集美大学生物工程学院成立于2001年2月，由创办于1972年的食品工程系组建而成。三十几年来，共培养各类毕业生3500余人。现设有食品科学与工程、生物工程、环境工程三个本科专业，食品科学、微生物学、农产品加工与贮藏、食品加工与安全、食品工程五个硕士学位授予点。2010年9月全日制在校本科学生1081人，全日制在校研究生73人。

　　学院现设有化学教研室、食品科学与工程教研室、生物工程教研室、环境工程教研室；集美大学食品与生物工程研究所集美大学环境工程研究所；厦门市食品生物工程技术研究中心、厦门市食品科技研发检测中心； 福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室、福建省高校食品微生物与酶工程研究中心、生命科学基础实验中心和食品与生物工程综合实验室。

　　学院现有专任教师68人，省级教学团队1个，专任教师中教授11人，副教授31人；具有博士学位31人，具有硕士学位26人；专任教师中高级职称教师占教师比例61.8％，具有博士学位教师占45.6％，具有研究生学历教师占83.8％。已建立了一支职称结构、学历结构层次较高，专业知识结构符合要求，年龄结构较为理想，综合素质较好的师资队伍。

　　近年来，学院已先后承担了多项国家自然科学基金、国家科技部攻关、国家863、福建省科技计划、厦门市科技计划项目等的科学研究，取得了一批具有较高学术价值、应用价值的科研成果，并逐渐在水产品加工及其基础研究、农副产品保鲜与加工及综合利用、食品发酵工程、食品安全检测技术、海洋生理活性物质资源开发等方面形成了一定的优势与研究特色。

　　学院综合实验总面积1.1万平方米，现有教学、科研仪器设备总价值约3500万元，设备总数2200台(套)，其中，10万元以上大型仪器设备38台/套。拥有较好的教学、科研及实验条件。