所系名称
中国科学院南海海洋研究所，中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室
性别
男
专业名称
海洋生物学
技术职务
研究员
行政职务

Mail地址
chzelin0@163.com
指导博士生总数
0
指导硕士生总数
0
通讯地址
广州市新港西路164号
目前博士生数
0
目前硕士生数
0
邮政编码
510301
研究方向
生物信息学与基因组学、海洋生物的适应性进化。

研究工作
主要从事高通量测序数据分析方法、进化基因组学、多组学数据联合分析方法的相关研究。已发表论文15篇，SCI收录15篇，第一作者SCI论文4篇，其中包括Science Advances、Genome Research、ISME Journal各1篇。代表性工作有：开发了杂合二倍体基因组融合软件HaploMerger，并应用于完成首个中国文昌鱼的基因组草图，成果发表于Genome Research、Nature Communications杂志上；利用第三代测序技术完成了金鱼的首个参考基因组，并用比较基因组学研究全基因组复制后金鱼基因组和转录组的进化模式，该成果发表于Science Advances杂志上；通过对深海热液口和其他海洋环境的微生物宏基因组的比较分析，揭示了微生物如何通过基因的水平转移获得更高的遗传多样性，从而适应热液口的高温酸性环境，成果发表于ISME杂志上；结合RNA-seq和ATAC-seq技术，参与研究斑马鱼内耳再生过程中的转录和基因调控的机制。
获奖情况

指导研究生情况

个人简介
学习经历
2003.9-2007.7，中国，中山大学数学与计算机学院，科学计算与计算机应用，理学学士
2007.9-2012.7，中国，中山大学生命科学学院，生物化学与分子生物学专业（生物信息），理学博士
工作经历
2012.10-2015.10，中国，北京大学深圳研究生院，博士后
2014.04-2015.10，美国，美国加洲大学洛杉矶分校（UCLA），博士后
2015.10-2020.10，美国，美国国立卫生研究院人类基因组研究所，博士后


科研成果
代表论著：
1.Zelin Chen^#, Yoshihiro Omori^#, et al., Tyra G. Wolfsberg, Koichi Kawakami, Adam M. Phillippy, NISC Comparative Sequencing Program, James C. Mullikin, Shawn M. Burgess*. De Novo assembly of the goldfish (Carassius auratus) genome and the evolution of genes after whole genome duplication. Science Advance, 2019, 5(6): eaav0547, 5. （IF=12.157）
2.Shengfeng Huang^#, Zelin Chen^#, Guangrui Huang, Ting Yu, Pingyang, Jie Li, Yonggui Fu, Shaochun Yuan, Shangwu Chen and Anlong Xu*. HaploMerger: reconstructing allelic relationships for polymorphic diploid genome assemblies，Genome Research，2012, 22(8): 1581, 71. （IF=10.650）
3.Wei Xie^#, Fengping Wang^#, Lei Guo^#, Zeling Chen^#, Stefan M Sievert, Jun Meng, Guangrui Huang, Yuxin Li, Qingyu Yan, Shan Wu, Xin Wang, Shangwu Chen, Guangyuan He, Xiang Xiao and Anlong Xu. Comparative metagenomics of microbial communities inhabiting deep-sea hydrothermalvent chimneys with contrasting chemistries. ISME Journal, 2011, 5: 414-426, 104. （IF=9.559）
4.Zelin Chen^#, Shengfeng Huang^#, Yuxin Li, Anlong Xu*. AliquotG: An Improved Heuristic Algorithm for Genome Aliquoting. PLoS One, 2013, 8: e64279, 1. （IF=2.783）
5.ShenFeng Huang, Zelin Chen, Xinyu Yan, et al. and Anlong Xu*. Decelerated genome evolution in modern vertebrates revealed by analysis of multiple lancelet genomes. Nat Commun, 2014, 5: 1-12, 77. （IF=12.118）