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华南理工大学生物科学与工程学院研究生导师介绍王俊

华南理工大学 免费考研网/2012-10-27

导师姓名:王俊
性别:
职称:教授
招生专业:微生物学
招生层次:招收博士研究生
招生专业所属院系:生物科学与工程学院
研究方向:基因组学
联系电话:
电子邮件:wangj@genomics.org.cn
备注:华大基因联合培养
导师简介:
王俊教授,现任中科院北京基因组研究所暨华大基因研究中心北京中心主管、生物信息学实验室主管;丹麦奥胡斯大学人类遗传学研究所及南丹麦大学人类遗传学生化及分子生物学系客座教授;北京大学生命科学学院客座教授。

1999年,王俊教授在人类基因组计划中承担了中国部分的数据分析工作。随后于2001年,在中国籼稻基因组计划中负责生物信息学分析部分。其中研究领域涉及到基因组组装、注释、表达、复制、比较基因组学、分子进化、转录调控、多态性等多个领域;发展了多个包括组装、比对、注释在内的软件算法,建立了多个数据库。

王俊教授同时还致力于脊椎动物中的基因注释问题和非编码基因问题。在2003-2004年还参与了SARS基因组分析,组织实施了家蚕、家猪基因组计划与家鸡多态性图谱计划。

上述科研项目的成果发表在“Nature”,“Science”,“NatureReviewGenetics”,“GenomeResearch”,“NucleicAcidsResearch”等。其中以王俊为第一作者或通讯作者发表的“Nature”、“Science”这一级别文章为六篇。

王俊同时在平台搭建和大项目组织上积累了大量经验。1999年-2000年,完成了华大基因的基本生物信息学平台的搭建过程,2001年初,到杭州组建了华大基因杭州中心。组织并实施了诸如家蚕、家鸡、家猪、水稻基因组等大型计划。

介于此,王俊获得了多个奖项,诸如:“中国科学院杰出科技成就奖”、“新世纪百千万人才工程国家级人选”、“中央国家机关优秀青年”、“香港求是科技基金求是杰出科技成就奖”、“中国十大科技进展”等。

教育背景:
2002生物信息博士,北京大学
1997生物学士,北京大学

任职情况
1999.3–至今生物信息室主任,北京华大基因研究中心暨中国科学院北京基因组研究所
2001杭州华大基因研究中心主任
2003.2–至今研究员,北京中心主任,北京华大基因研究中心暨中国科学院北京基因组研究所
2004.8-2006.8客座教授,丹麦奥胡斯大学人类遗传学研究所/南丹麦大学人类遗传学生化及分子生物学系
2004.10-至今客座教授,北京大学生命科学学院
2006.9-至今OleRømer教授,丹麦奥胡斯大学人类遗传学研究所/南丹麦大学人类遗传学生化及分子生物学系
2007.6-至今深圳华大基因研究院副院长

获奖情况:
2008“五一劳动奖章”
2008“享受国务院专家特殊津贴,享受深圳市专家特殊津贴”
2007“AwardforScienceandSino-DanishCollaboration”
2006新世纪百千万人才工程国家级人选
2006TheDanishResearchCouncil:YoungEliteScientist
2005TheLundbeckFoundation:TalentPrice
2004 中国科学院研究生院优秀教师和优秀课程
2003 中国科学院杰出科技成就奖
2003“中央国家机关优秀青年”称号
2003 中国十大科技进展和世界十大科技进展-SARS科技攻关项目
2002香港求是科技基金求是杰出科技成就集体奖
2003北京大学东盛科学论文奖
2002北京大学学术十杰
2002复旦大学谈家桢基金生命科学九源奖学金一等奖
2002中国科学院重大创新贡献奖
2002教育部全国优秀博士论文
2002 中国十大科技进展新闻奖-水稻基因组精细图和水稻第四号染色体精确测序图
2001 中国基础科学研究十大新闻-水稻基因组工作框架图
2001 中国基础科学研究十大新闻-人类基因组计划“中国卷”

