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南方医科大学研究生导师简介-潘星华

本站小编 Free考研网/2019-05-04

基本信息 姓名:潘星华(PAN XING HUA )
 技术职称:教授、博士生导师
 工作单位:基础医学院生化教研室
 导师类型:学术型博导
 研究方向与专业:单细胞组学技术的创新研发与应用/
 联系方式:panvictor@qq.com
 学术任职:生物化学和分子生物学教研室主任,广东省单细胞技术与应用重点实验室主任,中国侨联特聘专家生物医药专业委员会委员,广东省生物化学与分子生物学学会副理事长,美国耶鲁大学医学院遗传系研究顾问、Precision Clinical Med (牛津大学出版社)杂志副主编
从事的主要研究方向及其特点和意义、开展新医疗、新技术等情况、国内所处的学术地位  单细胞组学技术创新及其在基础理论和临床实践应用研究1.单细胞分析核心技术的下一代创新,特别重视单细胞表观组分析技术、多组学技术及高通量实用技术研发,并开展多领域的基础和应用研究。目前已经有Fluidigm C1、10X genomics、ddSEQ等平台。2.在单细胞水平上研究人类胚胎早期发育不同阶段的细胞组成、多组学特征、时空定位及发育轨迹、分子调控等,与国际上的人体细胞地图计划(Human Cell Atlas)相接轨,目的是在单细胞水平及组学水平研究正常及重大疾病相关的组织器官发育时空调控机制;3.基于单细胞技术的干细胞休眠和癌症分子机制及精准防治研究,重点聚焦于干细胞休眠及其调控,干细胞在癌症发生、发展及治疗抵抗中的作用和机制,癌症的个体内细胞异质性和细胞进化和分子进化机制等,重点是血液系统癌症;4.基于单细胞技术的生殖健康和液体活检应用研究,开展优生优育理论和应用研究,如无创产前诊断/筛查(NIPD)、植入前胚胎的遗传检测(PGD/PGS)新技术研究;也开展基于稀有细胞如(CTC)和血液无细胞DNA(cfDNA或ctDNA)开展癌症临床应用技术研究;5.组学大数据的生物信息学平台建设和研究,包括建立可靠的单细胞测序数据分析实用流程,并创建多维数据新数学算法和模型。作为单细胞组学技术领域最早期的开拓性研究者之一,我们以往的研究对单细胞测序领域的发展起了推动作用。共发表研究论文90多篇,具有多项自主知识产权专利。多次在美国等国际专业学术会议上发表大会报告、主持及组织会议,担任本行国际知名杂志编委、主编或外审专家(如Nature Protocols)等,评审英国医学研究会、比利时癌症基金会研究基金项目。
个人荣誉  近年研究成果:1. 单细胞基因组学方面:作为MSI公司基因组学部的研究员和酶学主任,完成了全基因组扩增(WGA)的MDA(多重置换扩增)技术试剂REPLIg研制定型(2004年转让给Qiagen公司)。其后改进了该技术以用于单细胞分析,发表高特异全基因组扩增技术(WPA)( PMID: **)。REPLIg试剂是单细胞全基因组扩增中应用最广(见PMID: **; PMID: **; PMID: **)。2. 单细胞转录组学方面:创建了单细胞全长转录组测序的PMA和SMA技术(PNAS 2013, PMID:**)。PMA技术是基于MDA原理的RNA测序技术,是本领域三大类单细胞RNA扩增测序技术(包括PCR、IVT、或MDA)之一的代表 (见评论如PMID:**;PMID:**; PMID:**; PMID: **; PMID: **; PMID: **)。该论文被Illuminate 在2014-12-16发表的白皮书式测序文献“Single Cell Sequencing”(Pub. No. 770-2014-047) 5次引用。3. 单细胞多元整合测序方面:设计和主持建立了基于微流体的单细胞DNA和RNA二元整合测序技术(PMID:**),是国际上同类技术的首创者,和其后同类研究成果一起,开拓了全基因组水平筛查多重指标“单细胞多组学”的新领域(见PMID: **; PMID: **等)。 4. 单细胞端粒研究:设计和主持了首个端粒长度单细胞直接分析的技术SCT-pqPCR (PNAS 2013, PMID: **),获得Nature Reviews Genetics (2013年14:444)重点介绍,并获得PNAS 采访报道: New ruler for telomere length, May 10, 2013),在T细胞、干细胞、癌症、生殖细胞等领域的研究应用。5. 单细胞表观组学:建立不依赖Bisulfite的单细胞CpG甲基化岛(CGI)测序技术,首次把单细胞CGI的覆盖面从20%提高到70%以上的水平(PMID: **)。部分在国际大会报告,获得美国<遗传工程和生物技术新闻>(GEN)的采访(2015年8月17日在其“Exclusive News独家报道”)6. 癌症和干细胞单细胞测序的理论及应用研究:正在开展单细胞测序等技术在癌症和干细胞及发育等方面的基础和应用研究,初步研究成果如(NAR 2017,PMID: **; Oncogene 2017, PMID: **等),并获得2017年国家自然基金资助将进一步深化研究。
学术专著   1. Pan X, Wu S, Weissman S. Single Cell Genomics: Technology and Application (Research Topic and e-book, partially published as paper in Frontiers series of journals), invited by Frontiers. http://journal.frontiersin.org/researchtopic/4004/single-cell-genomics-technology-and-application2.Pan X, Urban AE and Weissman SM. Chapter 20: Enriching DNA sequencing with nucleotide variation by thymidine glycosylase combined with suppression PCR. In: PCR Technology: Current Innovations (3rd Edition), edited by Tania Nolan and Stephen A. Bustin, CRC Press. June 17, 2013. pp. 285-297 (total 475 pages). ISBN **50.
代表性论文论文标题期刊名称影响因子
Next-generation molecular diagnosis: single-cell sequencing from bench to bedsideCell Mol Life Sci5.763
Single-Cell Sequencing for Precise Cancer Research: Progress and ProspectsCancer Res 9.122
Evolution and heterogeneity of non-hereditary colorectalcancer revealed by single-cellexome sequencingOncogene7.519
Single cell transcriptomics reveals unanticipated features of early hematopoietic precursorsNucleic Acid Research 10
Bisulfite-independent analysis of CpG island methylation enables genome-scale stratification of single cells Nucleic Acid Research10
在研课题课题名称课题级别经费(万元)
广东省单细胞技术与应用重点实验室项目省级80
广东省(科技厅)“珠江人才计划”本土创新科研团队-慢性肝病精准医学创新团队省级90
广东省产科重大疾病重点实验室开放课题项目省级10
急性髓性白血病干细胞的单细胞水平表观组动态改变和分子机制研究省级100
遗传学血液病新型蛋白质机器及标志物的筛选国家级90
基于单细胞水平多维组学整合测序对急性髓性白血病干细胞动态异质性及其克隆性演化的研究国家级50

招生信息导师类型:?学术型博导
分委员会:?基础医学与生物学学位评定分委员会
培养单位:?基础医学院
招生专业:?>>
在读研究生人数:?硕士()博士()在职博士()
申招研究生名额:?硕士()博士()在职博士()
研究生论文盲审通过率:?硕士(%)博士(%)
培养研究生论文获奖情况:?

培养研究生其他获奖情况:?

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