副研究员　性别: 男
所属单位：遗传学系


Email：xiexianrong@scau.edu.cn




个人简介
1988年生。2015 年毕业于华南农业大学获理学博士学位。从事水稻育性基因的克隆与功能研究，以及生物信息学分析与软件开发。开发了用于基因编辑解码分析的DSDecode 软件以及一站式基因编辑软件包CRISPR-GE（http://skl.scau.edu.cn/）。

工作经历
2016-2018，华南农业大学，作物学，博士后。

主要研究领域
1. 水稻育性基因的克隆和功能研究；2. 生物信息学分析和工具开发。


主持的科研课题
1. 国家自然科学基金（2018，在研）
2. 中国博士后科学基金（2016，结题）
3. 广东省自然科学基金（2018，结题）


发表论文
1.Xie X^#, Zhang Z^#, Zhao Z, Xie Y, Li H, Ma X, Liu Y-G, Chen L*. The mitochondrial aldehyde dehydrogenase OsALDH2b negatively regulates tapetum degeneration in rice. Journal of Experimental Botany, 2020, doi:10.1093/jxb/eraa045.
2.Xie X, Ma X, Liu Y-G*. Decoding Sanger Sequencing Chromatograms from CRISPR-Induced Mutations. In: Qi Y. (eds) Plant Genome Editing with CRISPR Systems. Methods in Molecular Biology, 2019, vol 1917. Humana Press, New York, NY
3.Xie Y^#, Tang J^#, Xie X, Li X, Huang J, Fei Y, Han J, Chen S, Tang H, Zhao X, Tao D, Xu P, Liu Y-G, Chen L*. An asymmetric allelic interaction drives allele transmission bias in interspecific rice hybrids. Nature Communications, 2019, 10: 2501.
4.Xie X, Ma X, Zhu Q, Zeng D, Li G, Liu Y-G*. CRISPR-GE: A Convenient Software Toolkit for CRISPR-Based Genome Editing. Molecular Plant, 2017, 10 (9): 1246–1249.
5.Tang H, Zheng X, Li C, Xie X, Chen Y, Chen L, Zhao X, Zheng H, Zhou J, Ye S, Guo J*, Liu YG*. Multi-step formation, evolution, and functionalization of new cytoplasmic male sterility genes in the plant mitochondrial genomes. Cell Research,2017, 27 (1): 130-146.
6.Zhang Y, Ma X, Xie X, Liu Y-G*. CRISPR/Cas9-Based Genome Editing in Plants. Progress in Molecular Biology and Translational Science, 2017, 149: 133-150
7.Shen R, Wang L, Liu X, Wu J, Jin W, Zhao X, Xie X, Zhu Q, Tang H, Li Q, Chen L, Liu Y-G*. Genomic structural variation-mediated allelic suppression causes hybrid male sterility in rice. Nature Communications, 2017, 8:1310.
8.Xie Y, Xu P, Huang J, Ma S, Xie X, Tao D, Chen L*, Liu Y-G*. Interspecific hybrid sterility in rice is mediated by trypsin-like peptidase/ribosome biogenesis regulatory domain protein 1. Molecular Plant, 2017, 10 (8): 1137–1140.
9.Zhu Q, Yu S, Zeng D, Liu H, Wang H, Yang Z, Xie X, Shen R, Tan J, Li H, Zhao X, Zhang Q, Chen Y, Guo J, Chen L, Liu Y-G*. Development of “purple endosperm rice” by engineering anthocyanin biosynthesis in the endosperm with a high-efficiency. Molecular Plant, 2017, 10 (7): 918-929.
10.Liu W^#, Xie X^#, Ma X, Li J, Chen J, and Liu Y-G*. 2015. DSDecode: A Web-based Tool for Decoding of Sequencing Chromatograms for Genotyping of Targeted Mutations. Molelcular Plant, 2015, 8 (9): 1431-1433.
11.Zhu Q, Xie X, Lin H, Sui S, Shen R, Yang Z, Lu K, Li M*, Liu Y-G*. Isolation and Functional Characterization of a Phenylalanine Ammonia-Lyase Gene (SsPAL1) from Coleus (Solenostemon scutellarioides (L.) Codd). Molecules, 2015, 20 (9): 16833-16851.
12.Zhu Q*, Xie X, Zhang J, Xiang G, Li Y, Wu H. In Silico Analysis of a MRP transporter gene reveals its possible role in anthocyanins or flavonoids transport in Oryze sativa. American Journal of Plant Sciences, 2013, 4 (3): 555-560.
13.祝钦泷*, 谢先荣, 眭顺照, 李名扬*. 彩叶草Rubisco活化酶基因SsRCA的分子特征及其表达模式. 西北植物学报, 2011, 31 (6): 1097- 1104

荣誉和奖励
2017年，高效的植物基因组编辑载体系统和软件工具包及其应用，第十届大北农科技奖基因工程奖（独享），排名第三。
2017年，第十八届全国植物基因组学大会墙报展一等奖。

发明专利
2016年，Degenerate Sequence Decode简并序列解码软件 [简称：DSDecode软件] V1.0，软件著作权登记号：2016SR300487

参加学术会议
第19届国际植物学大会，2017.7.23-29，深圳
第十八届全国植物基因组学大会，2017.8.19-22，兰州
2017植物基因组与基因编辑学术研讨会，2017.11.10-11，上海
AICC2018人工智能计算大会，2018.9.12，北京