已发表论文情况:
*第一作者‡通讯作者
Wang,……YangH,WangJ.ThediploidgenomesequenceofanAsianindividual.Nature456:60-65,2008.
L.Fang,…J.Wang‡,etal.2007.Positivecorrelationbetweenrecombinationrateandnucleotidediversityisshownunderdomesticationselectioninthechickengenome.CHINESESCIBULL
J.Ruan,…J.Wang‡,etal.2007.TreeFam:2008update.NucleicAcidsRes36:D735-D740
H.Jiang,…J.Wang‡,etal.2007.Rapidevolutioninapairofrecentduplicatesegmentsofrice.MolecularandDevelopmentalEvolution308B(1):50-57
R.Li,…J.Wang,etal.2007.SOAP:shortoligonucleotidealignmentprogram.Bioinformatics
A.Clark,...J.Wang,etal.2007.EvolutionofgenesandgenomesontheDrosophilaphylogeny.Nature450:203-18
H.Li,...J.Wang‡,etal.2007.Across-speciesalignmenttool(CAT).BMCBioinformatics8:349
H.Zheng,…J.Wang‡.2007.FGF:awebtoolforFishingGeneFamilyinawholegenomedatabase.NucleicAcidsRes35:W121-5
D.Edwards,...J.Wang,etal.2007.PlantBioinformatics–MethodsandProtocols.HumanaPress
G.Zhang,…J.Wang‡,etal.2007.Identificationandcharacterizationofinsect-specificproteinsbygenomedataanalysis.BMCGenomics8:93
J.Gorodkin,...J.Wang,etal.2007.Porcinetranscriptomeanalysisbasedon97non-normalizedcDNAlibrariesandassemblyof1,021,891ESTs.GenomeBiology8:R45.
C.Chen,...J.Wang,etal.2007.AGlimpseofStreptococcalToxicShockSyndromefromComparativeGenomicsofS.suis2ChineseIsolates.PLoSONE.2:e315.
S.Li,...J.Wang‡.2007.Snap:anintegratedSNPannotationplatform.NucleicAcidsRes.35:D707-10
J.Ruan,...J.Wang‡.2007.PigGIS:PigGenomicInformaticsSystem.NucleicAcidsRes.35:D654-7
Y.Zhang,...J.Wang,M.Mann.2007.MAPU:Max-PlanckUnifieddatabaseoforganellar,cellular,tissueandbodyfluidproteomes.NucleicAcidsRes.35:D771-9
X.Qi,...J.Wang‡,B.Su.2007.Detectingpositivedarwinianselectioninbrain-expressedgenesduringhumanevolution.ChineseScienceBulletin.52:324-335
X.Yu,…J.Wang,etal.2006.Detectinglineage-specificadaptiveevolutionofbrain-expressedgenesinhumanusingrhesusmacaqueasoutgroup.Genomics.88:745-751
W.Wang,…J.Wang‡.2006.HighRateofChimericGeneOriginationbyRetropositioninPlantGenomes.PlantCell.18:1791-802.
X.Wang,…J.Wang,R.Yang.2006.GenomiccomparisonofYersiniapestisandYersiniapseudotuberculosisbycombinationofsuppressionsubtractivehybridizationandDNAmicroarray.ArchMicrobiol.186:151-9.
J.Ye,…J.Wang‡.2006.WEGO:awebtoolforplottingGOannotations.NucleicAcidsRes.34:W293-7.
Z.Peng,J.Wang,S.He.2006.ThecompletemitochondrialgenomeofthehelmetcatfishCranoglanisbouderius(Siluriformes:Cranoglanididae)andthephylogenyofotophysanfishes.Gene.376:290-7.
D.Muzny,…J.Wang,etal.2006.TheDNAsequence,annotationandanalysisofhumanchromosome3.Nature.440:1194-8.
H.Li,…J.Wang‡,R.Durbin.2006.TreeFam:acurateddatabaseofphylogenetictreesofanimalgenefamilies.NucleicAcidsRes.34:D572-80.
L.Li,…J.Wang,X.Deng.2006.Genomewidetranscriptionanalysesinriceusingtilingmicroarrays.NatureGenetics.38:124-129.
Z.Peng,…J.Wang,…R.Diogo.2006.MitochondrialmolecularclocksandtheoriginofthemajorOtocephalanclades(Pisces:Teleostei):Anewinsight.Gene370:113-24
R.Li,…J.Wang‡.2005.Recoveryofancestralsequencesfortransposableelementsfromtheunassembledreadsofawholegenomeshotgun.PLoSComputBiol1:e43.
W.Wang,…J.Wang‡.2005.Rapidevolutionofnewlyevolvedexons.GenomeRes.15:1258-1264.
L.Ma,…J.Wang,etal.2005.AmicroarrayanalysisofthericetranscriptomeanditscomparisontoArabidopsis.GenomeRes.15:1274-1283.
V.Stolc,…J.Wang,X.Deng.2005.Apilotstudyoftranscriptionunitanalysisinriceusingoligonucleotidetiling-pathmicroarray.PlantMolecularBiology59:137-149.
L.Li,…J.Wang,etal.2005.Tilingmicroarrayanalysisofricechromosome10toidentifythetranscriptomeandrelateitsexpressiontochromosomalarchitecture.GenomeBiology6:R52.
