任间

Submitted on 周一, 10/30/2017 - 20:36


性别
男

个人主页
http://renlab.org

电子邮件
renjian@sysucc.org.cn

职称
教授

导师类型
博士生导师

学历
博士

学科方向
0710生物学-10生物化学与分子生物学
0710生物学-Z1生物信息学


研究方向
主要从事生物大分子修饰（蛋白质翻译后修饰，RNA修饰）、基因编辑、肿瘤基因组学和生物图像识别相关生物信息学与实验研究。

个人经历
1998至2002年就读于上海交通大学动力与能源工程学院，获核工程与核技术专业学士学位。2002至2007年在中国科学技术大学近代物理系金革教授实验室攻读博士期间参与国家大科学工程项目"大天区面积多目标光纤光谱望远镜"（LAMOST），并承担其中的巡天战略系统的研发工作，在计算机算法和大型工程软件设计开发方面具有丰富的经验。2007年7月获得物理电子学工学博士学位之后进入中国科学技术大学生命科学学院温龙平研究组进行博士后研究工作,将计算机和天文学算法以及工程学思想成功运用到生物信息学领域，在蛋白质组生物信息学方面取得了丰富成果。主要包括设计出高效的GPS（Group-based Prediction System）预测算法，并基于该算法开发出十多种蛋白质翻译后修饰位点预测工具，此外还构建多个蛋白质相关数据库及辅助工具。2010 年3月获中山大学生命科学学院“****”引进，2011年12月晋升教授。
1998.09 – 2002.07????? 学士??????????????????? 上海交通大学动力与能源工程学院核工程与自动化专业
2002.09 – 2007.06????? 博士??????????????????? 中国科学技术大学近代物理系物理电子学专业
2007.07 – 2010.03????? 博士后???????????????? 中国科学技术大学生命科学学院
2010.03 – 2011.12????? 副教授??????????????? 中山大学生命科学学院
2011.12 – 今?????????????? 教授???????????????????? 中山大学生命科学学院
2012.05 – 今?????????????? 部长??????????????????? 高性能计算2011协同创新中心应用研发部
2012.11 – 今?????????????? 主任??????????????????? 中山大学生命科学学院生物信息学中心
2014.07– 今??????????????? 教授（双聘）????? 中山大学肿瘤防治中心

讲授课程
《生物信息学》，《蛋白质组学》

学术成就
2007年进入生物领域后，在包括Nucleic Acids Research（9篇）, Cell Research（2篇）, Cancer Research, Bioinformatics, MCP（3篇）等国际著名杂志上发表SCI 论文60余篇（13篇IF>10.0），其中通讯或一作33篇，累计影响因子350，ESI高被引论文3篇。所发布的GPS系列工具在蛋白质翻译后修饰领域受到广泛关注，推动了该领域发展，相关文章已被包括Nature、Science及Cell系列杂志在内的文章引用3500余次，H-index 25。主持国家自然科学基金5项，作为骨干参与科技部项目4项。发布生物信息学工具及数据库30多个，获颁软件著作权登记证书15项。
在产业化方面，2016年创立锐竞科研采购平台（https://www.rjmart.cn），并担任CEO。锐竞平台已有来自全国的10000多家供应商入驻，上线了1500多万种科研试剂耗材及各类服务，目前已经是全国最大的科研电商平台。以中山大学及其附属医院、南方医科大学、温州医科大学、哈尔滨医科大学、郑大一附院等为代表的100多家高校与医院已经使用该平台采购了40亿元的科研用品。有效地降低了科研采购成本，同时把科研人员从“报销繁”中解脱出来。锐竞也推出了科研协作与成果转化平台（https://cooperation.rjmart.cn），致力于促进科研人员与企业之间的合作，提高科技成果转化率。锐竞平台2019年获第八届中国创新创业大赛广东省第三名，全国总决赛优秀企业奖。

