学校悠久的办学历史可追溯至始创于1909年的广东全省农事试验场暨附设农业讲习所。1952年，在全国高校院系调整时，由原中山大学农学院、岭南大学农学院和广西大学农学院畜牧兽医系及病虫害系的一部分合并成立华南农学院，隶属农业部主管。毛泽东主席亲笔题写了校名。1984年，更名为华南农业大学。在2000年国家深化高校体制改革的战略性调整中，学校由农业部划归广东省主管。学校2002年通过了“九五”“211工程”建设项目整体验收，2004年2月通过了“十五”“211工程”建设项目论证。现任党委书记为江惠生同志，校长为骆世明教授。
在90多年的发展过程中，学校办学规模不断扩大，现己建设成为以农业科学为优势，以生命科学为特色，农、工、文、理、经、管、法多学科全面发展，具有鲜明的热带、亚热带区域特点，具备研究生、本专科、成人、职业技术教育多层次人才培养体系的综合性农业大学。目前，共设有农学院、资源环境学院、生命科学学院、经济管理学院（乡镇企业管理学院）、工程学院、动物科学学院、兽医学院、园艺学院、食品学院、林学院、人文科学学院、理学院、信息学院、软件学院、艺术学院、外国语学院、继续教育学院（高等职业技术教育学院）、珠江学院等18个学院。现有在校学生16681人。其中，博士、硕士研究生2090人；本专科生14591人；外国留学生47人。
学校学科门类齐全，现有专业己覆盖了一级学科中除医学以外的全部学科门类，并拥有作物学、植物保护、兽医学、农业工程、园艺学、农业资源利用、农林经济管理等7个博士／硕士授权一级学科；有35个博士学位授权学科专业，60个硕士学位授权学科专业，60个本科专业。有3个国家重点学科，5个农业部重点学科，9个广东省重点学科。
学校办学条件良好，教学科研设施齐全。现有校舍建筑面积48万平方米。图书馆面积1万平方米，藏书134万多册，其中珍藏中国古农书5万多册，己建成计算机管理集成系统。接入中国教育和科研计算机网的校园网遍及学校各个主要区域。校园内外的教学科研基地占地共计349公顷。建有生物学国家理科基础科学研究和教学人才培养基地、大学生文化素质教育基地2个国家级基地和1个广东省人文社会科学重点研究基地。有农业机械化等教学实验工厂5个。有各类教学实验室46个。
学校始终坚持教学与科研并重的原则。近年来不断加大实验室建设力度，大力提倡跨学科的学术交流与合作。现有生物学、园艺学、植物保护、作物学、农业工程、畜牧学、兽医学、农林经济管理8个博士后科研流动站；农药化学生物学1个教育部重点实验室；昆虫学、养禽与禽病防治2个农业部重点开放性实验室；兽药研制与安全评价、果蔬保鲜、植物分子育种3个广东省重点实验室，以及1个广东省教学型重点实验室-“现代生物技术重点实验室”。有各类研究中心、研究所、研究室共计81个。农业部植物新品种测试中心（广州）、农业部畜禽产品质量监督检验测试中心（广州）、广东省木材及木材制品产品质量监督检验中心均设在我校。
在长期的办学实践中，学校培养和造就了一大批实力雄厚的师资和科研力量。学校现有教职工2160人，其中中科院院士1人；国务院学位委员会学科评议组成员4人：“****奖励计划”特聘教授1人；教育部跨世纪优秀人才3人；国家杰出青年基金获得者3人；教授及相当职称人员159人；副教授及相当职称人员404人；博士生导师116人；硕士生导师347人；政府特殊津贴获得者215人。
学校充分发挥地处热带亚热带的地缘优势和毗邻港澳的特点，广泛开展对外交流活动。先后与欧、美、亚、大洋洲13个国家的23所大学建立了校际联系，与港、澳、台地区的学术交流也日益增多。在开展国际多边技术交流中，得到我国政府和国际组织的重视和支持。由联合国开发计划署、粮农组织等国际组织与和我国于20世纪80年代在学校联合建立的亚太地区蚕桑培训中心和中国国际农业培训中心，已为40多个国家培训了500多名农业管理官员和专业技术人才。培训质量得到有关国家和国际组织的高度评价。
学校“十五”期间的办学定位是：适应中华民族的振兴和广东率先基本实现社会主义现代化的需要，立足广东、依托华南、面向全国、开放办学，把学校建成为具有鲜明热带、亚热带区域特点、以农业科技为优势、以生命科学为特色，农、工、文、理、经、管法多学科全面发展，本科与研究生教育并重，教学科研并重的高水平综合性大学。
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