S.Lee,...J.Wang,etal.2005.Detectingnovellow-abundanttranscriptsinDrosophila.RNA.11:939-46.
R.Wernersson,…J.Wang,etal.2005.Pigsinsequencespace:A0.66Xcoveragepiggenomesurveybasedonshotgunsequencing.BMCGenomics6:70.
Y.Wang,…J.Wang,etal.2005.Acceleratedevolutionofthepituitaryadenylatecyclase-activatingpolypeptideprecursorgeneduringhumanorigin.Genetics170:801-806.
Z.Tong,…J.Wang,etal.2005.PseudogeneaccumulationmightpromotetheadaptivemicroevolutionofYersiniapestis.JMedMicrobiol.54:259-268.
J.Yu,J.Wang*,etal.2005.ThegenomesofOryzasativa:Ahistoryofduplications.[CoverStory].PLoSBiology3:e38.
S.Xu,...J.Wang,etal.2005.AmitochondrialgenomesequenceoftheTibetanantelope(Pantholopshodgsonii).Genomics,Proteomics&Bioinformatics3:5-17.
J.Wang,…J.Wang‡.2005.ChickVD:asequencevariationdatabaseinthechickengenome.NucleicAcidsRes.33:D438-D441.
J.Wang,…J.Wang,etal.2005.SilkDB:aknowledgebaseforsilkwormbiologyandgenomics.NucleicAcidsRes.33:D399-D402.
L.Kang,…J.Wang,etal.2004.Theanalysisoflarge-scalegeneexpressioncorrelatedtothephasechangesofthemigratorylocust.Proc.Natl.Acad.Sci.USA101:17611-17615.
Q.Xia,…J.Wang*,etal.2004.Adraftsequenceforthegenomeofthedomesticatedsilkworm(Bombyxmori).Science306:1937-1940.
G.K.Wong,B.Liu,J.Wang*,etal.2004.Ageneticvariationmapforchickenwith2.8millionsingle-nucleotidepolymorphisms.Nature432:717-722.
J.Wang,asoneoftheauthorsintheInternationalChickenGenomeSequencingConsortium.2004.Sequenceandcomparativeanalysisofthechickengenomeprovideuniqueperspectivesonvertebrateevolution.Nature432:695-716.
J.Wang,asoneoftheauthorsintheInternationalHumanGenomeSequencingConsortium.2004.Finishingtheeuchromaticsequenceofthehumangenome.Nature431:946-957.
J.Wang,etal.2004.Neutralevolutionof“non-coding”cDNAsfromthemousetranscriptome.Nature431:1pfollowing757;discussionfollowing757.
Z.Li,...J.Wang,etal.2004.Detailedcomparisonbetweenthewheatchromosomegroup7shortarmsandthericechromosomearms6Sand8Lwithspecialreferencetogenesinvolvedinstarchbiosynthesis.FunctIntegrGenomics.4:231-40.
Y.Song,…J.Wang,etal.2004.CompletegenomesequenceofYersiniapestisstrain91001,anisolateavirulenttohumans.DNAResearch11,179-197.
C.Li,…J.Wang,etal.2004.Genescontrollingseeddormancyandpre-harvestsproutinginarice-wheat-barleycomparison,FunctIntegrGenomics.4:84-93.
J.Tang,…J.Wang,etal.2004.Acomparisonofricechloroplastgenomes.PlantPhysiol135:412-20.
A.Tian,J.Wang*,etal.2004.Characterizationofsoybeangenomicfeaturesbyanalysisofitsexpressedsequencetags.TheorApplGenet.108:903-13.
W.Zhao,…J.Wang‡.2004.BGI-RIS:anintegratedinformationresourceandcomparativeanalysisworkbenchforricegenomics.NucleicAcidsRes.32:D377-D382.
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参考
HuanmingYang.DirectoroftheBeijingInstituteofGenomics,ChineseAcademyofSciences.Beijing101300,China.Tel:(8610)80494969.E-mail:yhm@genomics.org.cn.
GaneKa-ShuWong.SeniorScientist.UniversityofWashington.DepartmentsofGenomeSciences.Seattle,WA98195.Tel:(206)685-7348.E-mail:gksw@u.washington.edu.
LarsBolund.Professor.InstituteofHumanGenetics,UniversityofAarhus.DK-8000AarhusC,Denmark.Tel:+4589421675.E-mail:bolund@humgen.au.dk.
KarstenKristiansen.Professor.DepartmentofBiochemistryandMolecularBiology,UniversityofSouthernDenmark,Denmark.Tel:+4565502408.E-mail:kak@bmb.sdu.dk.
SonggangLi.Professor.CollegeofLifeSciences,PekingUniversity,Beijing,China.Tel:(8610)80481191.E-mail:lsg@pku.edu.cn.

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