本所还先后编辑出版了《东南亚问题》、《东南亚历史论丛》、《东南亚历史译丛》、《东南亚学刊》等学术刊物和有关东南亚和华侨华人问题的论文集，以其较高的学术质量与参考价值获得国内外学者及有关部门的好评。现出版定期刊物为《亚太研究》。
本所长期担负研究生培养任务，教学工作促进了科研水平的提高。早在60年代，中山大学历史系就已开始招收东南亚历史方向的研究生。1978年本所设立世界地区史、国别史硕士点以来，已招收硕士研究生（包括港澳台地区研究生和国外留学生）逾50人。1998年获得世界史专业博士学位授予权，开始招收博士研究生。2002年起招收国际关系专业硕士研究生。

目前本所已积累了丰富的教学工作经验，课程设置完整，涉及面广。主要学位课和选修课包括：东南亚古代史、东南亚近代史、东南亚现代史、中国与东南亚关系史、华侨华人问题研究、当代东南亚国际关系、东南亚经济、东南亚政治、东南亚宗教与文化、有关东南亚中外名著评介等。

本所曾主办一系列国际与国内学术活动。1985年主办国内第一次华侨华人历史国际研讨会，1989年主办2000年前后中国与东南亚关系展望研讨会，1994年主办面向21世纪的区域合作：中国与东南亚国际研讨会。

本所占有图书资料丰富，现有图书１２０００册以上，其中外文（包括东南亚国家语种）图书约占５０％，中外文期刊约３５０种，中外文报纸约５０种，大部分东南亚国家的报纸本所均有订阅。此外还有一批会议文献和微缩胶卷。除自行订购外，国外机构和个人也向本所赠送了大量珍贵图书资料。图书资料室配置了计算机及有关辅助设备，并已接通国际互联网络。

与本所保持较密切交流关系的高校和学术机构包括：美国华人历史学会、澳大利亚格里菲斯大学、新加坡国立大学、新加坡东南亚研究院、新加坡东亚研究所、新加坡南洋学会、泰国朱拉隆功大学亚洲研究所、泰国法政大学东亚研究所、泰国华侨崇圣大学、菲律宾大学亚洲研究中心、菲律宾德拉萨大学、菲中发展资源中心、越南国家社会与人文科研中心东南亚研究所和中国研究所、河内国家大学、胡志明市综合大学、仰光大学、香港大学亚洲研究中心、香港亚太二十一学会等。

本所曾先后聘请了德国汉堡大学著名东南亚问题专家傅吾康博士、泰国法政大学原副校长，著名政治学家里奇博士为客座教授。现任客座教授为香港大学原副校长兼亚洲研究中心主任黄绍伦博士、香港浸会大学教授兼香港亚太二十一学会主席黄枝连先生。
东南亚研究所出版学术专著（1990-2001）
《菲律宾史》 金应熙、刘迪辉等，河南大学出版社1990年版
《2000年前后中国与东南亚关系展望》许肇琳等主编，中山大学出版社1991年版
《台山侨乡与新宁铁路》郑德华、成露西著，中山大学出版社1991年版
《泰国史散论》 段立生著，广西人民出版社1993年版
《东盟国家经贸指南》刘迪辉、周明伟，广西人民出版社1993年版
《东南亚投资环境》 刘迪辉主编，贵州人民出版社1994年版
《晚清侨务与中外交涉》 袁丁著，西北大学出版社1994年版
《元代海外贸易》 喻常森著，西北大学出版社1994年版
《走遍美国》 段立生著，岭南美术出版社1994年版
《郑午楼传》 段立生著，中山大学出版社1994年版
《周边国家丛书·文莱》 马宁著，广西人民出版社1994年版
《周边国家丛书·缅甸》 余定邦等，广西人民出版社1995年版
《周边国家丛书·柬埔寨》 许肇琳等，广西人民出版社1995年版
《东南亚近代史》 余定邦著，贵州人民出版社1996年版
《泰国的中式寺庙》 段立生著，泰国大同社出版有限公司1996年版
《东南亚股票市场》 袁丁著，贵州人民出版社1997年版
《现代东南亚政治与外交》 汪新生著，广西人民出版社1998年3月版
《近代中国与东南亚关系史》 余定邦、喻常森著，中山大学出版社1999年2月版
《近代广东侨汇研究》 林家劲等著，中山大学出版社1999年12月版
《二战后东南亚华侨华人史》 温广益主编，中山大学出版社2000年9月版
《中缅关系史》 余定邦著，光明日报出版社2000年12月版
《辽金与高丽关系考》 魏志江著，香港天马图书有限公司2001年12月版