承担课题
1.?? ?国家自然科学基金重大研究计划培育项目，**，基于深度学习算法的生物大分子修饰分析平台的构建及应用，2018/01-2020/12，70万，在研，主持。
2.?? ?国家自然科学基金面上项目，**，单碱基精度RNA甲基化修饰组学数据分析工具构建及应用，2018/01-2021/12，60万，在研，主持。
3.?? ?广州市健康医疗协同创新重大专项，3，鼻咽癌和结直肠癌生物医学大数据平台建设及精准医疗应用研究，2016/01-2018/12，154.2/600万，在研，参与。
4.?? ?广州市健康医疗协同创新重大专项，1，医学外显子组高通量检测产业化规模应用关键问题研究，2016/05-2019/04，80/800万，在研，参与。
5.?? ?“广东特支计划” 科技创新青年拔尖人才，2014TQ01R387，2015/04-2018/03，30万，在研，主持。
6.?? ?国家自然科学基金面上项目，**，基于双分子荧光互补技术的小类泛素修饰因子调控机制的系统研究，2015/01-2018/12，85万，在研，主持。
7.?? ?国家国际科技合作专项，2014DFB30020，中国人类蛋白质组学数据的知识发现，2014/04 -2018/04，200/2857万，在研，子课题负责人。
8.?? ?广东省自然科学基金，2014A，人类蛋白质SUMO化调控机制研究，2015/01-2018/01，10万，结题，主持。
9.?? ?教育部重大科技基础培育计划，基于“天河二号”超级计算机的肿瘤多组学数据分析平台构建，2016/05-2017/05，40万，已结题，主持。
10.?? ?中央高校基础科研业务费，14lgjc14，中山大学重大培育计划项目，2014/07-2017/06，24万，已结题，主持。
11.?? ?教育部新世纪优秀人才，NCET-13-0610，2014/01-2016/12，50万，已结题，主持。
12.?? ?广东省自然科学****基金（省****，首批16人），S，蛋白质翻译后修饰相关算法及工具设计，2012/10-2016/10，100万，已结题，主持。
13.?? ?科技部重大研究计划，2012CB911200，端粒相关蛋白对人类重大疾病作用机制的研究，2012/01 -2016/08，100/2600万，已结题，学术骨干。
14.?? ?科技部863计划，2012AA01A301，“天河”新一代高性能计算机系统研制，2012/01-2015/12，80万/6亿，已结题，学术骨干。
15.?? ?广州市珠江科技新星（市人才计划，首批），2011J**，蛋白质翻译后修饰计算分析平台构建，2011/11-2014/10，30万，已结题，主持。
16.?? ?国家自然科学基金面上项目，**，蛋白质翻译后修饰受可变剪切影响的系统生物学研究，2011/01-2013/12，40万，已结题，主持。
17.?? ?中央高校基础科研业务费，11lgzd11，中山大学青年教师重点培养，2011/01-2012/12，30万，已结题，主持。
18.?? ?国家自然科学基金青年基金，**，蛋白质共价修饰相关序列模体的计算发现，2010/01-2012/12，20万，已结题，主持。
19.?? ?科技部重大研究计划，2006CB933300，纳米药物载体增强药物导向性及效应的研究，2006/07-2010/08，30/1500万，已结题，学术骨干。

论文专著
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Liu WZ, Xie YB, Ma JY, Luo XT, Nie P, Zuo ZX, Lahrmann U, Zhao Q, Zheng YY, Zhao Y, Xue Y*?and Ren J*.?IBS: an illustrator for the presentation and visualization of biological sequences.?Bioinformatics. 2015;?31(20):3359-3361(数学与计算生物学1区，IF:?4.531, cited by 266，ESI?Hot?Paper)
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Zuo ZX, Hu HJ, Xu QX, Luo XT, Peng D, Zhu KY, Zhao Q*, Xie YB*, Ren J*. BBCancer: an expression atlas of blood-based biomarkers in the early diagnosis of cancers. Nucleic Acids Research.?2020;48(D1):D789-796(生物1区，IF:?11.147)
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