水产学院的办学历史可追溯到创办于 1935 年的广东省立高级水产职业学校，原校址在汕头市。抗日战争爆发后辗转迁徙，1945 年9月抗战胜利后迁至汕尾，改名为广东省立汕尾高级水产职业学校。解放后的 1950 年 4 月，改名为“广东省高级水产技术学校”。 1953 年 7 月，广东海口高级农校水产科及广西钦州农校水产科并入，改名为广东省水产学校。1955 年初，学校从汕尾迁往江门北街原粤中区党委旧址。 1959 年春，因地市调整需要，学校迁往唐家湾（现属珠海市）。 1960 年 6 月，经教育部和广东省人民政府批准，暨南大学水产系和广东水产学校合并成立广东省水产专科学校。 1962 年夏，遵照广东省人民政府指示，学校从唐家湾迁往湛江市霞山区海头岭。华南工学院湛江分院撤消后并入广东水产专科学校。 1963 年改由中央水产部领导，易名为湛江水产专科学校。 1979 年 9 月 13 日 ，国务院批准湛江水产专科学校升格为学院，由国家水产总局和广东省双重领导，以国家水产总局为主，面向中南、西南兼顾全国招生。 1981 年 1 月，国务院学位委员会批准湛江水产学院为首批授予学士学位的院校。 1997 年 1 月，湛江水产学院与湛江农业专科学校实行实质性合并，成立湛江海洋大学， 2005 年 5 月，经国家教育部批准，学校更名为广东海洋大学，水产学院是学校的第一批二级学院之一。

　　简纪常教授为现任院长，苏永华同志为党委书记。学院下设水产养殖系、海洋渔业系、海洋生物系、环境科学系、海洋生物研究所、珍珠研究所等教学和科研单位。广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室为省级重点实验室，水产经济动物病害控制实验室是省教育厅重点实验室。学院现有水产养殖、渔业资源、海洋生物等3个硕士学位授予专业和1个农业推广硕士专业（渔业领域）以及水产养殖学、海洋渔业科学与技术、海洋科学、生物工程、海洋技术和大气科学等6个本科专业，其中水产养殖学为省级重点学科，水产养殖专业是广东省高校本科名牌专业。目前，在校硕士研究生 141 人，农业推广硕士 51 人，博士研究生 5 人，现有在校本科生 1055 人（其中越南留学生8人）。

　　学院现有教职工94 人，其中专任教师 67 人，教授 16人，副教授（副研究员、高工） 35 人， 其中博士生导师 7 人，硕士生导师 50人，博士学位 34 人，硕士学位 49 人。省 “ 千、百、十 ” 工程省级培养对象 2 人，校级培养对象 4 人，校级重点培养教师 5 人。吴灶和教授为中科院南海海洋研究所海洋生物专业博士生导师，刘楚吾教授为湖南师范大学发育生物学专业博士生导师,简纪常教授为汕头大学海洋生物专业博士生导师,谭北平教授为中国海洋大学水产养殖专业博士生导师，杜晓东、李广丽、余祥勇为上海海洋大学水产养殖专业博士生导师。学院还聘请刘建康、沈韫芬、刘瑞玉、林浩然、张福绥、赵法箴等6位院士及日本东京水产大学须山三千三教授为名誉教授，聘请美国南佛罗里达州水资源管理局高级环境科学研究员古滨河、美国威斯康星大学医学院助理教授郑晶、美国 Nanogen Inc. 高级研究员姚祖旭、美国阿拉斯加洲渔猎部高级生物统计学家郑杰等 4 位美籍专家为客座教授，聘请“****”麦康森博士为兼职教授。水产养殖系已故著名科学家熊大仁教授是我国珍珠养殖的奠基人之一。

　　学院坚持以教学科研为中心，教育、教学改革研究取得重要进展。“水产养殖本科人才培养方案及教学内容、课程体系改革的研究与实践” 教学研究项目获广东省教学成果一等奖，“海产经济动物增养殖学课程建设与改革” 获广东省教学成果二等奖，“水产养殖专业实验实习教学创新体系的建立与实践” 获省教育厅教学成果二等奖。《海产经济动物增养殖学》、《淡水经济动物增养殖学》、《鱼病学》等 3 门课 程是省级重点课程。 学院始终坚持走产、学、研相结合的道路，建有一批教学、科研、生产三结合的实习基地。并积极为地方经济服务，鱼虾贝藻增养殖、网箱养殖、水产经济动物病害防治、珍珠养殖技术等一大批科技成果得到推广应用，取得了巨大的经济效益和社会效益。高位池养虾技术、南方几种海水名贵鱼类的种苗生产及养殖技术、沉箱养鲍技术为国内首创。2003 — 2006 年的科研经费 1600 万余元，获得资助项目的级别得到了显著的提高，项目涵盖了国家自然基金、国家 863 计划项目、教育部重点项目，省自然基金及地方政府各级科技计划项目大幅度增加，并积极加强与企业合作。近 5 年来，获得省、市级科技进步奖 22 项 、 发明专利 3 项，在各类专业刊物上发表了较高水平、学术影响较大的科研学术论文 300 多篇，其中被三大索引收录的 14 篇，出版学术专著 20 部，教材 9 部。

　　学院十分注重科技合作和学术交流，先后同东京水产大学、台湾海洋大学、中国海洋大学等院校建立了学术交流与合作关系，与中水远洋渔业责任有限公司签订了协议，每年外派海洋渔业科学与技术专业毕业生出国工作，与新加坡 Swee Chion Aquaculture Holding Pte. Ltd 公司也签订了协议，从 2005 年始，水产养殖专业外派学生到新加坡实习。