航海学院源于华侨领袖陈嘉庚先生1920年创办的集美航海教育，90多年来，学院弘扬嘉庚精神，秉承诚毅校训，办学成绩显著，在国内以及东南亚地区颇具影响，被誉为“航海家的摇篮”。

　　学院设有航海教研室、船艺教研室、船舶管理教研室、航运管理教研室和物流管理教研室等 5 个教研室，航海技术实验室、通导实验室和水上训练中心等 3 个实验室。设有航海技术研究所、现代物流研究中心、海商海事研究所、船舶助航技术研究所和海上交通安全研究所等，承担国家自然科学基金资助项目、国家社会科学基金资助项目、福建省科技重点项目、省自然科学基金项目、服务海西重点建设项目等科研项目的研究工作。学院注重“双师型”的专业教师队伍建设，通过培养和引进，不断提高教师的学历学位等级与实船工作能力，形成了一支结构合理、富有团队精神和创新能力的师资队伍。现有专任教师80人，实验人员28人；专任教师中教授11人、副教授25人，具有博士学位的11人；实验人员中高级实验师12人。学院目前有交通运输工程一级学科硕士点1个，交通信息工程及控制等3个二级学科硕士学位点及交通运输工程领域专业学位一个，学院交通运输学科是福建省2008-2015年唯一新增博士学位授予单位的支撑学科之一，共有交通信息工程与控制系统、海上交通信息系统、载运工具运用工程、交通（物流）规划与管理等四个研究方向。

　　学院拥有国内先进的航海雷达模拟器、大型船舶操纵模拟器、 GMDSS 模拟器和水上训练中心，实验室总面积约为6000平方米，实验设备总资产3500多万元。通过校企合作的方式，建立了稳定的海上实习基地（四艘4-8万吨级实习船：华光、清华山、玉龙山、昆仑山）。 学院拥有国家级实验教学示范中心建设单位一个及福建省船舶与海洋工程重点实验室一个。

　　学院设有航海技术、交通运输（国际航运管理方向）、物流管理三个本科专业和“交通信息工程及控制”硕士点，全日制在校生2000多人。航海技术专业国家级高等学校特色专业建设点，以培养专业思想稳定、纪律严明、踏实肯干并具有较强的岗位适应能力的高级航海技术人才为主要目标，学生实行半军事化管理。交通运输专业（国际航运管理方向）依托航海技术专业的办学优势，立足航运，侧重国际航运管理，培养能胜任港航企事业单位管理的高级应用型人才。物流管理专业顺应物流业快速发展的需求，培养能胜任现代物流管理的高级应用型人才。