广州中医药大学第二临床医学院（原医疗二系）成立于1986年，与广州中医药大学第二附属医院（广东省中医院）实行院系合一的管理体制。现有学生1759人，其中博士生56人、硕士生181人、七年制学生378人、本科生1105人、大专生39人。
　　
　　第二临床医学院共有教职工2300多人。教师队伍结构合理，技术力量雄厚，现有正高职称专业技术人员61人，副高职称专业技术人员179人，中级职称专业技术人员430人，其中省名中医15人、学校首席教授3人。每年承担48门临床课程5000多学时的课堂教学任务。近年来负责省部级教学研究课题10多项，获得省级教学成果1项，校级教学成果2项。
　　
　　第二临床医学院学生后期临床教学以第二附属医院（广东省中医院）为中心，建立了26间具有较高教、医、研水平的临床实习教学基地，其中教学医院14间：广州市中医医院、广东省第二中医院、广州军区广州总医院、海南省中医院、江门市五邑中医院、江门市新会区中医院、东莞市中医院、佛山市南海区中医院、韶关市中医院、阳江市中医院、潮阳市中医院、汕头市中医院、惠州市中医院、佛山市南海妇幼保健院；实习医院11间，广州市番禺区中医院、广州市天河区中医院、增城市中医院、潮州市中医院、连州市中医院、惠来县慈云中医院、曲江县中医院、惠东县中医院、深圳市福田区中医院、新兴县中医院、海南省海口市中医院。
　　
　　目前，第二临床医学院在教学管理、教学研究、学生教育管理等方面不断拓展、锐意进取，依托第二附属医院（广东省中医院）的快速协调发展，正以其教学资源的规模、质量和管理优势，进一步深化教学改革，加强内涵建设，推进素质教育，为培养适应社会需要的高素质的中医后继人才，把学院建成全国一流的临床医学院而努力。