厦门大学教育研究院（厦门大学高等教育科学研究所）于1978年5月17日建立，原名厦门大学高等教育科学研究室， 1984年2月经教育部批准改为厦门大学高等教育科学研究所，2004年4月6日改为现名。它是中国第一个以高等教育学为研究对象的专门研究机构，拥有中国第一个高等教育学硕士学位授权学科（1984）和第一个高等教育学博士学位授权学科（1986），潘懋元教授成为中国第一位高等教育学的博士生导师（1986）；它拥有中国第一个高等教育学国家重点学科（1988）、中国唯一的高等教育学国家“211工程”重点学科（1996）、中国唯一的高等教育研究的教育部人文社科重点研究基地——厦门大学高等教育发展研究中心（2000）和中国唯一的高等教育研究的国家“985工程”创新基地（2004）。

　　厦门大学教育研究院将秉持厦大“自强不息 止于至善”的校训，以繁荣中国高等教育、创新中国高等教育理论研究为己任，继往开来，继续保持中国高等教育研究的领先地位。