动者奖章、优秀思想政治工作者、全省德育标兵、全省“三八”红旗单位、全省优秀共产党员、全省先进基层党组织、全国优秀班集体等荣誉称号。