目前，我校共有国家二级学科重点学科5个，国家二级学科重点（培育）学科1个，农业部重点学科5个，广东省一级学科重点学科3个（覆盖12个二级学科，含自主设置二级学科），广东省二级学科重点学科7个（不含一级学科重点学科下的二级学科），国家林业局重点学科1个。
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　　　　国家二级学科重点学科5个：

　　　　　作物遗传育种、农业昆虫与害虫防治、农业经济管理、果树学、预防兽医学

　　　　国家二级学科重点（培育）学科1个：

　　　　农业机械化工程

　　　　广东省一级学科重点学科3个：

　　　　园艺学、植物保护、兽医学共覆盖了果树学、蔬菜学、茶学、园艺产品采后科学*、观赏园艺学*、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、兽医药学*等12个二级学科，包括自主设置二级学科。（*为自主设置二级学科）

　　　　广东省二级学科重点学科（不含一级学科重点学科下的二级学科）7个：

　　　　作物遗传育种、农业经济管理、生物化学与分子生物学、生态学、农业机械化工程、植物营养学、动物营养与饲料科学

　　　　国家林业局重点学科：

　　　　植物学